基于机器学习的结直肠癌微卫星不稳定基因挖掘及其应用价值分析

背景与目的 结直肠癌（CRC）是全球第三大最常诊断的恶性肿瘤和第二大癌症死亡原因。最新指南推荐所有的CRC患者需要进行微卫星不稳定（MSI）的检测。MSI患者往往具有错配修复蛋白缺失（dMMR）。MSI/dMMR状态已被用作生物标志物预测对免疫治疗的有利反应和预后。然而MSI特征基因及其与肿瘤浸润的免疫细胞的关系未进行阐述。因此本研究通过使用机器学习的方式发掘CRC中新型的MSI特征基因,并且验证其的诊断价值及其与免疫细胞浸润的关系。方法 按照纳入排除标准,将GEO数据库中GSE39582数据集作为训练集,将TCGA数据库中COAD数据集作为外部验证集。使用机器学习的方法（LASSO回归、SVM-RFE算法）,在GSE39582结直肠癌数据集中筛选MSI特征基因,并在TCGA结直肠癌数据中进行验证。采用受试者工作特征（ROC）曲线和曲线下面积（AUC）评价基因对MSI的诊断效能。CIBERSORT算法评估肿瘤样本浸润的免疫细胞成分,Spearman相关性分析验证MSI特征基因和免疫细胞的关系。结果 训练集共纳入536例CRC患者,其中高频MSI（MSI-H）77例（14.37%）。在验证集中,共计389例CRC患者,其中MSI-H 67例（17.22%）。基线资料分析显示,MSI-H/dMMR CRC的TNM分期存活率优于低频MSI（MSI-L）或微卫星稳定（MSS）/错配蛋白完整（pMMR）CRC（P<0.05）。在GSE39582数据集中,LASSO回归筛选MSI特征基因21个,SVM-RFE算法筛选基因6个,结合两种算法确定MSI特征基因为EIF5A、CXCL13、HNRNPL、HOXC6、RPL22L1、Y16709。在TCGA数据库中进一步验证MSI特征基因的诊断效能,研究发现EIF5A的诊断效能最高。在训练集和验证集中,EIF5A的AUC值分别为0.922和0.805。同时,Spearman相关性分析发现,EIF5A主要与CD8⁺T细胞,活化的树突状细胞,辅助性T细胞,M1型巨噬细胞,γδT细胞,中性粒细胞成正相关;与CD4⁺记忆性T细胞,M2型巨噬细胞,静止树突状细胞,嗜酸性粒细胞,调节性T细胞呈负相关。结论 CRC的新型MSI特征基因分析结果表明,EIF5A对CRC MSI的诊断具有较好的诊断作用和临床价值,同时提示EIF5A与免疫细胞及免疫微环境相关。因此,EIF5A可能成为免疫检查点治疗的新型标志物。     

耳鼻喉科常见疾病的微波治疗

<正> 微波技术在耳鼻喉科的应用已涉及诸多方面。自2000-01～2002-016我科应用微波治疗耳鼻喉科各类疾病,现就253例资料完整的治疗效果进行分析,探讨微波在耳鼻喉科中的     

《军队合理医疗药品目录》的实施对解放军总医院门诊用药的影响

目的:分析《军队合理医疗药品目录》的实施对解放军总医院门诊用药的影响。方法:收集解放军总医院门诊药房2004年和2005年上半年药物利用的数据,包括药品种类、数量、使用频度、日均费用、药品总费用、处方量和单张处方金额等,分析其变化趋势。结果:自2004年8月《军队合理医疗药品目录》实施以来,处方量和单张处方金额分别增长了6.6%和72.3%。7类药品(包括消化系统用药、神经系统用药、激素类及其有关药物等)的用药频度仅增长了27.9%,但是它们的消耗金额增长了172.0%。这种变化的主要原因是一些具有更好疗效和更高价格的药品开始用于军队公费医疗。结论:《军队合理医疗药品目录》使解放军总医院门诊药房军人可使用的药物品种增加,药品档次提高,药品支出增长。     

根据《抗菌药物临床应用指导原则》分析我院门诊抗菌药物使用情况

目的:促进临床合理用药。方法:对我院2003～2005年中每年1月份就诊“医保”患者的9458份处方进行统计分析,并利用Excel录入制表建立数据库,根据《抗菌药物临床应用指导原则》进行合理性分析。结果与结论:我院门诊使用抗菌药物的比例在逐年增加,并且在临床应用中存在诊断不明确等不合理用药现象;应向临床医师加大《抗菌药物临床应用指导原则》的宣传力度。     

泌尿系疾病患者术后使用自控镇痛泵的护理

<正>安置自控镇痛泵(PCA;简称止痛泵)是利用微量泵经硬膜外导管,将镇痛药物持续注入硬膜外腔,仅阻滞感觉及交感神经,而不阻滞运动神经,达到持续无痛的作用。腹部术后安置PCA是一种用药量小、安全且疗效好的镇痛新方法,明显优于间断肌肉注射镇痛药物进行镇痛的传统方法,笔者所     

利用基因芯片技术筛选早期乳腺癌的差异表达基因

目的 比较相同病理类型和临床分期预后不同的早期(Ⅰ、Ⅱ期)乳腺癌样本的基因表达差异,寻找有显著差异的基因,探索与早期乳腺癌预后有关的基因分型.方法 用Agilent4×44K人全基因组Oligo芯片对47例早期乳腺癌患者的组织样本,结合其预后好、差数据,根据其临床预后的不同分为对照组(预后好)24例和实验组(预后差)23例,进行差异基因表达分析;采用Real-time PCR技术,对两组乳腺癌样本中差异表达的基因进行验证.结果 基因芯片检测分析发现,实验组样本比对照组样本有差异表达基因126个,其中60个基因显著上调,66个基因显著下调(差异均在2倍以上).结论 不同预后的早期乳腺癌样本中,基因表达存在显著差异,早期乳腺癌的预后与这些基因的表达有关.     

腹腔镜肾切除术前后的护理

<正>腹腔镜肾切除手术是一项微创泌尿外科新技术,具有创伤小,痛苦轻,出血少,住院时间短,术后恢复快等优点。笔者所在科行腹腔镜肾切除术15例,现将护理总结报告如下。1临床资料     

后腹腔镜肾癌根治术患者的护理

<正>目前,腹腔镜技术在泌尿外科领域得到了较快的发展,部分传统的开放手术已经被腹腔镜术所替代。2009-11～2010-11笔者所在医院对8例患者行后腹腔镜肾癌根治术。现将护理体会报告如下。1临床资料1.1一般资料本组8例。男5例,女3例;年龄52～73岁。病史2个月至3年。左侧4例,右侧4例。不同程度的无痛性全程肉眼血尿3例,腰痛3例,2例于体格检查时发现。术前均行B超、CT、静脉肾盂造影检查明确诊断,双侧肾功能及总肾功正常。