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国产实时荧光定量核酸检测试剂测定HIV病毒载量 总被引:1,自引:0,他引:1
目的在目前进口试剂较昂贵的情况下,探讨国产实时荧光定量核酸检测试剂用于检测艾滋病病毒(HIV)病毒载量的可行性。方法2004年从全国4个省的HIV感染者/艾滋病(AIDS)患者采集110份样本,每份样本均同时使用生物梅里埃公司NASBA与深圳匹基生物公司实时荧光定量PCR两种方法测定血浆中HIV RNA含量,比较两种方法所得数据间的关系。结果HIV样本病毒载量处于3.5×103-1.0×105拷贝/ml范围时,一致性较好,存在一定线性关系;在小于103拷贝/ml范围内时,两种方法检测结果基本一致;当病毒载量处于1.0×103-3.5×103拷贝/ml范围时,两种方法检测结果偏差较大;病毒载量处于大于105拷贝/ml的范围时,虽然两种检测方法数值之间无相关性,但均显示处于105以上的较高数值范围。结论NASBA与实时荧光定量PCR两种检测方法在3.5×103-1.0×105拷贝/ml范围内有着高度的相关性,国产实时荧光定量核酸检测试剂检测结果与国际上较常用的病毒载量检测方法的结果之间的差异已经缩小,在低载量的检测敏感性还需要进一步优化。总体来说,使用国产实时荧光定量核酸检测试剂可以初略定量血浆中HIV RNA含量。 相似文献
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目的 研究中国艾滋病病毒 1型 (HIV 1)AE循环重组型 (CRF0 1 AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应 (nested PCR)对从全国部分省收集来的HIV 1感染者血液样本中的HIV 1外膜蛋白 (env)基因进行扩增和亚型鉴定后 ,选择 3 4份CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株env基因V3~V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析 ,并计算和分析氨基酸同义替换 (Ks)值和非同义替换 (Ka)值及Ks Ka比值。结果基因系统树显示中国的 3 4份样本CRF0 1 AE重组型毒株与我国代表株AE .97CNGX2F和泰国代表株AE .CM 2 40、AE .93TH2 53聚集在一起。氨基酸替换主要发生在C3和V4区 ,而V3区和V3上游区氨基酸序列相对保守 ,糖基化位点也比较保守。V 3环顶端四肽以GPGQ为主 (87.50 % )。大部分毒株的第 3 0 6和 3 2 0位点上没有出现带正电荷的氨基酸。整个V 3~V4区的Ks值显著高于Ka值(P <0 .0 0 1) ,且Ks Ka比值显著高于 1(P <0 .0 0 1) ,只有V4区Ks Ka比值显著低于 1(P <0 .0 1)。结论 目前多数流行于中国的CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株具有较高的同源性 ,在进化上关系密切。氨基酸替换主要发生在C3和V4区 ,而不是V3区。由于大部分毒株的第 3 0 6和 3 2 0位点上没有出现带正电荷的 相似文献
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目的 追踪观察HIV-1新发感染者体内CRF07_BC重组毒株膜蛋白基因的变异性.方法 从HIV-1感染者血浆中提取总RNA,通过逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)获得HIV-1 gp120全长及C2-C5区段基因.纯化后装入T载体,转化至Top10大肠埃希菌内增殖,通过蓝白斑筛选获得阳性克隆,运用PCR方法进行鉴定,最后对所获得的目的克隆测序.结果从两个感染者血浆样品中获得感染后半年到2年半间多个时间点的gp120基因克隆共135个及gp120基因C2-C5区段克隆15个,分析显示这些克隆均为HIV-1 CRF07_BC亚型.随感染时间的延长,HIV-1 env基因的离散率与多样性均有增加的趋势.env基因同义突变与非同义突变比较结果显示,C1、C3与V4区段非同义突变比率比gp120基因的其他区域都高.基因多态性分析的结果显示,同一时间点内不同毒株基因在不同区段的变异是不同的,基因多样性介于0与0.066±0.028之间.结论 随着患者感染时间的推移,HIV-1膜蛋白基因的变异逐渐增大.C1、C3和V4区的高突变率提示,该基因区可能是HIV-1病毒生存与宿主免疫压力相互作用的主要位点. 相似文献
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目的:探讨利用K—medoids聚类分析方法来寻找典型病理图像。方法:对正常、低度和高度鳞状上皮内病变宫颈细胞的51个特征参数进行标准化处理,以消除原始变量数量及量纲影响。运用统计软件R对所有特征参数进行K—medoids聚类分析。结果:对于正常、低度和高度鳞状上皮内病变宫颈细胞的分类正确率分别为91.7%、98.0%和92,0%。作为类中心点的3个病理图片可作为典型病理图片指导临床及教学研究。结论:该方法简单、方便,客观性强,可应用到其他医学领域定量研究。 相似文献
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WHO奖学金项目是我国通过国际合作进行高层次卫生人力资源开发的重要形式之一。本文在对1995年至2002年我国派出的WHO留学生综合情况调查数据统计和分析的基础上,阐述了影响其工作业绩的若干因素,提出了提高该项目实施效益和管理效能的建议。 相似文献
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基于HL7的HIS与PACS/RIS集成 总被引:3,自引:1,他引:2
目的:将HIS与PACS/RIS集成,解决两套系统数据无法共享的问题,优化业务流程,满足医院日益增长的信息化需求。方法:通过利用医疗领域不同系统之间电子数据传输的标准协议HL7技术,开发HL7接口引擎,将两个系统紧密集成.实现数据完全共享。结果:HL7接口引擎开发完成后,解决了HIS与PACS/RIS的信息共享问题,提高了工作效率。结论:HL7技术成熟,符合国际标准,扩展性很好,既有助于提高诊疗质量,又能有效保证医院内部数据的一致性。 相似文献
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目的 通过研究人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus1,HIV-1)感染者个体内准种间的差异,探讨HIV的系统进化的发生模式。方法 从HIV-1感染者血浆中提取总RNA,通过逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)获得HIV.1gp120全长基因,纯化后装入T载体,转化至TOP10大肠埃希菌内增殖,通过蓝白斑筛选获得阳性克隆,对所获得的目的克隆测序并分析。结果 获得同一患者的16个克隆的gp120全长基因序列,通过系统进化树分析,克隆序列均为CRF07_BC亚型,但在系统进化树上16个克隆可明显分为A、B两群,其中13个克隆属于A群,2个克隆属于B群,1个克隆(编号XPD7)位于A、B群之间,通过simplot软件的重组分析,发现XPD7克隆为A群和B群的重组株。结论 发现了我国广泛流行的HIV-1CRF07-BC毒株准种间的重组现象,准种间的重组作为HIV进化的一种有效手段将导致HIV毒株的快速进化的发生,可能更易逃脱宿主的免疫监控。 相似文献