| 华支睾吸虫乳酸脱氢酶(CsLDH)基因的识别及其结构与功能分析 |
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| 引用本文： | 胡旭初,徐劲,吕刚,黄灿,余新炳.华支睾吸虫乳酸脱氢酶(CsLDH)基因的识别及其结构与功能分析[J].热带医学杂志,2007,7(12):1145-1148,F0002. |
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| 作者姓名： | 胡旭初 徐劲 吕刚 黄灿 余新炳 |
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| 作者单位： | 1. 中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州,510080
2. 中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州,510080;海南医学院寄生虫学教研室,海口,571101 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划);广东省重大科技专项基金 |
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| 摘 要： | 目的分析华支睾吸虫乳酸脱氢酶基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究。方法利用多种生物信息在线分析工具和分析软件包,从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库的表达序列标签(EST)中识别乳酸脱氢酶(CsLDH)基因,预测该基因编码蛋白质的理化特性、氨基酸修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维结构及酶学特性和免疫学特性等。结果该基因全长1224bp,编码区为79～1062,编码328aa,理论分子量为35633Mr,等电点为8.13,半衰期长,理化性质稳定,含有多个潜在的磷酸化和酯酰化位点。预测该蛋白有3个跨膜区,其拓扑结构为N端在膜内侧、C端在膜外侧。有两个主要的线性抗原表位aa10～aa20和aa94～aa102,后者位于膜外,与日本血吸虫LDH相应表位完全一致,与人和小鼠LDH相应表位仅有1个氨基酸差异。该表位中Arg102是酶催化中心的关键氨基酸之一,模拟三维结构显示组成催化中心的另外两个关键氨基酸残基Asp162和His189的空间位置也靠近该表位,酶的催化中心贯穿膜内外。结论推测华支睾吸虫乳酸脱氢酶不仅负责将糖酵解产生的丙酮酸转化为乳酸,而且还能将乳酸直接排出体外;可作为筛选水溶性抗华支睾吸虫药物的靶标;可介导特异性抗体对虫体的ADCC作用和补体的杀伤作用,以及对酶活性的抑制作用,是一个重要的疫苗侯选抗原。
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| 关 键 词： | 华支睾吸虫 乳酸脱氢酶 结构与功能 生物信息学 |
| 文章编号： | 1672-3619（2007）12-1145-04 |
| 收稿时间： | 2007-08-05 |
| 修稿时间： | 2007-09-27 |
Bioinformatics Analyze the Structure and Characteristics of the Gene and Protein of Clonorchis sinensis Lactate Dehydrogenase |
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| HU Xu-chu,XU Jing,LU Gang,HUANG Can,YU Xin-bing.Bioinformatics Analyze the Structure and Characteristics of the Gene and Protein of Clonorchis sinensis Lactate Dehydrogenase[J].Journal Of Tropical Medicine,2007,7(12):1145-1148,F0002. |
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| Authors: | HU Xu-chu XU Jing LU Gang HUANG Can YU Xin-bing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Clonorchis sinensis lactate dehydrogenase structure and function bioinformatics |
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