3例胎儿染色体非整倍体无创产前筛查假阴性病例分析

摘要：目的?对3例无创产前筛查(non-invasive prenatal screening, NIPS)诊断为假阴性的病例进行分析，分析假阴性发生原因，总结NIPS在临床应用中的局限性。方法?对3例经染色体核型分析确诊为NIPS假阴性的样本行实验室质量控制；备份血浆、文库和白细胞样本采用飞行时间质谱检测进行混样排查；备份血浆分别使用Complete Genomics技术与Ion Torrent半导体测序平台复测；提高测序深度行扩展性无创产前筛查(NIPS-Plus)检测；备份母体白细胞及胎盘样本行低深度全基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测。结果?3例样本文库和白细胞来源一致，未发生混样；备份血浆经原平台复测、更换半导体测序平台及NIPS-Plus检测后，3例病例均仍为低风险；备份白细胞未发现有1 M以上的缺失/重复；样本2胎盘胶囊制品经CNVs检测提示存在24%～25%的chr21三体嵌合。结论?提高测序深度及更换不同检测平台未能避免假阴性。胎儿游离DNA浓度低、胎盘低比例嵌合是样本2发生假阴性的主要原因。