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目的 开发一套能高效准确地从GWAS Catalog公开数据库中筛选全基因组关联研究(GWAS)的R脚本。方法 参考既往研究制定GWAS的筛选原则。将人工在GWAS Catalog的筛选过程抽象为标准的算法,2名程序员共同撰写R脚本(gwasfilter.R)后,由他人多次对脚本进行测试。结果 采用gwasfilter.R筛选GWAS包含6个步骤。该脚本内置5个主要函数,可以同时根据“是否有验证人群”“样本量大小”和“研究人群种族”等条件对GWAS进行筛选。筛选单个性状时,程序用时不超过1秒。结论 gwasfilter.R操作简便,筛选过程高效而标准化,可灵活应用于GWAS筛选。脚本源代码网址:https://github.com/lab319/gwas_filter。 相似文献
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目的 探讨中药复方液对麻黄素致损伤的影响。 方法 采用递增剂量连续腹腔注射浓度为2.0g/L、3.0g/L和4.0g/L的麻黄素溶液,在注射麻黄素1h 后再分别灌胃,浓度为20.0g/L、30.0g/L和40.0g/L的中药复方液。分别于灌胃中药5、10、15d后,用比色法测定仔鼠肝组织中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)活性和丙二醛(MDA)含量,用显微镜观察肝组织结构,用免疫组织化学法检测肝组织c-Fos蛋白的表达。 结果 麻黄素组仔鼠10d、15d 时肝组织SOD、CAT的活性低于对照组,MDA含量高于对照组 (P<0.05或 P<0.01),肝组织有不同程度的损伤,肝组织c-Fos蛋白表达强度高于对照组 (P<0.05或P<0.01);中药组仔鼠肝组织SOD、CAT活性升高,MDA含量降低(P<0.05或P<0.01),肝组织损伤明显减轻,肝组织c-Fos蛋白的阳性表达强度减弱(P<0.05或P<0.01)。结论 麻黄素对肝组织有明显的损伤效应,中药复方液可提高细胞抗氧化活性,具有抗炎、抗氧化和保护肝细胞等作用,能有效减轻麻黄素对肝组织的损伤。 相似文献
3.
先天性巨输尿管是以输尿管末端功能性狭窄并近段扩张为特征的先天畸形,临床少见。本文收集7例,均经泌尿系造影检查并手术证实,其中5例合并其他畸形。结合文献报告如下。 相似文献
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李重阳 《华北煤炭医学院学报》2006,8(4):549-550
教育的本质就是要改善人力资源,提高人的素质,保证社会和人的可持续发展。今天的教育就是明天的经济,今天的孩子就是祖国的明天和未来,这已成为许多人的共识。今后的国际竞争归根到底是人才的竞争。我们正处在知识经济的时代,知识容量呈几何级数增长,面对学习化社会的到来,随着 相似文献
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支原体肺炎是由肺炎支原体引起的一种呼吸道疾病,近几年在儿童人群中发病率日趋增高,已成为儿科的一种常见病.冈其临床症状不典型,正确认识其X线表现可以提高本病的甲期诊断正确率。本文收集我院2004年9月-2005年3月经临床和实验室检查确诊病例96例,分析其X线表现.以期提高对本病的认识。 相似文献
6.
随着现代医学对患者疼痛的认识,并将疼痛作为第五大生命体征。以三阶梯止痛作为主要治疗方法。而作为我国传统医学的中医,经历医药先贤的探索积累。亦发现了不少具有止痛作用中药,并对他们的运用按归经理论进行了基本规范,即按病痛部位,所属经络、灵活辨证选用。如:头痛在枕部,属太阳经,用羌活、防风:痛在前额和眉棱。属阳明经.用葛根、白芷:痛在头颞两侧,属少阳经,用柴胡、川芎: 相似文献
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麻黄素对卵巢组织结构的影响 总被引:1,自引:1,他引:0
目的 探讨麻黄素对雌鼠血液雌二醇(E2)、肾上腺素(EPI)浓度和卵巢组织结构及超氧化物歧化酶(SOD)活性、丙二醛(MDA)含量的影响。 方法 受孕雌鼠分别腹腔注射(2g/L、4g/L、6g/L)麻黄素溶液和等量的生理盐水,采用ELISA法检测15d、20d、25d雌鼠血浆中EPI与E2浓度的变化,用比色法检测卵巢SOD活性及MDA含量的变化,称量检测卵巢的重量变化,用生物显微技术观察卵巢组织结构的变化,统计卵巢各级卵泡的数量。结果 实验组雌鼠血浆中的E2含量降低,EPI含量显著升高,并呈现剂量依赖性,卵巢SOD活性降低,MDA含量显著升高;实验组卵巢的重量明显低于对照组,初级卵泡、次级卵泡和闭锁卵泡数量均增多;黄体数量减少;实验组卵巢固缩,结构不完整,卵母细胞萎缩,颗粒细胞变性、降解,排列疏松、紊乱,黄体结构模糊,颗粒黄体细胞核固缩。 结论 麻黄素影响雌鼠卵巢的组织结构和功能,这可能与卵巢中SOD活性下降有关。 相似文献
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当归(粗)多糖对麻黄素肝组织损伤的保护作用 总被引:1,自引:1,他引:0
目的 探讨当归多糖对麻黄素致肝损伤的保护作用。 方法 72只小鼠分为正常对照组、实验对照组、当归多糖1组和当归多糖2组4个组,实验对照组和当归多糖组连续腹腔注射0.2ml浓度为4.0g/L麻黄素溶液15d(每天2次),正常对照组注射等量生理盐水,当归多糖1组和2组在腹腔注射麻黄素溶液1h后,灌胃0.3ml(12.5g/L、25.0g/L)当归(粗)多糖溶液,正常对照组和实验对照组灌胃等量的生理盐水。分别于5、10、15d用光学显微镜技术观察各组小鼠肝组织结构的变化,用比色法检测小鼠血浆γ-谷氨酰转移酶(γ-GT)、碱性磷酸酶(AKP)、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)及肝组织超氧化物歧化酶(SOD)活性和丙二醛(MDA)含量的变化,用免疫组织化学方法检测小鼠肝组织Bax蛋白、Csapase-3蛋白表达的变化。 结果 实验对照组小鼠肝组织有不同程度的损伤,肝细胞索排列紊乱,肝细胞疏松,肝血窦扩张,血浆γ-GT、AKP、ALT、AST活性明显升高,肝组织SOD活性显著降低,MDA含量显著升高,Bax、Caspase-3蛋白的表达显著升高;当归多糖组小鼠肝组织病理损伤明显减轻,血浆γ-GT、AKP、ALT、AST活性明显降低,肝组织SOD活性明显升高,MDA含量显著降低,Bax、Caspase-3蛋白的表达有所降低。 结论 当归(粗)多糖可提高肝组织细胞的抗氧化能力,抑制细胞凋亡,促进组织细胞损伤修复,对麻黄素致肝损伤具有一定的保护作用。 相似文献
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文题释义:
金属蛋白酶组织抑制因子1:是金属蛋白酶组织抑制因子家族成员,在人的细胞和组织中广泛表达,具有独特的分子特性和特征,已被证明在各种生物过程的调节中表现出多种活性,如细胞生长,凋亡和分化等。金属蛋白酶组织抑制因子1作为骨中的局部细胞因子,通过抑制成骨细胞分化和诱导成骨细胞凋亡来调节骨代谢。
Mankin评分:是学术界公认的对骨性关节炎软骨退变程度进行评价的通用标准。具体评价方法为:Ⅰ软骨结构:正常0分,表面不规则1分,血管翳形成和表面不规则2分,裂隙进入过渡层3分,裂隙进入辐射层4分,裂隙进入钙化层5分,结构完全破坏6分;Ⅱ软骨细胞:正常0分,弥漫性细胞增加1分,局部细胞增加2分,细胞数目明显减少3分;Ⅲ软骨基质染色:正常0分,轻度减少1分,中度减少2分,重度减少3分,无着色4分;Ⅳ潮线完整性:完整0分,被血管破坏1分。4项总和为Mankin评分结果,分数越高,软骨退变程度越严重。
背景:在骨性关节炎的发展过程中,导致软骨最终破坏的机制尚不清楚。研究表明,基质金属蛋白酶家族在软骨基质降解中起着重要作用。
目的:观察膝关节骨关节炎患者的基质金属蛋白酶3、金属蛋白酶组织抑制因子1表达与病变程度的相关性。
方法:研究经沈阳市骨科医院伦理委员会批准。收集行人工全膝关节置换的40例骨关节炎患者的胫骨平台,所有患者均自愿捐赠标本并签署知情同意书。根据Kellgren-Lawrence分级标准评价影像学骨关节炎的分级及分组:对照组6例;KL2级组11例;KL3级组15例;KL4级组14例。将标本行苏木精-伊红染色,采用Mankin病理评分对骨关节炎软骨病理学改变进行组织形态学评估,利用免疫组织化学方法检测各组软骨中的基质金属蛋白酶3和金属蛋白酶组织抑制因子1的水平。
结果与结论:①苏木精-伊红染色观察发现,对照组软骨层厚,软骨细胞数量多且排列整齐;KL2组软骨浅表层不平整,偶见裂隙形成;KL3组软骨层纤维化,软骨细胞排列紊乱;KL4组软骨层结构丧失,软骨细胞数量少且排列紊乱;②免疫组织化学方法检测发现,骨关节炎组基质金属蛋白酶3表达均显著高于对照组,并且骨关节炎组中KL2组、KL3组、KL4组的基质金属蛋白酶3表达呈上升趋势(均P < 0.05);骨关节炎组金属蛋白酶组织抑制因子1的表达均显著低于对照组,并且骨关节炎组中KL2组、KL3组、KL4组的金属蛋白酶组织抑制因子1表达呈下降趋势(均P < 0.05);③基质金属蛋白酶3表达水平与Mankin评分存在显著的正相关(r=0.899,P < 0.001);金属蛋白酶组织抑制因子1表达水平与Mankin评分存在显著的负相关(r=-0.903,P < 0.001);金属蛋白酶组织抑制因子1表达水平与基质金属蛋白酶3表达水平存在显著的负相关(r=-0.881,P < 0.001);
④结果说明,骨关节炎患者关节软骨基质金属蛋白酶3和金属蛋白酶组织抑制因子1水平与病变严重程度相关,可用作评价膝关节骨关节炎病程和进展的有效指标。
ORCID: 0000-0003-3357-1523(邬波)
中国组织工程研究杂志出版内容重点:组织构建;骨细胞;软骨细胞;细胞培养;成纤维细胞;血管内皮细胞;骨质疏松;组织工程 相似文献
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注射海洛因、麻黄素对仔鼠大脑颞叶皮层结构及学习记忆能力的影响 总被引:5,自引:4,他引:1
目的 探讨海洛因和麻黄素对仔鼠大脑颞叶皮层结构及学习记忆能力的影响. 方法 108只仔鼠采用递增剂量腹腔连续注射海洛因和麻黄素,通过食饵迷宫观察仔鼠行为学变化,在光学显微镜和透射电镜下观察大脑颞叶皮层细胞结构的变化;用免疫组织化学方法观察Bax蛋白和角质细胞生长因子(KGF)在大脑颞叶皮层的表达;采用比色法检测大脑颞叶皮层胆碱乙酰基转移酶(ChAT)活性的变化. 结果 除麻黄素组5d时与对照组差异不显著(P>0.05)外,海洛因和麻黄素组各期仔鼠食饵迷宫试验的错误次数及总测试时间均高于对照组,差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01);海洛因组仔鼠食饵迷宫的上述两项指标均高于麻黄素组,差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01).注射海洛因、麻黄素5d、10 d、15 d、20d,仔鼠大脑颞叶皮层锥体神经元树突、轴突萎缩,胞体缩小,神经元核膜失去正常圆形轮廓,胞内细胞器结构不正常或空泡化;毛细血管周围基质溶解破坏,管腔狭窄;突触小泡减少;大脑颞叶皮层凋亡细胞、坏死细胞及Bax蛋白和KGF阳性表达细胞的数量均高于对照组,ChAT的活性低于对照组,差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01);海洛因组仔鼠大脑颞叶皮层凋亡细胞、坏死细胞、Bax蛋白和KGF阳性表达细胞的数量及ChAT的活性与麻黄素组相比,差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01).随着海洛因和麻黄素剂量的递增,仔鼠食饵迷宫试验的错误次数,大脑颞叶皮层凋亡细胞、坏死细胞及Bax蛋白和KGF阳性表达细胞的数量呈增多趋势. 结论海洛因和麻黄素显著影响仔鼠的学习记忆能力,其可能机制与大脑颞叶皮层结构受损及ChAT活性下降有一定的相关性. 相似文献