肝细胞癌外周血单个核细胞关键基因与治疗中药的生信分析及系统评价

目的 基于生物信息学的方法探索肝细胞癌外周血单个核细胞（HCC-PBMC）的关键基因和潜在的治疗中药，并通过系统评价进一步确认该药的临床疗效。方法 利用基因表达数据库（GEO）下载关于HCC-PBMC的芯片GSE58208和GSE36076。通过RStudio软件分析获得差异表达基因（DEGs）。利用STRING在线数据库进行蛋白-蛋白相互作用（PPI）分析，DAVID在线功能注释工具进行基因本体（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过Cytoscape软件对HCC-PBMC差异基因进行可视化，同时，利用CytoHubba插件计算出HCC-PBMC的关键基因。通过将关键基因与医学信息检索平台相互映射，筛选出治疗肝细胞癌（HCC）的潜在中药并纳入下一步的系统评价。结果 共得出203个DEGs（上调基因194个，下调基因9个）。经DAVID分析，可知这些DEGs主要富集的生物学过程和信号通路包括DNA模板转录调控、核糖核酸磷酸二酯键水解，核内裂解、核分裂的正调控、骨骼肌纤维发育、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）活性的激活、范可尼贫血途径、代谢途径。通过Cytoscape软件计算出HCC-PBMC的关键基因，分别是GTP酶IMAP家族成员1（GIMAP1），GTP酶IMAP家族成员4（GIMAP4），GTP酶IMAP家族成员6（GIMAP6），GTP酶IMAP家族成员7（GIMAP7），GTP酶IMAP家族成员8（GIMAP8），白细胞介素-1β（IL-1β），趋化因子（CX3C基元）受体1（CX3CR1），趋化因子（C-C基元）受体2（CCR2），Toll样受体7（TLR7），表皮生长因子（EGF）。经Coremine Medical分析得出人参、姜黄、积雪草、白花蛇舌草与关键基因关系较为密切，其中人参具有补益肺脾、增强气力功效，与HCC肝郁脾虚、气阴两虚证相符合，故将以人参为君药的四君子汤纳入系统评价。经过评价得出人参在提高临床总体疗效，改善患者中医证候及血清CD4⁺，CD4⁺/CD8⁺水平，降低患者血清CD8⁺，总胆红素（TBIL）水平方面均优于单纯西医治疗（P<0.01），且安全性高。结论 本研究基于基因层面展开分析，为临床工作者在诊断和治疗HCC方面提供了新思路，人参治疗HCC的系统评价为中医药临床防治HCC提供了依据。