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1.
目的 从腹部计算机断层扫描(computed tomography,CT)图像中分割出肝脏区域,对于肝脏疾病早期诊断、肝脏大小估计以及3D重建十分重要,精准快速地分割出肝脏边缘成为研究要点.方法 采用公开发表的肝脏肿瘤数据集为研究对象,融合生成对抗网络和Unet网络对CT图像实现肝脏的自动分割.首先将腹部CT图像输入到Unet网络进行分割预测,然后通过生成对抗网络(generative adversarial networks,GAN)进行对抗训练,使得预测结果更加接近于真实结果,同时在进行对抗训练的过程中探索了不同的距离约束函数对于分割结果的影响;预测的分割结果通过Dice分数(dice similarity coefficient,Dice)、IoU分数(intersection over union,IoU)、像素精确度(pixel accuracy,PA)、相对体积误差(relative volume difference,RVD)以及相对表面积误差(relative surface area error,RSSD)在CT-核磁健康腹部器官分割挑战数据集[combined(CT-MR)healthy abdominal organ segmentation challenge data,CHAOS]数据集上进行评价.结果 L2距离约束的Gan-Unet网络可以很好地对肝脏进行分割,其Dice、IoU和PA分别达到了94.9%、91.3%、99.4%,相比于Unet的Dice、IoU和PA为92.3%、86.7%、95.8%有明确的提升.在三维指标中,本文的方法在RVD、RSSD为0.026、0.079,相比于Unet的0.042、0.191有明显下降.结论 通过对Unet网络进行生产对抗训练以及在训练过程中引入距离约束函数可以提高肝脏分割的性能,肝脏分割结果可以应用于计算机辅助诊断系统中.  相似文献   
2.
基质金属蛋白酶活性测定的改良底物胶电泳法   总被引:3,自引:0,他引:3  
基于SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)的原理和技术方法,介绍一种改良的明胶-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法(Gelatin-PAGE),简称底物胶电泳地,用于测定能够水解明胶的基质金属蛋白酶类(MMPs的水解活性。该方法简便实用,将底物胶中明胶浓度从10g/L降至2g/L,并将分子质量标准浓度提高至≤40μg/孔,较好地解决了实验过程中所遇到的有关分子质量鉴定的难题。  相似文献   
3.
LPS对金属蛋白酶的诱导表达及中药热毒清的保护机制   总被引:1,自引:1,他引:0  
背景与目的:以肿瘤坏死因子(Tumournecrosisfactor-α,TNF-α)前体向分泌型TNF-α转化过程为目标,探讨HL-60细胞中金属蛋白酶(Metalloproteinases,MPs)家族的基质金属蛋白酶(Matrixmetalloproteinases,MMPs)和解整合素金属蛋白酶(Adisintegrinandmetalloproteases,ADAM)两亚类成分参与炎症因子分泌的机理以及中药热毒清(Reduqing,RDQ)抗炎保护功效的分子机制。材料与方法:采用细胞毒性-MTT检测法、原位杂交、PAG-底物(明胶)电泳等方法分别检测HL-60、U937和小鼠腹腔巨噬细胞在大肠杆菌内毒素(LPS)及RDQ的作用下,MMPs、ADAM17、TNF-α基因转录水平和酶活性的变化。结果:①LPS刺激后,不同类型细胞的MMPs的表达量及电泳酶谱随刺激时间的延长变弱,而HL-60细胞培养上清的酶谱变化正好相反;②在HL-60细胞中与MMPs相比,ADAM17在前体TNF-α(pro-TNF-α)向分泌型TNF-α(s-TNF-α)转换中起着重要作用;③RDQ在细胞杀伤效应上、在ADAM17mRNA表达水平上均能明显抑制LPS所诱导的s-TNF-α表达和分泌的增高作用(P<0.01)。结论:①在LPS刺激的TNF-α分泌中,MPs家族的ADAM17起主要作用,而针对解整合素结构域(Disintegrin)的探针对排除MMPs的干扰,真实反映ADAM17mRNA表达水平更具特异性;②纯中药注射液RDQ的抗炎、解毒作用的靶标之一是拮抗LPS诱导的TACEmRNA活性增加。ADAM17成为炎症机制和治疗研究的新靶标。  相似文献   
4.
基于SDS-聚丙烯酸胺凝胶电泳(SDS-PAGE)的原理和技术方法,介绍一种改良的明胶-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法(Gclatin-PAGE),简称底物胶电泳法,用于测定能够水解明胶的基质金属蛋白酶类(MMPs)的水解活性。该方法简便实用,将底物胶中明胶浓度从 10 g/L降至 2 g/L,并将分子质量标准浓度提高至≤40μg/孔,较好地解决了实验过程中所遇到的有关分子质量鉴定的难题。  相似文献   
5.
目的:探讨纯中药制剂热毒清抑制肿瘤坏死因子α(TNFα)失控释放的分子机制。方法:采用细胞和分子生物学技术观察热毒清对HL-60细胞分泌炎性细胞因子——分泌型肿瘤坏死因子α(sTNFα)及肿瘤坏死因子α转换酶(TACE)mRNA表达的影响。结果:(1)1∶30稀释的热毒清能有效地控制内毒素脂多糖(LPS)刺激所引起的sTNFα的高分泌。(2)热毒清单独作用HL-60细胞时,对TACE mRNA的表达虽无明显的抑制作用,但对LPS刺激增加表达的TACE mRNA具有明显的抑制效果。结论:热毒清对LPS引起的炎性细胞因子sTNFα的分泌及对sTNFα激活的关键酶——TACE的基因表达具有双重抑制作用,提示热毒清可能是一种TACE良好的天然抑制剂。  相似文献   
6.
肺炎链球菌对大环内酯类抗生素耐药情况及耐药基因研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的调查上海地区肺炎链球菌对红霉素的敏感度,研究肺炎链球菌对大环内酯类抗生素耐药机制。方法对中山医院57株临床分离肺炎链球菌进行红霉素药敏试验;应用聚合酶链反应(PCR)技术对上海4所医院中分离的53株红霉素耐药肺炎链球菌检测耐药基因(ermB,mefA,merE)。结果57株肺炎链球菌中12株(21.0%)敏感,3株(5.3%)中介,42株(73.7%)耐药。53株红霉素耐药肺炎链球菌中,ermB基因、mere基因、mefA基因分别在51株(96.2%)、22株(41.5%)和1株(1.9%)中检测到。其中21株(39.6%)同时检测到ermB基因和mefE基因,1株(1.9%)同时检测到ermB基因和mefA基因,1株(1.9%)未检测到ermB基因、mefE基因或mefA基因。结论上海地区肺炎链球菌对大环内酯类抗生素耐药率较高。ErmB介导的靶位改变是最常见的耐药机制,mef(特别是mefE)介导外排机制引起者也较常见。  相似文献   
7.
After immunoactive cells are stimulated bylipopolysaccharides (LPS) they secretdefined type ofcytokinessuch as IL- 6 ,IL- 1 ,TNFαand so on,whichinvolve in the inflammation response with some certainside- effects[1] . It was discovered that tumor necrosisfactor- α(TNF- α) exists in two types:secreted TNFα(s TNFα) and transmembrane- TNFα(m TNF) with themolecular weight being 1 7ku and 2 6 kurespectively[2 ] . The extra- membrane domain ofm TNFα is cleaved by a certain enzyme an…  相似文献   
8.
三类TACE抑制剂的作用机理探讨   总被引:10,自引:0,他引:10  
目的 :以脂多糖 (LPS)刺激的HL 6 0细胞系为天然模型 ,筛选肿瘤坏死因子α转换酶的抑制剂 ,为人工干预炎症过程提供依据和手段。方法 :分时相刺激HL 6 0细胞后 ,用分子生物学和细胞学技术在蛋白质和mRNA水平上研究TACE表达和活性的改变。结果 :中药热毒清 (RDQ)能明显降低LPS诱导的TACEmRNA增加 (与对照组比 ,P <0 .0 1) ;针对TACEmRNA的反义寡核苷酸 (anti ODN)在翻译水平上抑制TACE表达 ,抑制率达 78.9% ;化学合成的针对TACE催化域的小分子底物模拟肽可抑制LPS诱导的TACE表达增加 ,从而抑制sTNFα分泌增加 ,削弱LPS诱发的炎性病理反应强度。结论 :3种不同类型的抑制 (RDQ、anti ODN、底物模拟肽 )在不同层次上调节TACE的表达 ,最终均抑制了sTNFα的分泌 ,为控制炎症提供了明确的治疗靶标。  相似文献   
9.
目的:探讨纯中药制剂热毒清抑制肿瘤因坏死因子α(TNFα)失控释放的分子机制。方法:采用细胞和分子生物学技术观察热毒清对HL-60细胞分泌炎性细胞因子-分泌型肿瘤坏死因子α(sTNFα)及肿瘤坏死因子α转移酶(TACE)mRNA表达的影响。结果:(1)1:30稀释的热毒清能有效地控制内毒素脂多糖(LPS)刺激所引起的sTNFα的高分泌。(2)热毒清单独作用HL-60细胞时,对TACEmRNA的表达虽无明显的抑制作用,但对LPS刺激增加表达的TACEmRNA具有明显的抑制效果。结论:热毒清对LPS引起的炎性细胞因子sTNFα的分泌及时sTNFα激活的关键酶-TACE的基因表达具有双重抑制作用,提示热毒清可能是一种TACE良好的天然抑制剂。  相似文献   
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