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基于系统药理学探讨草乌改善Ⅱ型糖尿病的分子机制
作者姓名:刘婷婷
基金项目:内蒙古自治区自然科学基金(2023QN08016、2019LH08017);内蒙古医科大学实验室开放基金项目(2022ZN23、2023LX02 );国家自然科学基金项目(82260733);内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY21593)
摘    要:目的 基于系统药理学、生物信息学、分子对接及体内外实验探讨草乌影响 2 型糖尿病(diabetes mellitus type 2, T2DM)的潜力及对 T2DM 相关症状的潜在机制。方法 利用数据库检索草乌相关化学成分、预测潜在作用靶点以及干预 相关疾病;GEO 数据库检索 T2DM 相对健康人的差异基因,与草乌作用靶点映射后置于 DAVIDavid 数据库进行生物功能 富集,利用单因素方差分析、二元 Logistic 回归分析及 ROC 曲线分析目标基因对于 T2DM 的敏感性。借助分子对接技术 分析草乌化学成分与靶蛋白的结合位置及相互作用力。通过体内外 T2DM 模型验证草乌及其化学成分对目标蛋白表达的 影响。 结果 通过数据库检索与分析得到草乌干预靶点相关疾病 44 种(P value<0.05,FDR<0.05),选取度值最高的 T2DM(Degree=22)进行分析。T2DM 相对健康人差异基因与草乌潜在作用靶点取交集得到 43 个目标基因,进行单因素方 差分析得到有显著性差异的基因共 9 个,二元 Logistic 回归分析得到 5 个有意义基因,ROC 曲线下面积 AUC>0.5 的基因 共 3 个。分子对接得到草乌化学成分(+)-Isoboldine 与蛋白 APEX1、CASP1、CBFB,Napelline 与蛋白 CBX1、EHMT2 结 合通过氢键相互作用、疏水相互作用、可电离性和静电相互作用等不同作用力结合,从而增加配体靶向作用蛋白的能力。 体内模型经草乌水提物治疗 2 周后,草乌可能通过改善周围神经病变进而缓解 T2DM 症状。并且草乌可以影响大鼠肝组织 中 APEX1、CASP1、CBFB、CBX1、EHMT2 的蛋白表达,草乌中(+)-Isoboldine 和 Napelline 化学成分对体外模型的目标蛋 白的影响与体内实验一致。结论 初步揭示草乌可作为改善 T2DM 周围神经病变的潜在治疗药物,为中蒙药研发以及挖掘 治疗 T2DM 新靶标药物奠定理论基础。

关 键 词:草乌  2 型糖尿病  系统药理学  生物信息学  分子对接  分子机制
收稿时间:2022-11-21
修稿时间:2024-01-31
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