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脓毒症潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测
引用本文:杨梦霞,赵春铭,陈腾飞,徐霄龙,刘清泉.脓毒症潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测[J].中国急救医学,2024(3):233-238.
作者姓名:杨梦霞  赵春铭  陈腾飞  徐霄龙  刘清泉
作者单位:1. 首都医科大学附属北京中医医院;2. 北京中医药大学研究生院;3. 首都医科大学中医脓毒症临床诊疗与研究中心
摘    要:目的 通过生物信息学方法筛选并分析与脓毒症相关的差异表达基因及关键(Hub)基因,以期为临床诊疗提供潜在靶点和生物标志物。方法 使用基因表达综合数据库(GEO)筛选脓毒症基因表达数据集,运用GEO自带在线分析工具(GEO2R)分析差异表达基因(DEGs);并结合STRING 12.0和DAVID数据库对DEGs进行富集分析;再通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出Hub基因,并对其进行功能分析。结果 筛选出328个DEGs,其中上调基因2个,下调基因326个。富集结果显示,DEGs的功能主要与蛋白质修饰、分解代谢、蛋白酶复合物、线粒体及酶活性等有关。通过CytoHubba插件筛选出了核因子κB亚基1(NFKB1)、NEDD8、人NADH-泛醌氧化还原酶A8(NDUFA8)、POLR2F、延伸蛋白B(ELOB)、PSMB6、SEC61A1、COX4I1、人NADH-泛醌氧化还原酶B8(NDUFB8)及ATP5PD 10个Hub基因,经生物过程(BP)可视化发现这些Hub基因在生物过程中相互作用。结论 NFKB1、NEDD8、NDUFA8、POLR2F、ELOB、PSMB6、SEC6...

关 键 词:脓毒症  生物信息学分析  差异表达基因(DEGs)  Hub基因  生物标志物
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