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用文献轮廓挖掘鼻咽癌微阵列表达数据 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 探索鼻咽癌异常信号通路。方法 根据鼻咽癌微阵列表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取与基因相关的文献并分析词的频率.再根据重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后根据词的发生频率对基因进行功能聚类。结果 基因表达谱的112个差异表达基因聚成16组功能类别:4组暗示EBV感染、6组显示鼻咽癌变过程、2组参与能量代谢、1组提示蛋白的异常磷酸化、2组与其它疾病相关、1组与肌肉组织活性相关。肿瘤发生发展过程中常见的P53和Rb信号通路的异常在本研究中则未发现。结论 鼻咽癌的发生发展可能由特殊的信号通路引起。 相似文献
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本文根据相位测量电路和阻抗测量电路设计一种人体容抗测量电路。该电路输入阻抗大于10MΩ,输出直流信号,最小输入信号的电压经是5mV/Ω,容抗的测量范围是:1 ̄50Ω,精度是:0.1Ω,电路用于人体容抗的测量,精度和稳定度都达到0.1Ω。 相似文献
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目的探讨鼻咽癌是通过调节哪些靶基因的表达影响血管生成和淋巴管生成。方法以Sengupta等通过基因芯片数据(其中含10例正常鼻咽组织,31例鼻咽癌组织)分析所得的831个鼻咽癌与正常鼻咽组织差异表达基因为基础,根据最新的基因组信息以及设定差异表达值的最小阈值260,筛选出246个有效基因。对这246个基因进行基于文献挖掘的基因功能分析和网络构建,最后进行通路分析。结果 246个基因与鼻咽癌、EB病毒、转移、血管生成、淋巴管生成、侵袭等关键词特异相关。其中,52个基因已知与血管生成相关(P=0.00001),19个基因构成了血管生成基因网络(P=0.0042);21个基因已知与淋巴管生成相关(P=0.00001),6个基因构成了与淋巴管生成相关基因网络(P=0.0226)。包含PTGS2在内的8个基因参与NFκB信号通路已知在小细胞肺癌中与血管生成密切相关(P=7.87E-07)。包含STAT1及CXCL10等在内的5个基因参与了Toll样受体通路(P=0.00176)。结论 PTGS2和NFκB共同调控鼻咽癌血管生成,Toll样受体信号通路可能与淋巴管生成密切相关。它们的相互作用方式值得进一步研究。 相似文献
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目的寻找新的大肠癌转移相关基因。方法根据大肠癌转移芯片的表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后基于词的发生频率对基因进行功能聚类,进一步结合文献及已有的分子生物学检测结果进行分析。结果发现两个新的可能与大肠癌转移相关的基因TIAM1和NM23H1。 相似文献
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一种新的六电极人体阻抗测量方法 总被引:1,自引:0,他引:1
目前的阻抗分段测量方法是人体成分测量比较精确的办法,但这种测量方法比较复杂,费时较长而且电极费用较高。新方法只需人站在脚踏板上,双手抓住手握架,解决了上述问题,对二十四个人采用同一台阻抗测量仪用新方法与旧方法进行对比实验,结果一致性很好。 相似文献
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本文介绍了一种利用转录因子结合位点应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行预测的方法.实验结果证明该方法具有较高的准确性. 相似文献
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目的 探索鼻咽癌异常信号通路。方法 根据鼻咽癌微阵列表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取与基因相关的文献并分析词的频率,再根据重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后根据词的发生频率对基因进行功能聚类。结果 基因表达谱的112个差异表达基因聚成16组功能类别:4组暗示EBV感染、6组显示鼻咽癌变过程、2组参与能量代谢、1组提示蛋白的异常磷酸化、2组与其它疾病相关、1组与肌肉组织活性相关。肿瘤发生发展过程中常见的P53和Rb信号通路的异常在本研究中则未发现。结论 鼻咽癌的发生发展可能由特殊的信号通路引起。 相似文献
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目的探究两组鼻咽癌活检组织样本中差异基因表达谱所显示的失调基因功能及通路的相同之处。方法利用生物信息学的方法分析两组差异表达基因谱,对比其失调的基因功能及通路,同时探索其相同的失调功能与两组数据间相同的基因的关系。结果两样本中显著上调的基因主要与细胞的周期调控、增殖、DNA损伤修复、细胞的粘附迁移、代谢及蛋白质结合等相关,但是显著下调的基因无明显的功能聚类;两差异基因表达谱显示出的相同失调基因功能并不是完全由它们的相同基因引起;两者共同失调的通路有10条,排在前4位的为白细胞内皮迁移、细胞粘附分子、粘着斑和磷脂酰肌醇信号系统。结论来自两个不同地区的鼻咽癌活检组织样本的比较发现,其差异表达的基因多与细胞周期调控、DNA损伤修复、粘附迁移等相关,这与临床治疗首选化疗的原因相符;通路分析得出4条差异最显著的共同通路也与肿瘤粘附迁移相关,通过干扰其在肿瘤中的病理作用,特别是磷脂酰肌醇信号系统在肿瘤发生、粘附及转移等关键步骤中的信号传导作用,有望提高鼻咽癌的治疗效果及预后。 相似文献
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用文献轮廓挖掘大肠癌转移芯片表达谱 总被引:16,自引:2,他引:14
目的 寻找新的大肠癌转移相关基因。方法 根据大肠癌转移芯片的表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后基于词的发生频率对基因进行功能聚类,进一步结合文献及已有的分子生物学检测结果进行分析。结果 发现两个新的可能与大肠癌转移相关的基因TL4M1和NM23HI。 相似文献