基于生物信息学的变应性鼻炎易感基因筛选及潜在干预中药分析 |
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作者姓名: | 田心语 唐心浩 李梓墨 陈小宁 袁海洲 沙志荣 史军 |
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作者单位: | 南京中医药大学附属医院, 江苏 南京 210029;南京中医药大学第一临床医学院, 江苏 南京 210023;江苏省老龄事业发展研究会, 江苏 南京 210008;江汉大学医学部药学系, 湖北 武汉 430056;无锡市惠山区中医医院, 江苏 无锡 214000;启东市中医院, 江苏 南通 226200 |
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基金项目: | 江苏省卫生健康委员会重点项目(ZD2021016);江苏省中医药管理局“省名老中医陈小宁专家传承工作室”建设项目(苏中医科教 [2021]7号);国家级大学生创新训练计划项目(202210315128Z);南京中医药大学2022年“罗林秀杯”大学生创新训练项目;南京中医药大学2023年中医药人工智能“揭榜挂帅”项目 |
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摘 要: | 目的 利用多种广义生物信息学技术从遗传流行病学方向发掘变应性鼻炎易感基因,发扬中医药在变应性鼻炎疾病管理中的优势,助力于变应性鼻炎预防。方法 利用孟德尔随机化及汇总数据的孟德尔随机化分别获取蛋白质及基因表达水平遗传变异相关基因,取交集获取对遗传变异影响较大的变应性鼻炎易感基因,并利用基因集数据对其进行表达富集分析,探寻基因生物功能。利用共定位分析进一步筛选出关键变应性鼻炎易感基因,并对其进行可药性分析。同时利用分子对接及中药数据库筛选关键变应性鼻炎易感基因相关活性成分及潜在干预中药。结果 筛选出6个变应性鼻炎易感基因TLR1、NFKB1、TNFSF8、TAPBP、ITPKA、MAP1LC3A,其表达与Toll样受体、NOD样受体、吞噬细胞等免疫与炎症相关成分功能密切相关,同时参与激素的分解代谢。其中TLR1、ITPKA是关键变应性鼻炎易感基因且具有开发靶向药物潜力。活性成分中丙酸成分具有防治变应性鼻炎的潜力。通过靶点预测补益肺脾药是靶向关键变应性鼻炎易感基因主要潜在中药。而“肺脾同治,气阴同调”或是预防变应性鼻炎的中药配伍关键思路之一。结论 挖掘变应性鼻炎易感基因和潜在干预中药,为变应性鼻炎的研究提供了新的视角,实现遗传流行病学在变应性鼻炎领域的中医药临床转化。
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关 键 词: | 变应性鼻炎 全基因组关联研究 孟德尔随机化 虚拟药物筛选 肺脾同治 丙酸 槲皮素 红藻氨酸 |
收稿时间: | 2024-05-11 |
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