基于基因组学数据分析构建肾上腺皮质癌预后模型 |
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引用本文: | 朱菡,方小满.基于基因组学数据分析构建肾上腺皮质癌预后模型[J].成都医学院学报,2021,16(2):221-225. |
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作者姓名: | 朱菡 方小满 |
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作者单位: | 重庆市大足区人民医院肾内科 重庆402360 |
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基金项目: | 重庆市卫生健康委员会和重庆市科学技术局联合医学科研项目 |
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摘 要: | 目的 通过对基因组学数据进行分析,筛选肾上腺皮质癌(ACC)预后相关独立危险因素,并构建ACC预后相关的列线图模型.方法 从GEO数据库下载GSE10927数据集数据,利用一系列生物信息学方法,对GSE10927数据集进行处理、分析,并筛选差异基因.通过单因素与多因素的Cox回归分析,筛选与ACC患者预后相关的独立危险因素.使用GEPIA在线分析工具及TCGA数据库数据对上述发现的独立危险因素进行验证.最后,通过R软件构建和验证ACC预后相关列线图模型.结果 从GSE10927数据集中获得12个仅在ACC患者中明显差异表达的基因.经过单因素与多因素的Cox回归分析表明,CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1可作为ACC患者的预后相关独立危险因素.经过GEPIA在线分析工具及TCGA数据库数据的验证,再次证实CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1可作为ACC患者的预后相关独立危险因素.利用上述独立危险因素构建列线图模型,该模型对ACC患者1、3、5年生存率预测性能的AUC值分别为0.83,95%CI(0.68~0.99)]、0.89,95%CI(0.82~0.96)]、0.81,95%CI(0.69~0.92)].结论 CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1基因是ACC患者预后相关的独立危险因素,同时有望成为ACC靶向治疗的新靶标.本研究基于基因组学数据分析所构建的列线图模型,可有效预测ACC患者1、3、5年的生存状况.
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关 键 词: | 肾上腺皮质癌 基因组学 列线图 预后模型 |
Construction of Prognosis Model of Adrenocortical Carcinoma Based on Genomic Data Analysis |
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Authors: | Zhu Han Fang Xiaoman |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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