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基于数据库对子宫肌瘤和子宫肉瘤诊治的关键基因进行生物信息学分析
作者姓名:储云鹏  蔡伟  孟博
作者单位:无锡市中医医院检验科
摘    要:目的 探讨子宫肌瘤和子宫肉瘤发生发展的相关基因。方法 从GEO数据库下载芯片数据集GSE31699、GSE593、GSE64763、GSE68295,在R语言中分别分析子宫肌瘤瘤组织与正常子宫肌层的差异表达基因(differentially expressed gene, DEGs),子宫肉瘤癌组织与正常子宫肌层的DEGs。使用DAVID数据库对DEGs进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,并在STRING网站进行蛋白网络分析,通过Cytoscape软件分别筛选出关键基因,基于TCGA和GTEx数据库验证DEGs在子宫肉瘤中的表达和诊断效能。结果 筛选到子宫肌瘤瘤组织与正常子宫肌层的DEGs 45个,其主要参与雌激素激活信号通路;获得子宫肉瘤癌组织与正常子宫肌层的DEGs 104个,其主要参与细胞周期信号通路。获得子宫肌瘤瘤组织和子宫肉瘤癌组织共同表达的DEGs 5个,差异表达的DEGs 7个。在子宫肉瘤癌组织和正常子宫肌层中这12个DEGs的表...

关 键 词:子宫肌瘤  子宫肉瘤  数据库  生物信息学
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