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基于胸部CT身体成分自动分析系统评估肌肉及脂肪含量
作者姓名:杨洁  刘艳丽  陈小燕  陈天乐  刘奇
作者单位:四川大学生物医学工程学院, 四川 成都 610065;承德医学院生物医学工程系, 河北 承德 067000;西南医科大学附属自贡医院(自贡市精神卫生中心) 内科, 四川 自贡 643020
基金项目:自贡市市级科技计划项目(2021YXY12)。
摘    要:目的 构建基于胸部CT的身体成分自动分析系统,观察其评估胸部肌肉及脂肪含量的价值。方法 收集108例肺炎患者T7~T8层面轴位胸部CT图像(分割数据集),于COVID 19-CT数据集筛选984例胸部CT数据(随机抽取10例为整体测试数据集,余974例为选层数据集);基于卷积神经网络(CNN)衍生网络,包括ResNet、ResNeXt、MobileNet、ShuffleNet、DenseNet、EfficientNet及ConvNeXt,于选层数据集中分类T7~T8层面,以准确率、精确率、召回率及特异度进行评价;基于经典全CNN(FCN)衍生网络,包括FCN、SegNet、UNet、Attention UNet、UNet++、nnUNet、UNeXt及CMUNeXt于分割数据集中分割骨骼肌(SM)、皮下脂肪组织(SAT)、肌间脂肪组织(IMAT)及内脏脂肪组织(VAT),以戴斯相似系数(DSC)、交并比(IoU)及95豪斯多夫距离(HD)进行评价;基于表现最优的选层网络及分层网络构建身体成分自动分析系统,对整体测试数据集进行测试,以平均绝对误差(MAE)、均方根误差(RMSE)及MAE的标准差(SD)进行评价。结果 DenseNet网络自动于完整胸部CT图中分类T7~T8层面的准确率、精确率、召回率及特异度分别为95.06%、84.83%、92.27%及95.78%,均高于其余选层网络。在分割SM、SAT、IMAT及整体分割方面,UNet++网络DSC及IoU均高于、而95HD均低于其余分割网络。以DenseNet为选层网络、UNet++为分割网络测试整体测试数据集,其预测SM、SAT、IMAT及VAT的MAE分别为27.09、6.95、6.65及3.35 cm2结论 基于胸部CT身体成分自动分析系统可用于评估胸部肌肉及脂肪含量;其中最佳分割网络UNet++分割脂肪组织精准度优于SM。

关 键 词:身体成分  胸部  肌,骨骼  脂肪组织  深度学习  体层摄影术,X线计算机
收稿时间:2024-03-13
修稿时间:2024-05-13
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