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1.
目的 了解北京市西城区2015年手足口病(HFMD)患儿肠道病毒71型(EV 71)分离株VP1区基因特征,分析其变异情况.方法 收集北京市西城区2015年HFMD病原学检测分型鉴定为EV 71的阳性标本,对部分标本进行病毒分离、培养,并通过实时荧光PCR鉴定阳性培养物.EV 71阳性培养物提取病毒核酸,对其VP1区全长序列进行PCR扩增和测序.从Genbank中选取EV 71不同基因型别参考序列,利用生物信息学软件进行同源性和系统进化分析.结果 共分离到6株EV 71(Genbank登录号为KU376383-KU376388),其VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.00%~99.00%和98.00%~100.00%,与参考序列VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.00% ~ 97.00%和93.00% ~ 100.00%.进化分析显示,6株EV 71均为C4a基因亚型.结论 2015年北京市西城区EV 71流行株属于C4a亚型,未出现明显变异.  相似文献   
2.
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的疾病,特征为急起高热、咽痛、疱疹,多数为轻型病例,病程为1周左右,夏、秋季高发[1]。疱疹性咽峡炎的流行季节和病原与手足口病相似,因此与手足口病的界限不易划分[2]。多种病毒均可导致疱疹性咽峡炎发病,以柯萨奇A组病毒、疱疹病毒、EB病毒较多见,劳累过度、过敏体质、气温突变、身体受凉或某些物理化学因素等刺激,使身体免疫力下降时易患此病[3]。主要侵犯1  相似文献   
3.
目的了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus, HBoV)感染状况及分子流行病学特征。方法收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行基因特征分析。结果共采集粪便标本396例,检出HBoV 30例(7.58%),包括3种基因型别,分别为HBoV1型(17例)、HBoV2型(11例)、HBoV3型(2例),未检出HBoV4型。进化分析表明,HBoV1序列在进化树上包括两簇,其中,BJ16-325变异程度较大,自成一簇;其他HBoV1序列共同形成一簇。北京地区所有HBoV2序列均位于一个新的HBoV2亚型分支上。结论 2015—2016年北京市5岁以下腹泻儿童检出的HBoV包括3种基因型(1~3型);北京市至少存在2组不同来源HBoV1的流行;本地区流行的HBoV2为一种新的亚型。  相似文献   
4.
目的应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法检测和分析牡蛎中诺如病毒的基因特征。方法应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法, 对2014年11月至2015年10月北京市采集的新鲜市售牡蛎进行诺如病毒GⅠ/GⅡ组并联试验检测, 分析检出率, 应用符合率和一致性检验(Kappa值)对半巢式RT-PCR方法进行可靠性评价, 应用半巢式RT-PCR方法扩增诺如病毒GⅠ/GⅡ衣壳蛋白区基因, 对阳性产物进行测序。采用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建进化树。结果 72份样品中, 实时荧光RT-PCR、半巢式RT-PCR和并联试验的诺如病毒检出率分别为31.94%(23/72)、38.89%(28/72)和48.61%(35/72)。2种方法符合率为73.61%, 中度一致(Kappa值=0.43)。测序成功13株诺如病毒, 11株(7株GⅡ.17、2株GⅡ.4 Sydney2012、1株GⅡ.1和1株GⅡ.21基因型)为2种RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本所得;2株(GⅡ.17和GⅡ.3基因型各1株)为半巢式RT-...  相似文献   
5.
6.
目的评价免疫荧光法临床应用于细菌性阴道炎患者诊断的效果。方法选择2010年10月至2011年10月杨凌示范区医院收治的临床上诊断为细菌性阴道炎的80例患者,随机分为观察组和对照组,分别对阴道分泌物涂片采用免疫荧光法和常规线索细胞检查法进行病原菌检测,每份标本涂片三张,重复三次检查,分析两组诊断结果与临床诊断的符合率。结果实验组组的检测结果在与临床诊断的符合率和特异性明显优于对照组,两组之间的差异具有统计学意义(P<0.05)。结论免疫荧光法检查法比常规线索细胞检查法对细菌性阴道炎的诊断具有更高的准确性,值得在临床上广泛应用。  相似文献   
7.
目的了解北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况,分析其基因特征。方法2014年11月-2015年10月,采集北京市三个水产品销售市场新鲜花蛤各24件。用两种方法对花蛤鳃和肠内容物进行病毒浓缩,提取核酸后用实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒GI/GII组和A组轮状病毒核酸。用半巢式RT-PCR方法,扩增诺如病毒阳性样本衣壳蛋白VP1区基因,对PCR阳性产物进行测序,用诺如病毒分型工具进行基因亚型鉴定,用MEGA软件最大似然法构建进化树。结果72件花蛤中未检出A组轮状病毒,诺如病毒检出率为34.7%(25/72),GII组、GI组和GI/GII组混合检出率分别为27.8%(20/72)、4.2%(3/72)和2.8%(2/72)。11月诺如病毒检出率最高,为100.0%(6/6);三个水产销售市场诺如病毒检出率分别为25.0%(6/24)、50.0%(12/24)和29.2%(7/24)。10件测序成功,其中6株为GII.17,GII.6、GII.2、GI.3a和GI.4各1株。这些毒株与腹泻患者和外环境参考毒株相似性为97.9%~100.0%。结论北京市市售花蛤存在诺如病毒污染,而且与腹泻患者和外环境参考毒株高度同源,应加强花蛤及销售人群和环境的诺如病毒监测。  相似文献   
8.
  目的  分析2018—2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。   方法   收集2018—2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。 采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。 采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。 用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06 软件构建进化树。  结果   6所学校(18,S1~S4和19,S5~S6)发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI相似性高达99.6%;5起疫情由GⅠ.Pb-GⅠ.6a引起, 这重组株与GⅠ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%。  结论   2018—2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由GⅠ.Pd-GⅠ.3b和GⅠ.Pb-GⅠ.6a重组株引起。 应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据。  相似文献   
9.
目的探讨风疹IgM抗体检测室内质量控制的方法。方法应用"即刻法"和"双质控法"对北京市西城区(南)2011年度风疹IgM抗体检测结果进行室内质量控制。结果旧试剂的7次试验结果与新批号试剂的4次试验结果均处于在控状态,2011年度风疹IgM抗体检测结果准确可靠。结论 "双质控法"进一步加强、完善了"即刻法"在风疹IgM抗体检测中的质量监控作用。  相似文献   
10.
北京市部分人群成年人病毒性腹泻病原学和流行病学分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
病毒腹泻的病原主要包括轮状病毒(RV)、诺如病毒(NV)、扎如病毒(SV)、星状病毒(AstV)和肠道腺病毒(AdV),而NV和SV分别为杯状病毒科的两个属,主要感染人类,合称为人类杯状病毒(HuCV).近年来国内外关于引起婴幼儿腹泻的各种病毒病原的研究较多[1-4],而对成年人的研究报道较少,并多集中于单一病毒病原的研究.  相似文献   
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