一起引发脑膜炎流行的ECHO病毒的序列分析

目的 测定山东省招远县1987年2－8月发生的无菌性脑膜炎大流行的病因病毒之W株病毒（Zhaoyuan/W/87）的部分序列，分析其与其他肠道病毒的关系。方法 病毒用酚－氯仿抽提RNA，经逆转录合成cDNA，经聚合酶链反应（PCR）扩增，产物纯化，采用双脱氧链末端终止法在AB1377自动核酸测序仪上测定序列。结果 W株5′端非区、2C和3D区的部分序列长度分别为244、275和353个核苷酸；VP1区全基因为876个核苷酸，编码292个氨基酸，与检索到的2株ECH029核苷酸序列的同源性分别为82．1％和81．7％，氨基酸序列的同源性分别为95．1％和94．4％，与检索到的1株ECH02核革苷酸序列的同源性为62．3％。种系发生树分析，W株在单独的一个分支上，与2株ECH029所在分支较近，与ECHO2所在分歧较远。结论 目前无法判定W株与ECHO2的关系，但可以说W株是ECHO029的变异味。

Nucelotide sequence of an ECHO virus isolated from a meningitis patient