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2013~2014年杭州地区手足口病柯萨奇病毒A6型和A10型VP1基因特征分析
引用本文:谢国良,崔大伟,郑书发,杨先知,余斐,陈瑜. 2013~2014年杭州地区手足口病柯萨奇病毒A6型和A10型VP1基因特征分析[J]. 临床检验杂志, 2015, 0(12): 938-941
作者姓名:谢国良  崔大伟  郑书发  杨先知  余斐  陈瑜
作者单位:浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,杭州 310003
基金项目:“十二五”国家科技重大专项(2012ZX10004 210)。
摘    要:目的了解2013~2014年杭州地区手足口病病原谱的分布,并对其病原基因特征进行分析。方法采集2013年3月至2014年4月手足口病患儿标本1 340例,提取病毒核酸,通过逆转录和PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对柯萨奇病毒A6型(CA-A6)和A10型(CA-A10)VP1全长序列进行同源性比对分析,并构建系统进化树。结果1 340例手足口病患儿标本中,肠道病毒检出阳性率为81.43%(1 090/1 340)。其中,CV-A6阳性率为41.04%,取代EV-71(14.48%)成为杭州地区检出阳性率最高的肠道病毒;CV-A10检出率(8.51%)也高于CV-A16(3.81%),列于第三位。同源性比对及系统进化分析显示,2013~2014年的25株CV-A6病毒核苷酸同源性为89.0%~99.7%,主要分布于G、H基因亚型;15株CV-A10病毒核苷酸同源性为95.3%~99.9%,分布于F、G基因亚型。结论 2013~2014年杭州地区儿童手足口病的主要病原体发生重大变化,CV-A6病毒成为最主要病原,CV-A10病毒也存在潜在威胁,需加强对其他肠道病毒的持续监测和分子特征分析。

关 键 词:手足口病;柯萨奇病毒A6型;柯萨奇病毒A10型;VP1基因;基因特征
收稿时间:2015-10-21

Genetic characteristics of VP1 of Coxsackie virus A6 and A10 associated with hand foot and mouth disease from 2013 to 2014 in Hangzhou region
Abstract:
Keywords:hand-foot and mouth disease   Coxsackie virus A6   Coxsackie virus A10  VP1 gene   genetic characteristics
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