2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型变迁及耐药性分析

目的 2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型变迁及耐药性分析。方法按《全国细菌性痢疾监测方案》的要求进行。结果 2008年西城区福氏志贺菌7株,占63.6%;宋内志贺菌4株,占36.4%。2009年西城区福氏志贺菌12株,占37.5%;宋内志贺菌19株,占59.4%;鲍氏志贺菌1株,占3.1%。2010年福氏志贺菌6株,占14.3%;宋内志贺菌36株,占85.7%。药敏试验结果:志贺菌对头孢吡肟、头孢西丁、头孢他啶、氧氟沙星、左氧氟沙星、诺氟沙星、氨曲南药物敏感。对氨苄西林、磺胺、奈啶酸耐药。结论 2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型主要为福氏志贺菌和宋内志贺菌,但是福氏志贺菌已呈逐年减少趋势,而宋内志贺菌呈逐年增多趋势。志贺菌对头孢类药物和氟喹诺酮类药物敏感,临床宜选用此类药品进行治疗。     

北京市住院严重急性呼吸道感染病例监测结果分析

目的:对流感哨点北京人民医院采集住院严重急性呼吸道感染病例(Severe Acute Respiratory Infection,SARI)的咽拭子标本进行检测,以掌握流感重症病例的甲型H1N1和季节性流感病原学变化特征。方法:提取咽拭子标本中的病毒核酸,采用荧光定量PCR方法检测甲型H1N1三个主要基因infA、SWinfA、SWH1以及质控RNP基因,然后采用三对基因FluB、FluH1、Flu H3进行季节性流感分型;核酸阳性标本进行病毒分离培养。结果:采集SARI病例标本共100件,核酸检测阳性43件中,检出甲型H1N15件,出现在12、1月;季节性流感的检测中,以乙型为主,共检出36件,在12月出现,1月为高峰,逐渐减少;A(H3)和A未分型各有1件阳性。结论:监测结果表明,SARI病例流感感染主要集中在流感流行高峰2010年1和2月,以季节性流感B型为主,少量甲型H1N1,在不同时间里还有少量其他亚型出现。     

广西地区猪、鼠、狗戊型肝炎病毒感染血清学分析

目的了解广西地区猪、鼠和狗血清中抗．戊型肝炎病毒（HEV）IgG抗体流行情况。方法应用HEV基因1型开放读码框（ORF）2和ORF3多肽包被酶标板，辣根过氧化物酶（HRP）标记的羊抗猪、羊抗鼠和羊抗狗建立的酶联免疫吸附试验（ELISA）法检测猪、鼠和狗血清中抗．HEV IgG。结果总抗．HEV IgG阳性率为31．84％（170／534），其中猪血清抗．HEV IgG阳性率为26．40％（66／250），鼠血清抗．HEV IgG阳性率为43．02％（77／179），狗血清抗．HEV IgG阳性率为25．71％（27／105）。结论猪、鼠和狗血清中存在HEV感染，鼠抗．HEV IgG阳性率最高。     

北京市西城区手足口病患儿肠道病毒71型VP1区基因进化分析

目的了解北京市西城区2015年手足口病（HFMD）患儿肠道病毒71型（EV 71）分离株VP1区基因特征,分析其变异情况。方法收集北京市西城区2015年HFMD病原学检测分型鉴定为EV 71的阳性标本,对部分标本进行病毒分离、培养,并通过实时荧光PCR鉴定阳性培养物。EV 71阳性培养物提取病毒核酸,对其VP1区全长序列进行PCR扩增和测序。从Genbank中选取EV 71不同基因型别参考序列,利用生物信息学软件进行同源性和系统进化分析。结果共分离到6株EV 71（Genbank登录号为KU376383-KU376388）,其VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.00%~99.00%和98.00%~100.00%,与参考序列VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.00%~97.00%和93.00%~100.00%。进化分析显示,6株EV 71均为C4a基因亚型。结论 2015年北京市西城区EV 71流行株属于C4a亚型,未出现明显变异。     

北京市腹泻儿童人博卡病毒VP1区基因特征分析

目的了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus, HBoV)感染状况及分子流行病学特征。方法收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行基因特征分析。结果共采集粪便标本396例,检出HBoV 30例(7.58%),包括3种基因型别,分别为HBoV1型(17例)、HBoV2型(11例)、HBoV3型(2例),未检出HBoV4型。进化分析表明,HBoV1序列在进化树上包括两簇,其中,BJ16-325变异程度较大,自成一簇;其他HBoV1序列共同形成一簇。北京地区所有HBoV2序列均位于一个新的HBoV2亚型分支上。结论 2015—2016年北京市5岁以下腹泻儿童检出的HBoV包括3种基因型(1～3型);北京市至少存在2组不同来源HBoV1的流行;本地区流行的HBoV2为一种新的亚型。     

手足口病患儿柯萨奇病毒A4的鉴定及其5’UTR—VP4一VP2区序列分析

目的分析2009年北京市西城区手足口病患儿柯萨奇病毒A4（CoxA4）5’UTR-VP4-VP2区进化特征,探讨其与国内外其他地区CoxA4分离株的关系。方法提取病毒RNA,进行半巢式RT-PCR扩增肠道病毒（EV）5’UTR-VP4-VP2区。通过测序和Blast比对确定EV型别;并对其进行序列和进化分析。结果共鉴定出两株CoxA4,Genbank登录号为JQ429434和JQ429435。进化分析表明,CoxA4包括3个进化树分支：原型株AY421762位于独立的分支,其余CoxA4构成两个基因型（I型和II型）,每个基因型包括两个亚型（A和B）。在5’UTR-VP4-VP2区．两株CoxA4核苷酸序列同源性为96．00％;它们与原型株、基因Ⅰ型及Ⅱ型毒株序列同源性分别为87．00％～88．00％,85．00％～87．00％,92．00％～98．OO％。两株CoxA4与其他中国株均位于基因Ⅱ型分支上。结论北京市西城区CoxA4株与我国近年CoxA4流行株在5’UTR—VP4一VP2区具有较高的同源性,且进化关系密切。     

广西地区5种动物戊型肝炎病毒RNA的检测

目的了解广西地区与人关系密切的猪、鼠、狗、猕猴和鱼等5种动物戊型肝炎病毒（HEV）。方法对广西地区3月龄以下狗、猪粪便标本及龙虎山自然景区猴粪便标本，鱼胆汁标本，鼠肝组织，猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清，用巢式逆转录聚合酶链反应法（RT—nPCR）检测戊型肝炎病毒核糖核酸（HEVRNA）。结果在3月龄以下猪粪便标本检测出HEVRNA，阳性率为10．08％（13／129），其余各种动物粪便、肝组织、胆汁、HEV抗体阳性血清标本均未检测出HEVRNA。结论猪粪便标本存在HEVRNA，该地区应加强动物粪便特别是猪粪便的管理，以预防戊型肝炎病毒的感染。     

北京市西城区2013年输入性麻疹病毒D8基因型流行分析

目的通过开展疑似麻疹病例的病原学标本核酸检测,加强麻疹病毒基因型的监测。方法采集2013年北京市西城区疑似麻疹病例41例的咽拭子和尿液标本共47份,采用荧光PCR方法对麻疹疑似病例病原学标本进行病毒核酸检测鉴定,RT-PCR扩增核酸阳性标本N基因部分序列,并对扩增产物测序。以N基因末端450个核苷酸序列进行基因亲缘性分析,利用MEGA 4软件进行系统发生树的构建。结果经过序列分析比对,47份标本中获得的21份序列中有5份为D8基因型,其他均为H1基因型。所获得的5株麻疹D8基因型毒株序列与世界卫生组织(WHO)D8基因型代表株MVi/Manchester.UNK/30.94在基因亲缘性关系树上同属一个分支,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.0%和98.7%。结论 2013年北京市西城区麻疹病例出现了输入性麻疹病毒D8基因型的流行。     

4a亚型猪戊型肝炎病毒对猕猴致病性

目的 研究4a亚型猪戊型肝炎病毒(HEV)对猕猴的致病性.方法 用1株从广西壮族自治区农村地区幼猪粪便中分离并已经基因测序确定为4a亚型的猪HEV静脉注射感染猕猴,通过检测粪便HEV RNA、血中HEVRNA、血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平、HEV抗体及肝组织分别进行病理学和电镜检查确定HEV致病性.结果 猪HEV株实验感染猕猴后,出现粪便排毒、病毒血症、ALT升高及HEV抗体阳转,活检肝组织切片呈现典型的急性病毒性肝炎的病理变化,电镜下观察到肝细胞中散在有大量病毒样颗粒.结论 广西4a亚型猪HEV能够跨物种感染猕猴并引起戊型肝炎.     

一例重症手足口病死亡患儿柯萨奇病毒B5型VP4区基因特征分析

目的:对一例重症手足口病死亡患儿肠道病毒型别进行鉴定,分析VP4区基因特征,了解其变异情况。方法:提取病毒RNA,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR(RT-nPCR),通过测序和Blast比对确定肠道病毒型别;并对其VP4区进行序列和进化分析。结果:RT-nPCR扩增目的片段测序结果经Blast比对确定为柯萨奇病毒B5型(CoxB5),命名为BJ09-237(Genbank登录号为JF430480)。其VP4区全长207bp,与CoxB5参考序列在VP4区的核苷酸同源性为79%～98%,氨基酸同源性为95%～100%,与广东株HQ005438及俄罗斯株GQ281602在同一进化树分支上。BJ09-237在VP4区无氨基酸的缺失和插入,未发现其所特有的氨基酸置换。结论:该重症手足口病死亡患儿CoxB5的VP4区基因序列未发生明显变异。