复创产品指纹图谱的比较研究

目的:对复创产品指纹图谱进行研究,比较分析不同工艺制备的复创产品中苷类成分指纹图谱的差异。方法:采用HPLC法,以人参皂苷Rg1为参照物,C18色谱柱,乙腈-水为流动相梯度洗脱,流速1.00m L/min,柱温25℃,检测波长203nm,进样10μL,记录时间75min,以人参皂苷Rg1色谱峰(S峰)的保留时间和峰面积为1计算各峰相对保留时间和相对峰面积比值,并进行方法学考查;采用中国国家药典委员会制定的"中药色谱指纹图谱相似性评价系统"进行相似度评价。结果:制定了不同工艺制备的复创产品中苷类成分指纹图谱,标注了复创产品中苷类成分8个共有指纹峰。不同工艺制备的复创产品各共有指纹峰的相对保留时间比较接近,而各共有指纹峰的相对峰面积则相差较大。结论:通过对复创产品中苷类成分指纹图谱的制定和比较分析,为指纹图谱的制定提供了实验依据,对提高天然产物质量控制技术进行了有意义的探索。     

基于甲基化位点的肺腺癌预后预测模型的探索与建立

目的 利用公共组学数据库挖掘并构建基于DNA甲基化位点的肺腺癌预后模型,并对模型的预测效果进行初步评价。方法  癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)及基因表达谱(gene expression omnibus, GEO)数据库用于相关分析和验证,最小绝对值收敛和选择算子法(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO) Cox回归模型用于确定与肺腺癌预后风险具有关联的甲基化位点,Cox回归用于甲基化位点与预后风险的关联性分析,Harrell's C统计量用于评价模型的预测效果。结果  甲基化位点cg02909790和cg19378330被纳入LASSO Cox最优模型。Cox比例风险回归模型结果显示,甲基化位点组合与肺腺癌预后的关联有统计学意义(HR=8.32, 95% CI: 2.41~28.69, P < 0.001)。结合甲基化位点和临床信息建立的肺腺癌预后预测模型预测能力较好,Harrell's C为0.81(95% CI: 0.78~0.83)。结论  基于甲基化位点cg02909790和cg19378330的肺腺癌预后模型的预测效果良好,可能是潜在的个体化肿瘤分子标志物。     

基于公共数据库挖掘肝细胞癌预后相关的长链非编码RNA分子标签

目的 通过对癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）公共数据库中肝细胞癌病例癌和癌旁组织RNA测序数据的分析,挖掘与肝细胞癌预后相关的长链非编码RNA（lncRNA）分子标签。方法 截至2018年2月,从TCGA数据库中获得377例肝细胞癌病例的癌及癌旁组织RNAseq数据及临床预后信息,将50对癌和癌旁组织的lncRNA表达水平进行差异t检验分析,进而采用LASSO Cox回归分析筛选肝细胞癌预后相关的lncRNA,并构建lncRNA分子标签。将所有病例按分子标签表达水平分为4组（<P₂₅、P₂₅～、P₅₀～、≥P₇₅）,采用Cox回归计算P₂₅～、P₅₀～、≥P₇₅组相对于<P₂₅组的预后风险比,进而评估分子标签表达水平对肝细胞癌病例总体生存率的影响。结果 筛选出951个癌和癌旁组织中表达水平有统计学意义差异的lncRNA,通过LASSO Cox回归分析进一步筛选出3个lncRNA（LNCSRLR、MKLN1-AS及ZFPM2-AS1）,并构建分子标签。分子标签表达水平≥P₇₅组的死亡风险是<P₂₅组的1.57倍（95% CI：1.06～2.31,P<0.05）。结论 通过对TCGA数据库的挖掘,由LNCSRLR、MKLN1-AS及ZFPM2-AS1构建的lncRNA分子标签表达水平与肝细胞癌病例的预后有关。