hsacirc0006867在结直肠癌组织中的表达及其临床意义北大核心

目的:探讨环状RNA hsa_circ_0006867在结直肠癌中的表达及其与临床病理因素的关系。方法:全转录组测序筛选结直肠癌中特异circRNAs表达谱,挑选出差异表达显著的hsa_circ_0006867,qRT-PCR检测54例结直肠癌组织及癌旁组织中hsa_circ_0006867表达情况,分析其表达水平与结直肠癌临床病理特征的相关性,ROC曲线分析hsa_circ_0006867在结直肠癌中的诊断价值。结果:测序获得circRNAs在结直肠癌中的差异表达谱,qRT-PCR验证hsa_circ_0006867在结直肠癌中表达下调(P<0.05)。其表达水平与肿瘤分化程度和远处转移有关(P<0.05)。ROC曲线显示hsa_circ_0006867诊断结直肠癌AUC为0.851(95%CI:0.775~0.927),当截断值为0.0146时,敏感度为88.46%(95%CI:0.770~0.946),特异度为73.08%(95%CI:0.598~0.832),差异具有统计学意义(P<0.001)。结论:hsa_circ_0006867在结直肠癌中表达下调,与相关临床病理特征密切联系,可作为潜在结直肠癌临床诊断指标。     

瘀热型慢性前列腺炎与心理性因素及性功能的相关性

目的分析瘀热型慢性前列腺炎(CP)临床症状与心理性因素及性功能的相关性。方法收集2020年6月至2021年6月在南京市江宁中医院泌尿外科门诊诊治的91例瘀热型CP患者的临床资料进行回顾性分析,使用美国国立卫生研究院慢性前列腺炎症状指数评分表(NIH-CPSI)、中医证候量表、7项广泛性焦虑障碍量表(GAD-7)、抑郁症筛查量表(PHQ-9)、疼痛灾难化量表(PCS)、国际勃起功能评分表(IIEF-5)和早泄诊断量表(PEDT)对患者进行评估,对量表评定结果进行Pearson相关性分析和多元线性回归分析。结果(1)症状量表:NIH-CPSI总分与中医量表总分、GAD-7总分呈正相关,中医证候量表总分与CPSI、GAD-7、PHQ-9、PCS、PEDT总分呈正相关(P<0.05);CPSI总分随中医量表总分递增而升高,中医证候量表总分随CPSI疼痛症状、PHQ-9总分递增而升高(P<0.05)。(2)情绪量表:GAD-7总分与CPSI、中医证候量表总分、排尿症状、PHQ总分、PEDT总分呈正相关,PHQ-9总分与中医证候量表总分、疼痛及排尿症状、PCS总分、PEDT总分呈正相关,PCS总分与中医证候量表总分及疼痛症状分值呈正相关(P<0.05);GAD-7总分随PHQ-9总分递增而升高;PHQ-9总分随中医证候量表排尿症状、GAD-7、PCS分值递增而升高;PCS总分随中医证候量表疼痛症状、PHQ-9分值递增而升高(P<0.05)。(3)性功能量表:IIEF-5总分与中医证候量表疼痛分值呈负相关,PEDT总分与中医证候量表总分及疼痛症状、GAD-7、PHQ-9分值呈正相关(P<0.05);IIEF-5总分随中医证候量表疼痛症状分值递减而升高(P<0.05)。结论瘀热型CP患者表现为以疼痛为主,伴随排尿异常、情绪异常、认知障碍和性功能障碍的系列症状,同时使用中医证候量表及CPSI评估能较好的反映其病情的严重程度。     

利用转录组测序生物信息学初步探讨热射病预后关键基因

目的分析热射病患者外周血单个核细胞转录组测序生物信息学结果,寻找影响热射病预后的关键基因。方法选取2019-06-01~2020-08-30空军军医大学附属西京医院急诊科收治的热射病患者,按照预后分为生存组和死亡组。随机数字法在两组中分别选取患者进行外周血单个核细胞转录组测序,生物信息学分析寻找差异基因;RT-PCR验证筛选出的差异基因在生存组和死亡组中的表达。结果29例诊断为热射病患者入选,按照预后分为生存组和死亡组,其中生存组18例,死亡组11例。随机数字法选取6例生存患者和4例死亡患者,外周血单个核细胞进行转录组测序,两组患者有693个基因表达有明显差异,通过生物信息学分析筛选出趋化因子(C-C基元)配体5(CCL5)、基质金属蛋白酶8(MMP8)、MMP9基因可能与预后相关。将两组外周血单个核细胞的目标基因表达情况通过RT-PCR法表达检测,与生存组比较,死亡组MMP8基因(P=0.8955)和MMP9基因(P=0.0597)表达无明显变化,CCL5基因表达明显上升(t=7.056,P<0.05)。结论CCL5基因可能是影响热射病预后的关键基因,需要进一步深入研究。     

基于贵州省人群队列的代谢综合征发病风险和影响因素分析

目的 探讨代谢综合征（MS）的发病风险和影响因素，为预防MS提供科学依据。方法 采取多阶段整群抽样方法，于2010年建立贵州省人群队列，排除基线MS患者后，共有7 136人进入MS随访队列，收集队列人群基线社会人口学信息、生活行为方式和生理指标，并于2016—2020年进行随访，最终纳入4 754人进行分析。采用COX比例风险模型分析MS的发病风险及其影响因素的HR（95% CI），并计算影响因素的人群归因危险度（PAF%）。同时根据基线人群的MS组分得分建立亚队列，分析亚队列人群MS的影响因素。结果 队列人群累计随访33 424.18人年，中位随访6.57年，新发MS 963人，MS发病密度为28.81/1 000人年。COX回归分析结果显示:年龄45～59岁（HR = 1.53，95%CI:1.32～1.77）、年龄≥60岁（HR = 1.53，95%CI:1.27～1.86）、城市（HR = 1.71，95%CI:1.47～1.99）、吸烟（HR = 1.22，95%CI:1.01～1.48）、每日油摄入＞30 g（HR = 1.16，95%CI:1.01～1.34）、每日盐摄＞6 g（HR = 1.22，95%CI:1.05～1.42）、静态时间≥4 h/d（HR = 1.16，95%CI:1.02～1.32）、超重（HR = 1.66，95%CI:1.44～1.92）、肥胖（HR = 2.27，95%CI:1.71～3.02）、静息心率70～80次/min（HR = 1.32，95%CI:1.11～1.58）和 ＞80次/min（HR = 1.28，95%CI:1.07～1.54)是MS的危险因素，其PAF%分别为17.47%、11.32%、19.52%、5.89%、11.33%、13.66%、7.01%、12.91%、5.30%、17.68%、13.92%，文化程度升高（HR = 0.75，95%CI:0.68～0.83）和饮茶行为（HR = 0.82，95%CI:0.71～0.95）是MS的保护因素，其PAF%分别为16.21%和6.97%。亚队列研究结果与总体结果相似。结论 不健康的生活方式和超重、肥胖、静息心率升高是MS的影响因素，应将中老年人和城市居民作为预防MS的重点人群，采取相应措施控制烟草消费、油盐摄入，维持正常体重和适当心率，提高人群知识水平，保持饮茶行为，预防MS发生。     

肺癌遗传易感差异表达miRNA的筛选及生物信息学分析

目的 肺癌是目前我国死亡率最高的恶性肿瘤,发病率和病死率持续升高,且预后较差,患者的5年生存率小于15％,严重威胁人们的健康。筛选肺癌遗传易感差异表达的miRNA,分析差异表达的miRNA的靶基因功能,可为进一步研究miRNA在肺癌发生发展过程中的作用提供实验基础。方法 采用高通量测序技术检测海南地区汉族肺癌患者和对照患者血清中差异表达的miRNA,通过生物信息学方法预测差异miRNAs的靶基因,并对靶基因进行GO功能富集分析、KEGG信号通路分析和蛋白相互作用分析。结果 肺癌患者和对照患者共筛选出3个显著差异表达的miRNA (P<0.05,|log2 (Fold Change)|≥1) ,且均呈下调状态。差异表达miRNAs所预测的靶基因显著参与癌症通路、 轴突导向通路、代谢通路,NUFIP2、PLAGL2、IGF1R基因编码的蛋白在互作网络中具有重要作用。结论 海南地区肺癌患者和对照患者间存在3个差异表达的miRNAs,这些miRNAs可能通过调控癌症、轴突导向、代谢等信号通路,调节下游靶蛋白参与肺癌的发生过程。     

基于网络药理学探讨黄精-百合药对抗癌作用的机制

目的:通过网络药理学的方法筛选黄精-百合药对中的有效成分,预测治疗癌症的作用靶点及信号通路,进一步探讨潜在作用机制。方法:使用全称为中药系统药理学分析平台筛选黄精-百合药对中的活性成分和靶点,通过基因疾病关联数据库(Dis Ge NET)与人类孟德尔遗传数据库(OMIM)预测与筛选药对中有效的中药成分作用的疾病靶点。选择生物信息分析学习平台(Omicshare)匹配药物和疾病的靶点,借助复杂网络可视化平台(Cytoscape3. 7. 0)软件构建"药物-成分-疾病"网络。采用蛋白质相互作用网络数据库(String)构建黄精-百合药对治疗癌症的靶点相互作用的网络。最后通过功能注释生物信息学分析平台(DAVID)对黄精-百合药对中关键作用的节点进行生物功能及代谢通路分析。结果:筛选出19个黄精-百合药对的活性成分,根据靶点预测技术预测出相关靶点234个,与疾病靶点有关的活性成分为6个,主要通过调控丝氨酸(Akt)/苏氨酸激酶1(Akt1),Jun原癌基因,AP-1转录因子亚基(JUN),血管内皮生长因子A(VEGFA),基质金属蛋白酶-9(MMP-9),半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)等靶蛋白,以及癌症中的蛋白多糖,雌激素信号转导通路,人免疫缺陷病毒1感染,缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,癌症中的微型核糖核酸(MicroRNAs)等通路发挥抗癌作用。结论:黄精-百合药对治疗癌症的作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其抗癌治疗的作用机制与物质基础提供了科学依据。     

灰毡毛忍冬LmC3H1基因的克隆及表达模式与绿原酸含量相关性分析

目的:以灰毡毛忍冬为材料,克隆对-香豆酸3-羟化酶(LmC3H1)基因,进行生物信息学和表达模式分析,结合绿原酸含量,研究推测灰毡毛忍冬LmC3H1基因的功能。方法:通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和RACE技术克隆LmC3H1基因的全长c DNA序列,对该序列进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)和HPLC分别测定灰毡毛忍冬茎、叶及不同花期花中LmC3H1的相对表达量及绿原酸含量。结果:克隆得LmC3H1(Gen Bank:MN177695)基因,开放阅读框(ORF)长度为1 533 bp,编码510个氨基酸,推测其分子式为C_(2618)H_(4134)N_(718)O_(727)S_(22),相对分子质量为58 005.32,等电点8.92,为亲水性蛋白,定位于叶绿体中,具有跨膜区域LLLIPAVLFLISLVYPLI,含有细胞色素P450的保守结构域CYTOCHROME_P450(422-433 aa);Real-time PCR结果显示,LmC3H1在灰毡毛忍冬茎、叶及不同花期花有不同程度的表达,其中在花发育阶段,白色花蕾期相对表达量最高,花蕾初期及白色开花期次之;白色花蕾期花与茎、叶比,花的相对表达量最高,叶的最低;HPLC结果显示,从绿白色花蕾期到金黄色开花期绿原酸含量呈上升趋势,金黄色开花期含量最高,不同器官中,花中绿原酸最高,茎最低。结论:克隆得到灰毡毛忍冬LmC3H1基因,推测LmC3H1可能参与灰毡毛忍冬花绿原酸的生物合成。该研究为进一步研究该基因的功能及探究灰毡毛忍冬绿原酸生物合成和调节机制提供了依据,同时为遗传改良灰毡毛忍冬品质奠定了基础。