首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

灵芝精氨酸甲基转移酶基因鉴定及表达分析
引用本文:查良平,刘爽,赵玉洋,袁媛,黄璐琦. 灵芝精氨酸甲基转移酶基因鉴定及表达分析[J]. 中国实验方剂学杂志, 2016, 22(15): 28-32
作者姓名:查良平  刘爽  赵玉洋  袁媛  黄璐琦
作者单位:成都中医药大学药学院, 成都 611137;中国中医科学院中药资源中心, 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700,中国中医科学院中药资源中心, 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700;北京中医药大学中药学院, 北京 100102,中国中医科学院中药资源中心, 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700,中国中医科学院中药资源中心, 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700,中国中医科学院中药资源中心, 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700
基金项目:国家杰出青年科学基金项目(81325023);国家高技术研究发展计划(863计划)项目(SS2014AA022201)
摘    要:目的:在灵芝转录组基础上,对灵芝蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析。方法:利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM分析灵芝不同生长时期GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量。结果:GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的开放阅读框且为全长,而GLPRMT3不为全长互补脱氧核糖核酸;GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3都具有蛋白质精氨酸甲基转移酶最保守的Ado Met-MTases结构域;GLPRMT1,GLPRMT2,GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族,PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1和GLPRMT3,且3个蛋白质精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势。结论:本研究结果为揭示灵芝的表观调控机制提供理论基础。

关 键 词:灵芝  组蛋白甲基化  蛋白质精氨酸甲基化转移酶  生物信息学  基因鉴定
收稿时间:2015-12-21

Identification and Expression Analysis of Arginine Methyltransferase Genes in Ganoderma
ZHA Liang-ping,LIU Shuang,ZHAO Yu-yang,YUAN Yuan and HUANG Lu-qi. Identification and Expression Analysis of Arginine Methyltransferase Genes in Ganoderma[J]. China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae, 2016, 22(15): 28-32
Authors:ZHA Liang-ping  LIU Shuang  ZHAO Yu-yang  YUAN Yuan  HUANG Lu-qi
Affiliation:College of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine,Chengdu 611137,China;State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China,State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;School of Chinese Materia Medica, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 100102, China,State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China,State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China and State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China
Abstract:
Keywords:Ganoderma  histone methylation  protein arginine methyltransferases  bioinformatics  gene identification
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
点击此处可从《中国实验方剂学杂志》浏览原始摘要信息
点击此处可从《中国实验方剂学杂志》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号