基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型 |
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作者姓名: | 胡玉莲 齐健 王姝洁 洪波 孙晓君 王宏志 聂金福 |
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作者单位: | 1. 中国科学技术大学生命科学学院;2. 中国科学院广州生物医药与健康研究院;3. 中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所医学物理与技术安徽省重点实验室;4. 中国科学院合肥肿瘤医院检验科 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:81872438); |
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摘 要: | 目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定量仪检测cfDNA浓度;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测cfDNA的H4C6甲基化水平;使用Logistic回归算法构建H4C6甲基化水平联合cfDNA浓度的癌症风险预测模型;使用受试者工作特征(ROC)曲线和校准曲线评估模型的准确性;使用决策曲线分析(DCA)评估模型的临床效益。结果 联合H4C6甲基化水平与cfDNA浓度构建的模型区分肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、泛癌与健康组的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.769、0.988、0.934、0.922、0.830;校准曲线的平均绝对误差小于0.05;DCA曲线的净收益大于0。结论 基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建的癌症风险预测模型有较好的预测性能,有助于给临床前决策提供合理且有效的建议,最终可能给患者提供有针对性的、个性化的癌症检测与诊断方案。
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关 键 词: | H4C6甲基化水平 cfDNA浓度 癌症风险预测 |
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