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| 荧光定量PCR方法快速检测人博卡病毒的研究 | |
| 引用本文： | 邹丽容,郑夔,周杰,莫艳玲,方苓,陈秋霞,李晖,柯昌文. 荧光定量PCR方法快速检测人博卡病毒的研究[J]. 华南预防医学, 2009, 35(6): 16-19 |
| 作者姓名： | 邹丽容 郑夔 周杰 莫艳玲 方苓 陈秋霞 李晖 柯昌文 |
| 作者单位： | 广东省疾病预防控制中心,WHO新发传染病监测培训合作中心,广东广州,510300;广东出入境检验榆疫局 |
| 摘 要： | 目的建立特异、快速、灵敏的、用于人博卡病毒核酸检测的荧光定量PCR方法。方法对博卡病毒的ns1基因应用Clustal W软件进行序列同源性比对,在保守区设计特异性引物和TaqMan探针,并对荧光PCR反应条件进行优化,验证方法的特异性,并将该方法与国际上通用的针对人博卡病毒ns1基因和np基因的普通PCR方法进行灵敏度比对;同时将该方法应用于疑似患者临床标本检测。结果该方法针对ns1基因进行扩增,对人博卡病毒核酸检测有高度特异性,与副流感1、2、3型,甲型、乙型流感病毒,呼吸道合胞病毒,腺病毒,冠状病毒229E、OC43,偏肺病毒以及鼻病毒等均无交叉反应。检测的灵敏度均比国际上通用的扩增ns1基因及np基因的PCR方法高10倍。用该方法从144份急性上呼吸道感染患者咽拭标本中检出了2份博卡病毒阳性,从病毒核酸提取至检测完成仅需3 h左右;用普通PCR仅能检出1份阳性标本,且耗时需5 h左右。结论该研究建立的TaqMan荧光定量PCR是一种快速检测人博卡病毒特异、敏感的方法,适用于临床早期诊断。 |
| 关 键 词： | 人博卡病毒 荧光定量PCR TaqMan探针 |
Real-time PCR assay for quick detection of human bocavirus |
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| ZOU Li-rong,ZHENG Kui,ZHOU Jie,et al.. Real-time PCR assay for quick detection of human bocavirus[J]. South China JOurnal of Preventive Medicine, 2009, 35(6): 16-19 | |
| Authors: | ZOU Li-rong ZHENG Kui ZHOU Jie et al. |
| Affiliation: | ZOU Li-rong*,ZHENG Kui,ZHOU Jie,et al.*Center for Disease Control and Prevention of Guangdong Province,Guangzhou 510300,China |
| Abstract: | Objective To establish a TaqMan-based real-time PCR assay for detection of human bocavirus.Methods Gene sequences of human bocavirus downloaded from the genbank were aligned using the biologic software.Specific primers and probes were designed in the conserved region of the ns1 gene for human bocavirus.The PCR reactive condition was optimized to improve the sensitivity and specificity of the assay.Clinical specimens collected from the patients were detected by this assay.Results The specificity of the assay... |
| Keywords: | Human bocavirus Real-time PCR TaqMan probe |
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