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通过加权基因共表达网络构建结肠癌的预后风险标志物及其临床意义
作者姓名:李轶辉  彭浩  许玉春  郭蓉  龚维
作者单位:中国人民解放军联勤保障部队第九二一医院普通外科
基金项目:湖南省教育厅科学研究项目(20C1116);
摘    要:
目的 结肠癌(colon adenocarcinoma, COAD)患者预后较差。因此筛选结肠癌预后相关基因,建立结肠癌新的预后风险评估模型。方法 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)和基因表达综合(gene expression omnibus, GEO)数据库中结肠癌相关数据,分别作为训练集和验证集。采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、Cox回归模型结合最小绝对值选择与收缩算子(least absolute selection and shrinkage operator, LASSO)回归分析筛选结肠癌预后相关基因并构建预后模型,受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)结合生存曲线验证模型的准确性,并建立列线图。根据中位值将患者分为两组,免疫细胞阳性比例分数(immune cell proportion score, IPS)评估两组患者免疫治疗反应。结果 最终筛选出15个特征基因,以此建...

关 键 词:结肠癌  预后  转录组学  癌症基因组图谱  加权基因共表达网络
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