基于高通量测序技术的胰腺癌环状RNA差异表达谱分析 |
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引用本文: | 付晓伟,欧阳永灏,洪乐,孙根,辛万鹏,易思清,肖卫东.基于高通量测序技术的胰腺癌环状RNA差异表达谱分析[J].安徽医科大学学报,2023(1):101-108. |
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作者姓名: | 付晓伟 欧阳永灏 洪乐 孙根 辛万鹏 易思清 肖卫东 |
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作者单位: | 南昌大学第一附属医院普外科 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:81860418);;江西省自然科学基金重点项目(编号:20202ACB206007); |
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摘 要: | 目的 筛查胰腺癌组织环状RNA(circRNA)差异表达谱并初步分析其潜在功能。方法 随机选取4对胰腺癌组织和对应癌旁胰腺组织标本进行高通量测序,按表达量差异倍数>2且P<0.05为筛选标准,筛选差异表达的circRNA。qRT-PCR检测随机选取的5个差异表达的circRNA在20对胰腺癌组织标本中的表达,对测序结果进行验证。对差异表达的circRNA进行GO和KEGG富集分析,并构建top50 circRNA-microRNA互作网络图。进一步分析hsa_circ_0046523与胰腺癌临床病理特征的关系,并通过敲减试验观察其对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。结果 高通量测序共预测出17 182个circRNA,在胰腺癌组织中差异表达的circRNA有302个,其中137个表达上调,165个表达下调。qRT-PCR结果显示,与癌旁组织相比,胰腺癌组织中has_circ_0046523、hsa_circ_0004220和hsa_circ_0000690表达水平上调(P<0.05),hsa_circ_0008676和hsa_circ_0004416表达水平下调(...
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关 键 词: | 环状RNA 胰腺癌 表达谱 增殖 迁移 侵袭 |
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