唐氏综合征胎儿全基因组miRNA表达谱特征及其染色体分布

目的研究唐氏综合征(DS)胎儿全基因组miRNA表达谱及其编码基因的染色体分布特征。方法采用Illumina深度测序技术对6例DS胎儿(DS组)和6例正常胎儿脐带血(对照组)单个核细胞小RNA测序比对分析,确定DS全基因组miRNA表达谱及其编码基因的染色体分布特征。结果两组共检测到395种miRNA,编码于316个miRNA基因。其中149种miRNA在两组中的表达具有显著性差异(DS组中6种上调,143种下调),有51种miRNA特异性表达于对照组。21号染色体编码的14个miRNA基因在DS组中有1个(miR-802)高表达,4个(let-7c、miR-99a、miR-125b和miR-155)低表达,余下9个在两组样本中均未表达。两组样本miRNA基因表达的染色体分布趋于一致,但miRNA基因表达丰度的分布却不尽相同:DS组主要分布于8、16、17和21号染色体,对照组主要分布于3、8、14、16、17和22号染色体。结论 DS胎儿脐带血单个核细胞具有其特定的miRNA表达谱和染色体分布特征,表达丰度差异分布的染色体编码miRNA可能在DS各临床性状的形成过程中具有重要作用。     

6σ质量管理理论在电化学发光法测定肿瘤标志物中的应用

目的 探讨六西格玛(6σ)质量管理理论在电化学发光测定肿瘤标志物中的应用.方法 根据Westgard等报道的方法计算σ值,分别选用以生物学变异确定的"合适"及"理想"允许总误差(TEa)为质量目标,不精密度(CV%)源于为该室室内质控累积CV%,不准确度(Bias%)源于卫生部临床检验中心肿瘤标志物室间质评结果.结果 不同质量目标有不同的σ值及不同的质控方案.结论 合理地采用质量目标,结合6σ质量管理理论指导质量控制方案的设计,适合于临床检验质量管理.     

唐氏综合征胎儿21号染色体上新微小RNA基因的鉴定和功能分析

目的：利用Solexa高通量深度测序技术鉴定21号染色体上新的微小RNA(miRNA)基因,为阐明21号染色体功能、探索唐氏综合征(DS)患者新的治疗靶点提供依据。方法：收集5例经染色体核型分析诊断为DS胎儿的脐带血和3例正常胎儿脐带血,分析染色体核型;提取胎儿脐带血单个核细胞总RNA,构建小RNA文库,采用Solexa高通量深度测序、计算机分析、Stem-loop RT-PCR法鉴定 miRNA基因并分析其生物学功能。结果:血染色体核型分析,5例DS胎儿脐带血显示DS标准核型,3例正常胎儿脐带血显示正常核型;在DS胎儿脐带血中共发现21个新miRNA,其中仅1个候选miRNA来源于21号染色体,位于21号染色体的“DS关键区域”,命名为“miR-nov21”,后者在DS胎儿脐带血单个核细胞中表达水平高于正常胎儿。生物学功能分析,miR-nov21可调节211个靶基因共215个位点,与基因的表达、细胞分化的调节、胚胎形态的发生和心脏的发育有关。结论: 21号染色体“DS关键区域”存在1个新的miRNA基因--miR-nov21。     

IgA肾病患者肾脏组织中差异表达microRNAs的筛选

目的了解IgA肾病患者肾脏组织全基因组miRNA的表达特征及其作用。方法分别收集6例IgA肾病患者肾穿组织和6例镜下病理检查正常的肾皮质组织,运用Illumina高通量测序技术分别对其miRNA表达水平进行检测,比较分析两组miRNA的表达差异,并运用生物信息学技术对其功能进行初步分析。结果在两组样本中具有显著性差异表达的miRNA有168种,其中在IgA肾病组中表达上调的有33种,表达下调的有135种;另外还有30种miRNA在对照组中特异性表达。结论IgA肾病患者与对照组样本的组织miRNA表达有显著性差异。miR-148b、miR．152可能与IgA1分子糖基化缺陷有关,而miR-200家族、miR-23b、miR-126和miR-192等可能在肾脏病理改变中起重要作用。     

唐氏综合征胎儿脐带血单个核细胞microRNA差异表达研究

目的检测唐氏综合征(Down syndrome,DS)胎儿和正常胎儿脐带血单个核细胞全基因组microRNA(miRNA)的差异表达。方法运用Solexa高通量测序技术对6例DS胎儿(DS组)和6例正常胎儿(对照组)脐带血单个核细胞miRNA表达水平进行检测,比较分析2组miRNA表达的差异,并用Stem-loop qRT-PCR对Solexa测序结果进行验证。结果 2组样本显著性差异表达miRNA有167种,8种miRNA在DS组样本中表达上调,159种miRNA表达下调;还有38种和139种miRNA分别特异性表达于DS组和对照组样本中;21号染色体上5个miRNA,除miR-802在DS组中高表达外,miR-99a、let-7c、miR-125b和miR-155均低表达。结论 DS胎儿和健康胎儿脐带血单个核细胞miRNA的表达差异显著,可能与DS胎儿免疫系统的发育缺陷及DS胎儿循环T、B淋巴细胞数目的减少有关;差异显著和特异性表达的miRNA可作为DS胎儿潜在的产前筛查诊断指标。     

强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞微小RNA的差异表达

目的 探讨强直性脊柱炎患者和健康对照组外周血单个核细胞已知微小RNA(miRNA)差异表达.方法 分别构建10例强直性脊柱炎患者和9例健康对照组外周血单个核细胞小RNA文库,并运用新一代高通量Solexa测序技术,进行外周血单个核细胞已知miRNA的检测;运用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)进一步验证部分差异miRNA表达.结果 在强直性脊柱炎患者与对照组中小RNA文库中,共获得小RNA总量分别是7511 859和10 178 958,比对上基因组部分小RNA分别是6052911 (80.58％)和8 476 243(83.27％);已知miRNA分别是267和231个,通过miRNA差异性分析,129个上调miRNA和28个下调miRNA,其表达水平差异有统计学意义(P＜0.05);FQ-PCR进一步验证了let-7b-3p、miR-146a-5p、miR-155-5p、let-7g-5p和miR-323a-5p差异表达水平与Solexa测序结果相似趋势.结论 强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞miRNA的差异表达,可能与强直性脊柱炎发病密切相关.     

病理程度不同IgA肾病患者血清代谢的差异性研究

目的寻找诊断IgA肾病潜在的生物标志物,并探讨其代谢途径。方法原发性IgA肾病患者35例(IgA肾病组),其中低危组23例,高危组12例,同期体检健康者23名为对照组,采用基于质谱核磁共振代谢组技术结合模式识别分析各组血清代谢物的差异。结果对照组与IgA肾病组血清代谢物比较差异有统计学意义(P<0.05);低危组和高危组血清代谢物比较差异无统计学意义(P>0.05);共筛选出24种IgA肾病的特征代谢物。结论应用质谱核磁共振代谢组技术成功建立了IgA肾病血清代谢诊断模型。     

唐氏综合征患儿外周血全基因组miRNA表达谱及染色体分布研究

目的：分析唐氏综合征（Down syndrome,DS）患儿与健康儿童外周血单个核细胞miRNA表达谱及其染色体分布特征。方法：采用Illumina测序技术分别对6例DS患儿（DS组）和6例健康儿童（对照组）外周血单个核细胞全基因组miRNA表达谱进行差异表达和染色体分布特征分析,并用Stem-loop qRT-PCR对差异表达miRNA的测序结果进行验证。结果：两样本共表达911个miRNA,编码于738个miRNA基因,在两样本中的染色体分布趋于一致,但表达丰度染色体分布却不同,DS组主要分布于7、13和21号染色体,而对照组主要分布于7和13号染色体。此外,911个miRNA中有114个miRNA在两样本中差异表达显著（差异倍数≥2且P≤0.001）,其中DS组有103种高表达,包括21号染色体编码的5个miRNA（miR-99a、let-7c、miR-125b、miR-155和miR-802）;11种低表达。结论：DS患儿外周血单个核细胞具有其特定的miRNA表达谱和染色体分布特征,两样本表达丰度差异分布染色体编码miRNA的差异表达可能与DS患者免疫缺陷等相关临床症状的形成有关。     

IgA肾病患者全基因组miRNA表达谱的特征及其染色体分布

目的:调查研究IgA肾病(IgA-N)患者全基因组miRNA的表达及其编码基因的染色体分布特征.方法:运用Illumina高通量测序技术分别对6例IgA-N患者肾活检组织和6例肾癌患者癌旁正常组织的全基因组miRNA表达水平进行检测,比较分析两组miRNA的表达差异,并对其编码基因的染色体分布情况进行分析.结果:在两组样本中共检测到370种具有显著性差异表达的miRNA,共同表达的miRNA有249种(在IgA-N组中53种表达上调,196种表达下调),另外还有4种和117种miRNA分别特异性表达于IgA-N组和对照组.两组样本miRNA基因表达的染色体分布趋于一致,染色体1、7、9、14、17和X对疾病的贡献值较高.结论:IgA-N患者肾脏组织具有特定的miRNA表达谱和染色体分布特征.染色体7、17、X可能在IgA1糖基化异常过程中起重要作用.