PDLIM2对前列腺癌预后影响的生物信息学分析

目的应用生物信息学技术分析PDLIM2对前列腺癌（PCa）预后的影响，并深度挖掘其基因功能。方法利用UCSCXena数据库下载癌症基因组图谱PCa数据，分析并验证PCa组织与癌旁正常组织中PDLIM2表达差异，比较PDLIM高、低表达组患者总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）。利用LinkedOmics数据库对PDLIM2共表达基因进行基因本体富集分析，利用相关数据库基因模块分析PDLIM2与肿瘤免疫细胞浸润程度、肿瘤突变负荷（TMB）、微卫星不稳定性（MSI）、免疫检查点（ICP）基因表达及肿瘤干性评分的相关性。结果与癌旁正常组织相比，PCa组织中PDLIM2mRNA表达水平较低（P＜0.05），而PDLIM2启动子区域甲基化水平较高（P＜0.05）；且PCa组织中PDLIM2mRNA表达水平与Gleason评分、分子分型均有关（均P＜0.05）。生存分析显示，PDLIM2高表达者PFS明显短于PDLIM2低表达者（P＜0.05）；而PDLIM2高、低表达者OS比较，差异无统计学意义（P＞0.05）。PDLIM2mRNA表达与TSPAN4、LGALS1、GAS6、GYPC、LYL1等12198个基因均呈正相关（均P＜0.05），与SMARCC1、HOOK1、ZNF24、DNAJC16、FOXA1等7852个基因均呈负相关（均P＜0.05）。与PDLIM2相关的基因主要富集在胶原代谢过程、整合素介导的信号通路、体液免疫反应、白细胞迁移、IFN-γ产生、急性炎症反应、血管生成等生物学过程。PCa组织中PDLIM2mRNA表达水平与肿瘤免疫细胞浸润程度、TMB、MSI、38个ICP基因表达及肿瘤干性评分均呈正相关（均P＜0.05）。结论PDLIM2可能成为评估PCa预后的生物学标志物和肿瘤免疫治疗的新靶点。