低级别胶质瘤自噬相关基因预后分类器的构建及验证 |
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引用本文: | 李国俊,刘妲,李永事,邓仕凤,李会兵,山常国,金鑫.低级别胶质瘤自噬相关基因预后分类器的构建及验证[J].临床神经外科杂志,2024(1):23-30+37. |
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作者姓名: | 李国俊 刘妲 李永事 邓仕凤 李会兵 山常国 金鑫 |
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作者单位: | 1. 广东三九脑科医院神经外科;2. 广东三九脑科医院肿瘤科 |
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基金项目: | 广东省医学科学技术研究基金项目(A2022539); |
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摘 要: | 目的 本研究旨在构建自噬相关基因(ARGs)的风险分类器,从而预测低级别胶质瘤(LGG)患者的生存率。方法 从UCSC Xena, CGGA, GlioVis和GTEx公共数据库中获取LGG患者和正常脑组织数据,结合人类自噬数据库筛选出232个ARGs。通过差异分析得到差异ARGs。在训练集中,利用单因素Cox回归分析和LASSO回归分析,构建ARGs的预后分类器。通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线确定最佳Cut-off值。Kaplan-Meier生存曲线和ROC曲线下面积(AUC)用于评估分类器性能,并在内部数据集和外部数据集中验证。Cox回归分析用于评估分类器的独立预后价值。最后,结合常见临床参数和风险分类用于构建列线图模型,并利用ROC曲线,一致性指数和校准曲线评估该模型的预测能力。结果 本研究构建了由6个ARGs(BAG1、 PTK6、 EEF2、 PEA15、 ITGA6和MAP1LC3C)的预后风险分类器,其可将LGG患者分为具有明显生存差异的高、低风险组在多个数据集(均P<0.05)。5年AUC值显示该分类器在训练集,内部验证集和TCGA总集中分别为0.837, ...
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关 键 词: | 低级别胶质瘤 自噬相关基因 预后分类器 临床意义 |
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