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目的获得三叉苦Melicope pteleifolia转录组信息特征。方法以三叉苦幼苗根、茎、叶混合样品为对象,采用二代高通量测序平台Illumina HiSeq~(TM) 2000进行转录组测序并进行系统的生物信息学分析。结果转录组测序分析共获得47 045 040条高质量序列(clean reads),Trinity de novo组装获得67 956条unigenes,平均长度787 nt。BLAST分析显示分别有42 749(61.92%)、31 152(45.84%)、26 563(39.0 9%)、17 481(25.72%)条unigenes在NR、Swiss-port、KOG、KEGG数据库得到注释信息,参与生物过程、细胞组分和分子功能3个GO类别的47个小组,共9807条unigenes注释到130个KEGG代谢通路中,筛选到19条次生代谢通路,KOG功能分类分析获得25个不同的KOG功能类群。预测共有高等植物转录因子56个家族;借助MISA软件发现7 748个SSRs,三碱基重复SSRs数量最丰富,有4 117个,出现频率为53.1%,五碱基重复SSRs相对较少,占2.2%。结论利用高通量测序技术和生物信息分析获得三叉苦转录组信息特征,为后续三叉苦功能基因的挖掘、次生代谢途径解析及其调控机制研究奠定基础。 相似文献
2.
目的考察鸡血藤断面树脂环纹数与其药材品质之间的相关性。方法醇溶性浸出物含量按照《中国药
典:一部》(2015 年版)附录XA 法测定;采用高效液相色谱法测定原儿茶酸、儿茶素、表儿茶素、芒柄花素及
染料木素的含量及建立高效液相色谱(HPLC)指纹图谱,用SPSS 对其环纹数与醇溶性浸出物及5 个化学成分进
行相关性分析。结果醇溶性浸出物的含量在3 环左右时达到一个峰值,后随着环纹数的增加,变化趋势有所
不同。不同树脂环纹数药材中原儿茶酸、儿茶素及表儿茶素的含量差异较大,而芒柄花素与染料木素的含量差
异较小,其中儿茶素与表儿茶素、芒柄花素与染料木素在不同树脂环纹药材中的动态变化趋势较为一致;除
1 环样品外,同一植株不同环纹数的药材样品具有较高的相似度;环纹数与醇溶性浸出物及5 个化学成分之
间无显著相关性。结论各指标性成分的含量与树脂环纹数之间没有一定的相关性,鸡血藤横切面的树脂环
纹数的多少不可以作为评判药材质量优劣的直观依据,但以3 环以上入药为宜。 相似文献
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九里香是传统中药九里香属植物的两个基原植物之一。本研究建立了一种快速、有效的HPLC分析方法,能够实现在20分钟内同时测定九里香中两个香豆素类化合物,海南九里香内酯(1)和橙皮内酯(2),以及一个多甲氧基黄酮类化合物,3,5,6,7,3′,4′,5′-七甲氧基黄酮(3)。色谱条件为采用DIKMA Spursil C18色谱柱,乙腈–水(50:50,v/v)等度洗脱,柱温25 oC,流速1 m L/min,320 nm检测。三个主要成分分离度良好,在测试范围内线性关系良好,r>0.999;精密度、重复性、稳定性良好;平均加样回收率在100.52%–101.97%之间,RSD值小于2%。采用该方法对20批不同产地的九里香药材进行含量测定,三个主要成分的含量和在1.55–7.45 mg/g。此外,还对九里香不同部位如主茎、侧枝、嫩枝和叶,及不同采收期的药材进行了测定。结果表明,三个主要成分在嫩枝及叶中的含量明显高于主茎或侧枝中,所以药典规定以九里香的叶及嫩枝作为药用部位是合理的;六月或十月为最佳采收期;产自广东茂名市、深圳市、广西南宁市、天峨市和福建漳州市的九里香中主要活性成分的含量高于其他产地。该方法具有高效、简便的特点,可用于九里香药材及其相关产品的质量控制。 相似文献
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采用ICP-MS测定野菊花和土壤样品中铅(Pb)、镉(Cd)、汞(Hg)、砷(As)、铜(Cu)5种重金属元素的含量。利用Pearson相关、通径分析分析经纬度、海拔对野菊花中重金属元素含量的影响。探讨野菊花中重金属元素含量与生长地经纬度、海拔以及土壤中重金属元素含量之间关系。结果表明野菊花对Cd元素具有较高富集性;野菊花对5种重金属元素的吸收具有协同作用;海拔直接作用于野菊花中Pb,Cd含量的积累并且为正效应;纬度直接正效应作用于野菊花中Hg,Cu含量的积累;经度对Cd含量的影响是经度直接作用的负效应。地理因素对野菊花中重金属元素含量的积累效应是不同的,直接作用和间接作用之间存在一定的交互性。野菊花药材对不同重金属种类具有不同的吸收富集特性,在控制野菊花重金属含量及药材质量时要充分考虑地理因素对药材质量的影响,选择合适的地理区域开展收购行为;选择生态环境良好的地区建立中药材种植基地,或采取一定的农业措施减少野菊花药材对重金属元素的吸收,在进行化学成分的研究的同时,加强对重金属有效形态的研究,关注药材安全性。 相似文献
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两面针ISSR-PCR反应体系的建立及优化 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】建立适合两面针简单重复序列—聚合酶链反应(ISSR-PCR)体系和扩增程序。【方法】采用改良的高盐低pH法提取两面针基因组DNA,通过单因素试验和正交试验相结合对ISSR反应体系中的主要成分(Mg2+、Taq DNA聚合酶、引物和模板)进行筛选和优化,并考察退火温度对扩增结果的影响。【结果】最佳的PCR反应体系为:总体积为25μL,含1.50 mmol/L Mg2+、150μmol/L dNTPs、0.04 U/μL Taq DNA聚合酶、0.60μmol/L引物、2.40 ng/μL DNA模板。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,51.4℃退火45 s,72℃延伸2 min;35个循环;72℃再延伸10 min。【结论】优化了两面针ISSR-PCR反应体系和扩增程序,为两面针ISSR遗传多样性分析打下基础。 相似文献
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【目的】考察两面针4个部位(根、茎、叶、地上部分)对大鼠胃黏膜损伤的影响,为两面针扩大药用部位提供参考。【方法】观察两面针根、茎、叶、地上部分对盐酸乙醇致大鼠胃黏膜损伤的影响,同时观察不同剂量两面针叶对消炎痛致大鼠胃黏膜损伤的影响。【结果】两面针根、茎、叶、地上部分均可减轻盐酸乙醇所致大鼠胃黏膜损伤;30 g.kg-1.d-1剂量两面针叶可减轻消炎痛所致大鼠胃黏膜损伤。【结论】两面针根、茎、叶及地上部分均具有一定的胃黏膜保护作用。 相似文献
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南、北五味子的薄层色谱鉴别及定量分析 总被引:1,自引:0,他引:1
采用薄层色谱法鉴别南、北五味子,并采用薄层扫描法对南、北五味子中主要有效成分五味子甲、乙素的含量进行测定,方法简便、可靠 相似文献
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采用TLC法对三九胃泰冲剂中白芍进行了定性鉴别;用HPLC法对黄芩中黄芩甙的含量进行了测定。方法简单,结果准确,且重现性好,可作为该制剂的质量控制标准。 相似文献