盐城市肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

目的分析盐城市手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)病原学及分子流行病学特征,了解盐城市近年来HFMD病原学构成和肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)毒株流行概况。方法收集HFMD样本,对阳性标本进行病毒培养和分离,提取病毒RNA,利用逆转录-聚合链酶反应、序列测定和基因进化树构建、同源性分析等方法,对阳性扩增产物进行基因型鉴定。结果盐城市HFMD病原学构成以EV71和CA16循环交替流行为主,其他肠道病毒占较大比例。基因进化树图结果显示:EV71毒株均为C4a亚型,CA16毒株为B1a和B1b亚型交替流行,其中以B1b亚型为流行优势株。同源性分析结果显示:EV71和CA16各亚型之间核苷酸和氨基酸同源性较高,亚型之间亲缘性较近,相对于原始株已发生较大变异。结论盐城市EV71和CA16毒株流行优势株遗传性较稳定,基因亚型与国内外研究结果相一致。     

江苏某农村地区柯萨奇病毒A组16型感染所致疾病负担研究

目的了解柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)所致疾病经济负担。方法采用问卷调查方式,对赣榆县可疑肠道病毒病监测系统发现的CA16感染病例进行调查,获得经济负担资料。结果共调查CA16感染病例299例,疾病造成的经济负担共计585 691.17元,人均1 958.83元;人均直接、间接和无形负担分别为239.52、289.99、1 429.33元。有257例病例因病有不同程度失能,患儿失能调整生命年为0.164人年,人均负担强度为0.64人年/千人。结论在农村地区CA16感染所致疾病的疾病负担较重,积极防控CA16感染所致疾病具有较大社会效益和经济效益。     

中国大陆地区柯萨奇病毒A组4型VP1区基因特征分析

目的 分析中国大陆地区柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)流行毒株基因特征和进化规律。方法 利用Mega6.0软件对GenBank核苷酸数据库收录的分离于中国大陆地区CV-A4毒株VP1区基因序列进行分析,构建系统进化树,并计算分离毒株核苷酸和氨基酸同源性。结果 纳入中国大陆地区CV-A4毒株合计116株,中国大陆地区16个省份CV-A4流行毒株潜在的优势基因型为F。与原型株High Point相比,中国大陆地区CV-A4毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为79.9%~84.1%和92.5%~98.7%,收录中国大陆地区CV-A4毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为82.6%~100.0%和91.5%~100.0%。结论 针对中国大陆地区CV-A4毒株流行特征和进化规律,采取有效措施防控手足口病。     

2019-2021年盐城市手足口病流行病学特征分析

目的 分析盐城市2019-2021年手足口病(HFMD)发病趋势和流行特征,为进一步制定HFMD防制策略和实验室监测提供科学依据。方法 中国疾病预防控制信息系统的监测报告信息管理系统中,收集盐城市2019-01-01-2021-12-31报告HFMD的病例资料,采用描述性流行病学方法分析HFMD病例流行病学特征和实验室病原阳性检出率及肠道病毒病原体监测情况。结果 盐城市2019-2021年HFMD年均报告发病率57.15/10万,不同年份报告发病率差异有统计学意义,χ²=388.11,P<0.001。盐城市HFMD流行存在2个高峰,主高峰为5-7月,次高峰为10月至次年1月。盐城市2019-2021年不同地区年均报告发病率前3位依次为亭湖区(171.39/10万)、盐都区(97.65/10万)和阜宁县(53.40/10万),不同地区报告发病率差异有统计学意义,χ²=2 700.18,P<0.001。报告病例年龄分析结果显示,发病主要集中≤5岁婴幼儿,职业分布以散童、学生为主。盐城市HFMD实验室标本监测结果显示,送检标本总体检出阳...     

江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

目的 了解江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16,CA16）流行毒株基因型概况。方法 收集江苏省2012-2014年儿童手足口病标本并送样,进行病毒分离培养获取相应毒株,用CA16特异性引物通过反转录聚合酶链反应技术进行VP1区基因片段扩增和测序,利用生物信息学软件对序列进行分析,并与CA16参比株序列进行同源性比较并构建基因进化树。结果 分离得到82株CA16毒株,测序结果显示全部属于基因亚型B1,VP1基因分析显示其中9株毒株序列的基因亚型为B1a,另外73株毒株序列的基因亚型为B1b。CA16分离株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为87.8%～100.0%和97.5%～100.0%;与CA16国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别为75.2%～78.2%和90.5%～91.9%。结论 江苏省2012-2014年分离获得CA16毒株属于基因亚型B1,以B1a和B1b两个分支共同进化和流行,其中又以B1b为优势亚型。     

盐城市2009-2014年学生结核病发病特征

目的 了解盐城市学生结核病发病特征,为制定防控措施提供依据.方法 通过结核病专报系统,对2009-2014年确诊登记的学生结核病资料进行分析.结果 盐城市2009-2014年累计报告学生结核病607例(男380例,女227例),占全市结核病报告总数的2.7％,发病率0.85/10万～1.66/10万.15～19岁居多(62.3％);涂阴395例(65.1％),涂阳192例(31.6％),涂阴患者比例随年份的增加呈上升趋势.转诊发现为主(52.1％),其次是因症就诊(36.9％)和追踪(9.9％).结论 盐城市学生结核病发病情况处于低水平,但应加强15～19岁年龄段结核病的防治.     

盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析

目的 分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法 基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果 盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论 本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。     

中国部分地区埃可病毒30型分离株VP1区基因序列的特征分析

目的研究中国部分地区埃可病毒30型(Echovirus 30,Echo30)分离株的基因特征和遗传进化规律。方法利用Mega6.0软件对Gen Bank核苷酸数据库收录的分离于中国10个地区的Echo30分离株全长VP1区基因序列进行分析,构建系统进化树,测算分离毒株核苷酸和氨基酸的同源性,计算核苷酸分子进化速率。结果纳入中国10个地区E-cho30分离株合计361株,分析结果显示中国10个地区地区Echo30流行毒株潜在的优势基因型为D。收录中国10个地区Echo30分离株间核苷酸和氨基酸差异性为7.8%～26.1%和1.2%～9.1%,与其他基因型分离株间核苷酸和氨基酸差异性为17.3%～28.5%和5.3%～9.5%。基因型D分离株核苷酸进化速率为5×10-3/(位点/年)。结论 Gen Bank数据库收录的中国地区Echo30分离株以基因型D为主,各亚型间毒株序列核苷酸差异性较小,亲缘性较近。     

盐城市2018-2019年手足口病和疱疹性咽峡炎病原学特征分析

目的 探讨盐城市近年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)和疱疹性咽峡炎病原学特征,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)、10型(CVA10)分离株VP1区序列分子进化规律.方法 收集全市哨点监测医院诊断为HFMD和疱疹性咽峡炎病例标本,采用实时荧...