基于二代测序技术的转录组测序生物信息分析 |
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引用本文: | 汤冬,张国森,赵晓芳. 基于二代测序技术的转录组测序生物信息分析[J]. 河南大学学报(医学版), 2019, 38(1): 67-76 |
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作者姓名: | 汤冬 张国森 赵晓芳 |
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作者单位: | 江苏苏博生物医学股份有限公司,江苏宿迁,223800;河南大学基础医学院医学生物信息学研究所细胞信号转导实验室,河南开封,475004 |
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摘 要: | 随着二代测序技术和生物信息学的发展,越来越多的科研人员通过转录组测序(RNAseq)研究基因表达调控、疾病发生机制和遗传育种上的问题。面对测序所产生的大量数据,生物信息学分析策略对于数据的解读显得尤为重要。本文结合不同RNA(mRNA、LncRNA、miRNA和circRNA)的特点,对转录组测序中的几类分析流程及其所涉及的软件和数据库分别做简要的介绍,为RNAseq的生信分析研究提供参考。
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关 键 词: | 二代测序 转录组 测序 生物信息 |
Bioinformatics analysis of transcriptome sequencing based on next generation sequencing |
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