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1.
目的:调查H7N9流行初始江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体水平及其影响因素?方法:分别使用香港株?广东株与安徽株抗原,用血清凝集抑制法(hemagglutination inhibition,HI)测定血清样本抗体滴度,计算几何平均滴度(geometric mean titer,GMT),统计分析影响抗体水平的因素?结果:检测职业暴露人群血清标本416份,性别与抗原株对职业暴露人群抗体滴度有显著影响?结论:江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体滴度普遍较低?男性抗体滴度低于女性,广东株抗原与禽流感病毒现有流行株较为接近?  相似文献
2.
目的:建立一种较优的高通量测序H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法,用于H7N9禽流感病毒基因组监测?方法:分别以6碱基随机引物反转录生成单链cDNA,合成双链cDNA;流感病毒通用反转录引物U12反转录生成单链cDNA,6碱基随机引物合成双链cDNA;U12引物反转录生成单链cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备高通量测序模板?构建测序文库?测序并分析数据,比较3种方法对高通量测序效率的影响,并与传统Sanger测序方法比较其测序的准确性,选择其中较优的方法用于高通量测序?结果:以U12引物反转录cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备的高通量测序模板,在测序族生成数?覆盖率?单核苷酸多态性及读长等方面均优于另外两种方法?结论:本研究建立的H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法用于高通量测序具有准确性高,周期短,成本相对较低,可同时检测多个样本等特点,可用于大规模H7N9禽流感病毒基因组监测?  相似文献
3.
目的:从分子水平分析2009—2013年江苏省分离汉坦病毒(Hantavirus,HV)的型别及变化,为疾病的预防控制提供实验依据?方法:采集2009—2013年江苏省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本?采用胶体金法检测血清样本中汉坦病毒的IgM?IgG抗体,采用免疫荧光检测鼠肺样本中汉坦病毒抗原,并用VERO E6细胞分离病毒,RT-PCR检测标本培养物中病毒M片段以鉴定HV病毒,采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析?结果:分离到的11株病毒与陕西分离株LR1?四川分离株S85-46以及汉坦病毒原型株76-118遗传距离最为接近,属于汉滩(Hantean,HTN)型病毒?分离株与2002年分离的江苏(A9?HTN型)株以及浙江株?安徽株处于不同的进化分支上,表明遗传关系较远?结论:江苏的汉坦病毒优势株发生了变化,而且发生了宿主转换?目前疫苗仍具有保护效力,但需加强监测?  相似文献
4.
目的:分析江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)变异情况,分析其遗传进化特征?方法:按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定?选取2013年不同时间段?不同地区具有代表性的14株甲型H1N1(09pdm)阳性毒株,利用特异性引物扩增HA?NA基因,测序并分析其遗传进化特征?结果:14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%?NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%?遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系?分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N?K300E?E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异?从2013年左右开始甲型H1N1(09pdm)流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179?180?239?301?303?310?311?312?313(含位点310),5个正向压力选择NA氨基酸位点4?23?52?287?374(含位点4)?HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点?14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异?结论:2013年江苏省甲型H1N1(09pdm)流感HA?NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注?  相似文献
5.
目的:从江苏省2012年4月1例菲律宾输入的疑似登革热患者急性期血清中分离病毒并分析其分子生物学特征,以找出病原学证据?方法:收集患者血清样本,采用胶体金法检测登革病毒的IgM?IgG抗体;用C6/36细胞分离病毒,对细胞病变的标本进行RT-PCR及荧光定量PCR检测登革病毒RNA和鉴定型别;采用高通量测序技术对该分离株进行编码区基因测序,用MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析?结果:从患者血清样本中检测到登革病毒的IgM抗体,分离到的毒株经鉴定为登革病毒1型,与美国HawO3663毒株的核苷酸同源性>98%?结论:该病例是由登革病毒1型引起的输入性病例?  相似文献
6.
为探讨栀子苷对甲型H1N1病毒的抑制效应,进行了相关体内外实验研究。体外实验中采用MTT法判定栀子苷对MDCK细胞的毒性作用。以帕拉米韦为阳性对照药,根据MTT比色值,观察栀子苷对甲型H1N1流感病毒感染的MDCK细胞的细胞病变效应(cytopathic effects,CPE),计算不同给药方式(预防给药、直接灭活及治疗给药)及不同药物剂量干预下,栀子苷对甲型H1N1流感病毒的抑制效率;体内实验以甲型H1N1流感病毒感染ICR小鼠,建立甲型H1N1流感病毒小鼠肺炎模型,比较栀子苷不同剂量干预下,小鼠肺指数、肺组织病理学检查及小鼠存活率。实验结果显示,栀子苷的细胞毒性小,其TD50大于1 040 μmol/L;栀子苷在预防、直接灭活及治疗给药方式下,对甲型H1N1流感病毒感染的MDCK细胞抗病毒EC50分别为91.90、96.25和87.68 μmol/L,对CPE有明显抑制作用;栀子苷可显著降低甲型H1N1流感病毒感染小鼠的肺指数、减轻肺组织炎症损伤、降低小鼠死亡率、延长生存时间。实验结果表明,栀子苷在体外能有效抑制甲型H1N1流感病毒对MDCK细胞的CPE,在体内能有效保护甲型H1N1流感病毒对小鼠肺部的攻击作用,可能为流感病毒的防治提供一个新的选择。  相似文献
7.
目的 了解掌握南京地区某大学短期内增多不明原因腹泻病例的病原学特点,为科学防控可能的流行提供科学依据.方法 收集南京地区某大学2011年3月3日~8日因腹泻就诊的12例患者的肛拭子或咽拭子进行病原学检测,包括细菌的常规分离培养及病毒的荧光定量PCR检测和测序分析.结果 细菌分离鉴定未发现致病菌.病毒学检测,6例(3例肛拭子和3例咽拭子)诺如病毒核酸阳性,经测序分析为GII.4亚型.未检测到轮状病毒、星状病毒及腺病毒.结论 南京地区存在诺如病毒的威胁,导致该大学短期内腹泻病例增多的病原是诺如病毒.与其他国家和地区一样,GII.4亚型为主要感染亚型,应加强相应的抗病毒感染健康教育工作.  相似文献
8.
目的:了解江苏省手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)肠道病毒阳性检出率相关因素,并对其EV71病毒的VP1基因特征进行分析?方法:在2008年4~12月份,通过监测哨点医院收集全省手足口病病例的咽拭子?粪便或肛拭子?疱疹液?脑脊液?血清标本,并填写病例相关基本信息?结果:共采集手足口病病例的各种类型标本2 082份,咽拭子?肛拭子?疱疹液?粪便?脑脊液?血清的总肠道病毒阳性检出率分别为53.52%?41.12%?40.74%?27.27%?25.00%?9.80%,EV71阳性检出率分别为47.03%?30.84%?33.33%?22.73%?25.00%?2.94%,CoxA16阳性检出率分别为5.34%?8.41%?3.70%?0.00%?0.00%?6.68%,不同类型标本的肠道病毒阳性检出率和阳性检出构成均有差异(P值均< 0.0001)?总肠道病毒阳性检出率在发病后第2天最高(56.59%),不同发病与采样时间间隔的总肠道病毒阳性检出率和EV71病毒阳性检出率均有统计学意义(P值分别为0.0019?0.0139),而与CoxA16阳性检出率没有统计学意义(P = 0.2558)?总肠道病毒阳性检出率在就诊后第2天最高(59.90%),不同就诊与采样时间间隔的总肠道病毒与EV71病毒阳性检出率有统计学差异(P值分别为0.0228?0.0333),与CoxA16阳性检出率没有统计学差异(P = 0.3958)?分离的4株EV71病毒均为C4.3基因亚群?结论:标本类型?采样与发病时间间隔?采样与诊断时间间隔均与手足口病病例的肠道病毒阳性检出率密切相关,分离的EV71毒株为C4亚型?  相似文献
9.
目的:分析甲型H1N1流感患者发生重症临床表现的危险因素?方法:调查江苏省2009年6~12月间甲型H1N1流感确诊病例,利用统一设计的调查表收集信息,应用SAS 9.1.3软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析重症危险因素和风险比值比(OR值)?结果:单因素Logistic回归分析显示,年龄?发病与首次就诊时间间隔?体重指数(BMI)?妊娠和慢性基础性疾病史为导致重症的影响因素(P < 0.01)?多因素Logistic回归分析显示,年龄?发病与首次就诊时间间隔?BMI和慢性基础性疾病史进入了最终模型(P < 0.05),其中慢性基础性疾病史对模型贡献最大(标准化回归系数β=0.72),其他依次为年龄(β=0.43)?BMI(β=0.35)和发病与首次就诊时间间隔(β=0.25)?因素合并分析显示,发病风险随着危险因素数量的增加而增加,存在剂量效应关系(P < 0.01)?结论:有慢性基础性疾病史?5岁以下儿童和年龄较大者?超重或肥胖者为甲型H1N1流感重症高危人群,感染甲型H1N1流感应尽量早期就诊,减少重症情况的发生?  相似文献
10.
目的 建立利用液相芯片技术检测甲、乙型流感和H5N1亚型高致病性禽流感病毒的方法,并对该方法进行评价.方法 对GenBank中甲型流感病毒的NP、乙型流感病毒的HA以及高致病性禽流感病毒(H5N1)的H5、N1基因片段序列进行同源性比对,根据保守序列,设计针对各基因的简并引物和寡核苷酸探针,制备探针偶联微球,将样本核酸多重PCR扩增产物与微球进行杂交,以Bio-Piex液相芯片检测系统进行芯片检测.结果 该方法可以对甲型流感病毒的NP基因、乙型流感病毒的HA基因以及高致病性禽流感病毒(H5N1)的H5、N1基因同时进行检测,病毒核酸的最低检出量为1pg,检测特异性高.结论 成功构建了甲、乙型流感病毒和H5N1亚型高致病性禽流感病毒液相芯片检测系统,为流感、禽流感的快速检测、诊断奠定了基础.  相似文献
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