贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株的CRISPR基因型和遗传多样性研究北大核心CSCD

目的了解贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株规律的成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)的基因型及遗传多样性,为贵州省沙门菌病的预防控制提供依据。方法对分离自2013—2018年贵州省7个市(州)的71株疑似鼠伤寒沙门菌单相变异株进行系统生化鉴定及血清分型,结合双重PCR法确定疑似菌株为鼠伤寒沙门菌单相变异株。提取鼠伤寒沙门菌单相变异株的DNA作为模板,进行CRISPR1和CRISPR2的PCR扩增,将阳性扩增产物进一步测序,获得菌株的CRISPR1和CRISPR2间隔序列,根据间隔序列的组成,确定CRISPR基因型,并使用Bionumerics软件对菌株进行遗传多样性分析。结果71株疑似鼠伤寒沙门菌单相变异菌株经系统生化鉴定、血清分型及双重PCR法鉴定为鼠伤寒沙门菌单相变异株,经CRISPR1和CRISPR2两个位点的PCR扩增和产物测序,71株菌共检测到163个间隔序列,其中CRISPR1有102个,CRISPR2有61个。联合CRISPR1和CRISPR2两个位点的间隔序列进行分析,发现71株菌被分为33个CRISPR基因型(TSTs),其中TST11和TST1为贵州省的优势基因型,分别占总菌株数的25.35%和12.68%。71株菌经Bionumerics软件聚类分析后被分为A、B、C、D 4个簇,A簇包含的菌株最多,B簇包含的基因型最多,不同来源的3株参考株独立成簇,D簇包含7个TSTs基因型。结论贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株具有优势的CRISPR基因型和遗传多样性的特点,可能有其他的感染来源。     

一起由A群脑膜炎奈瑟菌引起的流行性脑脊髓膜炎暴发

目的探讨贵州省流脑暴发疫情的流行特征和控制措施。方法对德江县2005年的一起流脑暴发疫情调查资料和实验室结果进行了分析。结果21例病人中5-15岁年龄组占76.19%。全部病例既往无流脑疫苗接种史。病人脑脊液和密切接触者咽拭子标本中分离出7株A群脑膜炎奈瑟菌。菌株对磺胺、头孢曲松和利福平敏感。结论早期明确诊断和报告、将流脑疫苗纳入计划免疫应该是今后贵州省控制流脑疫情的关键。     

贵阳市甲型副伤寒沙门菌耐药性分析

目的了解贵阳市甲型副伤寒沙门菌的耐药状况及其变迁,为临床用药、应急药品储备及预防服药等提供依据。方法采用WHO推荐的改良K—B法,对贵阳市2000—2007年部分甲型副伤寒沙门菌进行药敏实验。结果贵阳市甲型副伤寒沙门菌对多种抗菌素耐药,合计耐药率93．2％,其中,萘啶酸耐药率最高89．0％,其次是头孢噻吩7．5％,复方新诺明、头孢噻肟和氯霉素的耐药率分别为2．7％、2．1％和1．4％。头孢噻吩的耐药率呈上升的趋势。双耐药、三重耐药及四重耐药菌株主要采集于甲型副伤寒高流行县区。结论贵阳市甲型副伤寒沙门菌存在多重耐药性,可能是其流行原因之一;耐药性日趋严重,提示药敏监测对该地区甲型副伤寒流行控制有重要意义。     

贵州省2000年甲型副伤寒沙门菌分离株16SrRNA基因型分析

近年来贵州省出现甲型副伤寒的流行。为探讨贵州省不同地区甲型副伤寒流行菌株的分子流行病学特征以及菌株间的相关关系 ,对贵州省 6个地 (市 ) 2 0 0 0年部分甲型副伤寒沙门菌分离株进行染色体DNA基因限制性酶切 16srRNA探针杂交图谱分析。PstⅠ酶切后进行的杂交显示 6 4株均为一个基因型 ,然后进一步采用BglⅠ、SalⅠ两个内切酶对其中部分菌株进行酶切杂交分析 ,核糖体杂交谱上仍没有差异 ,分析认为同一个克隆群的菌株广泛传播是造成贵州省甲型副伤寒流行的主要原因.     

贵阳市2008-2010年市售水产品霍乱弧菌污染状况调查

目的了解贵阳市市售水产品霍乱弧菌污染状况,为制订预防控制霍乱的措施提供依据。方法 2008-2010年采集贵阳市水产品批发市场甲鱼、牛蛙及其养殖水标本,培养分离霍乱弧菌和鉴定菌株,对检出的霍乱弧菌采用PCR方法进行CT毒力基因检测。结果从234份水产品标本中检出霍乱弧菌20株,检出率8.55%;O1群18株(90%),小川型8株,稻叶型10株,O139群2株(10%);其中甲鱼检出率3.37%(3/89),牛蛙检出率17.05%(15/88),养殖水检出率3.51%(2/57)。牛蛙与甲鱼、养殖水检出率差异有统计学意义(χ2=13.03,P<0.01),牛蛙中霍乱弧菌检出率较高。2010年与2008年、2009年检出率差异有统计学意义(χ2=10.14,P<0.01),2010年霍乱弧菌检出率较高。20株霍乱弧菌均未检出CT毒力基因。结论贵阳市水产品中存在霍乱弧菌污染,以O1群为主,均为非产毒株,需继续加强水产品中霍乱弧菌的监测,及时发现传染源,以便积极防控。     

贵阳市412例腹泻病例空肠弯曲菌的检测分析

目的建立常规的空肠弯曲菌检测方法,了解贵阳市腹泻人群空肠弯曲菌的感染状况。方法采用简单生化及多重PCR方法对贵阳市412例腹泻人群进行空肠弯曲菌检测。结果 412份腹泻标本中,7份空肠弯曲菌阳性,平均检出率1.70%。1岁以下婴幼儿感染率与其它人群差异无统计学意义(P>0.05)。男女患者感染率差异无统计学意义(P>0.05)。粘液便空肠弯曲菌检出率(7.69%)显著高于水样便(0.60%)(P<0.01)。结论利用简单生化及多重PCR方法能很好地检出空肠弯曲菌;贵阳市腹泻人群中存在空肠弯曲菌的感染,且主要感染婴幼儿,需加强婴幼儿腹泻中空肠弯曲菌感染的监测。     

贵州省甲型副伤寒沙门菌耐药性质粒特征分析

贵州是内陆贫困山区省，是肠道传染病高发区。80年代中期以来，伤寒和副伤寒发病率和发病数常居全国首位，己形成点多面广，散发与暴发并存的局面。近年甲型副伤寒(以下简称副甲)病例逐年增多，2000年伤寒和副伤寒暴发疫情中副甲占了近50％。本文针对贵州省副甲发病增加趋势，对2000年及2001年全省收集的副甲菌125株，从形态学、皿清学、药物敏感性、质粒图谱和质粒限制性内切酶图谱等方面，结合流行病学背景资料进行综合分析，为贵州省副甲控制策略的制定提供科学依据。     

4株气单胞菌临床分离株基于gyrB和rpoB基因序列的分子鉴定

目的对4株气单胞菌临床分离株进行菌种的分子鉴定,为气单胞菌的种型鉴定提供病原学依据。方法对4株系统生化鉴定为气单胞菌的菌株,提取核酸作为模板,分别使用gyrB、rpoB基因进行扩增及产物测序,将所得序列在GenBank中进行同源性搜索,与GenBank中已经公布的同源性较高的气单胞菌序列比较构建系统发育树并进行分析。结果 4株气单胞菌gyrB基因序列经同源性搜索,与多株嗜水气单胞菌和豚鼠气单胞菌同源性为99%,rpoB基因序列则与多株豚鼠气胞菌同源性为99%~100%,对gyrB基因和rpoB基因序列分别进行系统发育树分析显示,4株气单胞菌菌株在gyrB基因系统发育树中与多株嗜水气单胞菌和豚鼠气单胞菌聚为一簇,而在rpoB基因系统发育树中与多株豚鼠气单胞菌聚在同一分枝内。结论 4株气单胞菌经rpoB基因测序分析明确鉴定为豚鼠气单胞菌,gyrB基因测序分析不能有效鉴定其种型。     

贵州省紫云县伤寒副伤寒潜在流行因素研究

目的探讨紫云县城区伤寒副伤寒流行的潜在传染源和可能的传播途径,为当地伤寒防制和监测提供依据。方法采集大便(饮食服务人员、患者和其密切接触者)、凉拌食品和排污沟水等标本检测伤寒等肠道致病菌,并用个案调查表调查饮食等服务人员、患者及其密切接触者的个人行为卫生习惯和危险因素,用Excel 2000统计分析。结果从141例饮食服务人员的大便中检出丙型副伤寒杆菌1株,检出率0.71%;17份血培养阳性愈后患者的大便分离到1株甲副。饮食等服务人员、患者和其密切接触者均有不同程度的不良卫生习惯。患者中25%就诊前自购药物,66.67%未及时就诊;67.86%未住院治疗,住院者平均住院6.17d,平均用药时间为8.26d。结论患者不规范治疗所致带菌、从业人员的健康带菌是伤寒副伤寒传播流行的潜在传染源。个人不良卫生习惯是伤寒副伤寒等肠道传染病发生、传播、流行的高危行为。     

贵州省猪链球菌病监测结果分析

目的了解贵州省人及表观健康猪群感染猪链球菌的情况,以便为采取有效措施提供依据.方法选取罗甸、遵义、黎平、丹寨等4县做监测点,采集人感染猪链球菌疑似病例的血液、脑脊液及表观健康猪群扁桃体、鼻拭子进行病原菌的分离鉴定.结果从2006年至2011年,在人间病例监测中,从1例报告疑似病例的血液及脑脊液中检出Ⅱ型猪链球菌.宿主动物监测中,共采集表观健康猪群扁桃体和鼻拭子标本3969份,检出各类链球菌及球菌94株,李斯特菌1株.结论在猪链球菌病监测中,罗甸县发现1例人感染猪链球菌病例;表观健康猪群未分离到Ⅱ型猪链球菌.