基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗糖尿病牙周炎的组方规律及作用机制 |
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作者姓名: | 李惠菁 郜然然 刘敏 魏静 何翔 吴也可 |
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作者单位: | 1. 成都中医药大学临床医学院, 四川 成都 610072;2. 河南省人民医院妇科,河南 郑州 450000;3.成都中医药大学附属医院妇科,四川 成都 610072;4. 成都中医药大学附属医院口腔科,四川 成都 610072 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目 (81973684);四川省自然科学基金项目(23NSFSC2574);成都中医药大学杏林学者青年进阶人才专项(QJJJ2023005)。 |
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摘 要: | 目的 挖掘中医药治疗糖尿病牙周炎 (diabetic periodontitis,DP) 的组方规律,并探讨核心药物组合的作用机制。方法 以中国知网、万方数据库、维普中文期刊、中国生物医学文献服务系统收录的中医药治疗 DP文献为资料来源,建立 DP 处方信息数据库,运用 Excel 2021、SPSS Modeler 18.0 和 SPSS Statistics 26.0,对纳入中药进行频次、功效分类、性味归经统计,并进行关联规则分析和聚类分析,筛选出核心药物组合;通过中药系统药理学数据库与分析平台 (TCMSP) 、HERB 获取核心药物组合的活性成分,预测药物作用靶点;运用GeneCards 预测疾病相关靶点;运用 Venny 平台得到疾病与药物的交集靶点;运用 Cytoscape 建立“活性成分-靶点”网络,筛选出关键成分;以 STRING 平台数据为基础,利用 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心靶点;通过 DAVID 数据库对交集靶点进行基因本体论 (GO) 和京都基因与基因组百科全书(KEGG) 富集分析;采用 AutoDockVina 对关键成分与核心靶点进行分子对接。结果 共纳入中医药治疗 DP 文献 36 篇,提取方剂 50 首,涉及药物 100 味;最常见的药物有泽泻、熟地黄、黄芪等,使用最多的药物类别为补虚药,药性以寒、温为主,药味以甘、苦味为主,归经以肾、肝经居多,系统聚类分析可归为 6 大类;筛选出牡丹皮-山茱萸-熟地黄为核心药物组合,涉及 18 个活性成分、164 个作用靶点,与 DP 有 104 个交集靶点;槲皮素、豆甾醇、山奈酚、β-谷甾醇、四氢鸭脚木碱、谷甾醇等为核心成分,AKT1、IL-6、TNF、IL-1B、PTGS2、JUN、TP53、ESR1、MMP9 等为关键靶点;GO 分析得到生物过程 3 724 项、细胞组成 228 项、分子功能 404 项;KEGG 分析显示主要涉及 235 条信号通路;分子对接显示关键靶点与核心成分具有良好亲和力。结论 DP 的中医治法主要以补虚为主,兼以清热利湿、活血化瘀、益气养阴,核心药物组合牡丹皮-山茱萸-熟地黄可通过多成分、多靶点、多通路治疗 DP,为临床诊疗提供参考。
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关 键 词: | 糖尿病牙周炎 组方规律 补虚 牡丹皮-山茱萸-熟地黄 作用机制 数据挖掘 网络药理学 分子对接 |
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