上海2010—2013年H3N2流感病毒流行特征

[目的]了解上海市2010—2013年流行的甲3流感病毒血凝毒（HA）基因突变及其抗原变异情况与流感流行的关系。[方法]用实时荧光聚合酶链反应（real-time PCR）检测2010—2013年因类流感症状（ILI）到流感哨点医院就诊的监测病例,分析甲3亚型流感病毒流行特征。鸡胚传代甲3亚型阳性标本,收获尿囊腔液用作提取病毒的RNA,进行逆转录聚合酶连扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MegAlign软件对血凝素（HA）1区域氨基酸位点进行对比分析,用MEGA软件对HA基因进化树进行分析。[结果]2010—2013年间,上海市甲3亚型流感病毒为2010、2012、2013年主要流行株。流行特征具有明显的年度和季节特点,与全国一致。与2011年世界卫生组织推荐的疫苗株相比,上海市甲3亚型流感病毒HA1区域在2010年发生明显抗原改变,共发生35处氨基酸替代,其中23处位点改变较大,6个氨基酸位点涉及HA1的4个抗原决定簇。2011年后的毒株在进化树上也形成一个独立的分支。[结论]上海市2012年较大规模的甲3亚型流感病毒流行与病毒的抗原性漂移有关。     

上海市长宁区一起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情流行病学调查

目的 分析上海市长宁区一起新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)家庭聚集性疫情流行病学特征,为新冠肺炎聚集性疫情防控提供科学依据。 方法 应用现场流行病学调查方法,对2020年上海市长宁区一起新冠肺炎家庭聚集性疫情的病例与密切接触者进行调查,采用实时荧光定量RT-PCR方法对采集的呼吸道标本进行新型冠状病毒核酸检测。结果 病例A为本起家庭聚集性疫情的感染来源,共传染二代病例5人。病例A通过呼吸道飞沫传播及密切接触传播给病例B、病例C、病例D和病例E,通过呼吸道飞沫传播给病例F。除咳嗽、乏力和其它呼吸道症状,病例F还出现消化道症状。本起家庭聚集性疫情涉及一例无症状感染者。 结论 新冠肺炎容易造成家庭聚集性疫情的发生;应加强对病例密切接触者的追踪和管理,尽早识别二代病例。     

饮用水中邻苯二甲酸二-2-乙基已酯的测定

环境内分泌干扰物质(Environmental endocrine disruptors，EDS)是指一些可影响负责机体自稳、生殖、发育和行为的天然激素的合成、分泌、转运、结合作用或消除的外源性物质。此类物质具有亲脂性，不易降解，易挥发，残留期长等特点，可通过生物富集和食物链的放大作用引起体内富集。人群流行病学调查显示，人类的生殖障碍、发育异常及某些癌症如乳腺癌、卵巢癌等都与环境内分泌干扰物质有关。因此，环境内分泌物质的污染问题受到了多个国家的关注。     

上海市2012－2013年4种致泻性大肠埃希菌监测

目的 基于临床医院开展4种致泻性大肠埃希菌(DEC)人群监测,探讨公共卫生实验室对临床实验室需求的直接技术指导的实践模式。方法 设立哨点医院,以标准化方法筛选和鉴定DEC菌型;构建DEC流行特征基线;对疑似暴发病例开展基于实验室和流行病学调查。结果 2012－2013年选择上海地区4家哨点医院检测7 204份腹泻标本确认的712例DEC感染病例,阳性率为9.9%。其中肠致病性大肠埃希菌(EPEC)感染351例;肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)感染292例;肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)感染32例;产志贺样毒素大肠埃希菌(STEC/EHEC)感染6例;DEC混合感染31例。EPEC感染以1～5岁儿童最多见,菌型均为aEPEC;ETEC流行峰值在8月,阳性率>20%,感染病例2012年聚集于1～28日龄和2013年的20～60岁人群(P< 0.05),菌型以耐热肠毒素(ST)型最多(59.6%),其次为不耐热肠毒素(LT)型(27.8%)和ST/LT型(12.6%);2013年儿童感染EIEC病例明显增加(P< 0.01);未监测到EHEC O157 : H7,但确认2例EHEC O26 : H11(eae-hlyA-stx1a)儿童病例;调查确认2012年上海地区15例新生儿ETEC聚集性感染病例与四川省自贡市新生儿病例属于同一克隆(STh-CS21-CFA/I-ClyA-EatA-ST2332- SHNL0005)。结论 上海地区DEC型谱特征已发生改变,ETEC对新生儿院内感染和食源性感染性腹泻构成潜在暴发风险,需加强实验室主动监测。     

4种致泻性大肠埃希菌分子诊断方法的评估及其在监测中的应用

目的评估和建立用于常规监测4种致泻性大肠埃希菌(DEC)的分子诊断方法,并应用于上海市腹泻人群DEC的监测.方法使用丹麦SSI分子诊断试剂盒对DEC参考菌株进行验证试验及制定DEC-PCR诊断、分离的操作规程(DEC-PCR-SOP),并检测2012年6-9月上海市3家临床医院腹泻病例粪便标本.结果经26株DEC参比菌株验证,SSI分子诊断试剂盒的特异性为100%; 1887份腹泻病例标本共分离得到218株DEC(乳糖阳性181株,乳糖阴性37株),其中致病性大肠埃希菌(EPEC) 118株、产毒性大肠埃希菌(ETEC)90株、侵袭性大肠埃希菌(EIEC)9株、产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)1株、志贺菌18株,总阳性率为l1.6%;监测地区DEC腹泻病例中以EPEC占优势,而EPEC腹泻病例中又以2岁以下婴幼儿为主;外籍DEC病例以ETEC占优势,新生儿ETEC病例占5岁以下低年龄组腹泻病例的1/3.结论经评估DEC-PCR-SOP用于4种DEC常规监测的数据结果可信.国内食源性监测网络实验室应不断完善4种DEC诊断和参比能力.