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1.
目的 开发一套能高效准确地从GWAS Catalog公开数据库中筛选全基因组关联研究(GWAS)的R脚本。方法 参考既往研究制定GWAS的筛选原则。将人工在GWAS Catalog的筛选过程抽象为标准的算法,2名程序员共同撰写R脚本(gwasfilter.R)后,由他人多次对脚本进行测试。结果 采用gwasfilter.R筛选GWAS包含6个步骤。该脚本内置5个主要函数,可以同时根据“是否有验证人群”“样本量大小”和“研究人群种族”等条件对GWAS进行筛选。筛选单个性状时,程序用时不超过1秒。结论 gwasfilter.R操作简便,筛选过程高效而标准化,可灵活应用于GWAS筛选。脚本源代码网址:https://github.com/lab319/gwas_filter。 相似文献
2.
Python网络爬虫技术是一种通过模拟用户的网络浏览行为以实现从网络中自动、大量提取信息的技术,是信息流行病学研究收集并整合多源异构信息数据的关键基础。Python网络爬虫可分为简单爬虫与大型爬虫,集数据采集与数据库构建于一体,语法简洁、灵活性高、学习成本低、维护成本低。它适用于信息流行病学的各种应用场景,通过对互联网中健康相关信息的分析,实现多种公共卫生监测、健康干预实施及效果评价、智慧寻医方略优化等目标。近年,我国政府开始鼓励对含互联网信息在内的多源大数据的整合利用,在此背景下,Python爬虫技术的应用场景势必会越来越多,相应的人才培养、技术革新建议纳入到公共卫生教育和科研体系之中。 相似文献
3.
我国新型冠状病毒肺炎疫情逐步控制,当下对无症状感染者的管理和风险评估成为亟待解决的问题。无症状感染者主要通过密切接触者筛查、聚集性疫情调查、传染源追踪调查、对部分人员开展主动检测等途径发现。目前关于无症状感染者造成疾病传播的风险研究有限,并且缺乏大规模社区人群无症状感染者分布的数据支持。以核酸检测为主要手段的病原学检测适用于已发现的确诊病例和无症状感染者密切接触者等重点人群筛查,应及早开始;而抗体检测更适用于传染来源不明的一般人群中无症状感染者的筛查。对无症状感染者的管理,目前按照“早发现、早报告、早隔离、早治疗”的要求,严格集中隔离和医学观察。 相似文献
4.
目的 探讨浏阳市成年人主要慢性病患病情况及对健康状况自我评价的影响。 方法 利用“中国慢性病前瞻性研究”(CKB)浏阳市项目点59 916名30~79岁常住居民有效基线调查数据,通过logistic回归分析调查对象健康状况自我评价情况及其主要影响因素。 结果 共分析调查对象59 916人,平均年龄(51.57±10.54)岁,文化程度以高中为主,占58.6%,67.4%的居民年收入在2~4万之间。92.88%的人健康状况自我评价好,7.12%评价较差。调查人群高血压、糖尿病、慢阻肺患病率分别为33.7%、3.46%、7.36%,高血压、糖尿病患病率女性均高于男性(均P<0.01),慢阻肺患病率男性高于女性(P<0.01)。高血压知晓率、糖尿病知晓率分别为36.70%和55.00%。健康状况自评情况在不同年龄组、性别、婚姻状况、医保情况、是否患慢性病之间等构成比差异有统计学意义(均P<0.01)。糖尿病对健康状况自我评价为差的风险最大(OR=2.95,95%CI:2.61~3.33),其次为慢阻肺(OR=2.59,95%CI:2.35~2.84),高血压(OR=1.55,95%CI:1.44~1.67)。男女性慢性病患者均认为糖尿病对自我健康状况影响最大(女:OR糖尿病=3.04, OR慢阻肺=2.69,OR高血压=1.39,男:OR糖尿病=2.84, OR慢阻肺=2.59,OR高血压=1.83)。年龄大、单身是影响自我健康状况好的危害因素。有医保、收入越高、体重指数大是自我健康状况的保护因素。 结论 慢性病患者其健康状况自我评价明显差于正常人群;糖尿病对居民健康状况自我评价影响最大,高血压的危险性可能被低估。需加强健康生活方式行为干预。 相似文献
5.
[目的]比较不同卵型、年龄组双生子间体重、身高和体质量指数(BMI)的差异,为研究遗传与环境对生长发育的影响提供基础数据。[方法]通过2013年在上海市范围内实施的中国环境流行病学人群队列研究双生子队列上海项目,入户调查收集双生子体重、身高、BMI等指标,通过方差分析计算上述3项指标的差值及其差比率在不同卵型、不同年龄段双生子间的差异。[结果]最终纳入本研究的双生子共3 089对,其中同卵1 772对,异卵1 317对。除60岁及以上男性双生子外,各年龄组同卵双生子间体重、身高和BMI差的差异均小于异卵双生子(P0.05)。未发现20岁及以下双生子间3项指标差比率随年龄段不同而不同(P0.05)。[结论]相较于环境因素,遗传因素在体重、身高方面起着更重要的作用。 相似文献
6.
目的 分析中国成年人吸烟与不同心血管疾病发病风险的关联及其性别差异。方法 研究对象来自中国慢性病前瞻性研究,基线调查开展于2004年6月至2008年7月,剔除基线自报患有恶性肿瘤、冠心病、脑卒中的个体,最终纳入487 373名研究对象。随访人年数的计算从研究对象完成基线调查时开始,至最早出现以下任一事件的时间为止:心血管疾病(CVD)发病、死亡、失访或2015年12月31日。使用Cox比例风险模型计算吸烟行为特征和心血管疾病发病风险的关联。结果 研究对象平均随访8.9年。随访期间新发缺血性心脏病33 947人,急性冠心病事件6 048人,脑内出血7 794人,脑梗死31 722人。男性吸烟率(67.9%)远高于女性(2.7%)。与非吸烟者相比,吸烟能增加各类CVD结局的发病风险,风险效应值HR值 (95%CI)由大到小依次为急性冠心病事件1.54 (1.43~1.66)、缺血性心脏病1.28 (1.24~1.32)、脑梗死1.18 (1.14~1.22)、脑内出血1.07 (1.00~1.15)。当前吸烟者中,每天吸烟量和开始吸烟年龄与急性冠心病事件风险间的关联存在性别差异(性别交互作用P值分别为0.006、0.011),主要表现为女性吸烟者风险高于男性。每天吸烟量和开始吸烟年龄与缺血性心脏病、脑内出血和脑梗死之间的关联均未见性别差异(性别交互作用P>0.05)。结论 吸烟能够增加各类CVD的发病风险,而女性吸烟者发生急性冠心病事件的风险远高于男性。 相似文献
7.
目的 研究哈尔滨市人群的饥荒暴露对中老年期糖尿病、肥胖、高血压、冠心病和脑卒中等慢性病患病风险的影响。方法 以中国慢性病前瞻性研究(China Kadoorie Biobank,CKB)项目哈尔滨市的基线调查人群为研究对象,采用回顾性队列研究设计,应用logistic分析比较饥荒暴露人群与非饥荒暴露人群中老年期糖尿病、肥胖、高血压、冠心病和脑卒中等慢性病患病风险的差异。结果 调整影响因素后,饥荒暴露人群的肥胖(OR=1.204,95% CI:1.104~1.313,P<0.01)、高血压(OR=1.315,95% CI:1.210~1.429,P<0.01)和冠心病(OR=1.495,95% CI:1.369~1.632,P<0.01)的危险性高于非饥荒暴露人群。饥荒暴露年龄越小,中老年期各种慢性病发生风险越大。结论 饥荒暴露是肥胖、高血压和冠心病的危险因素。保证生命全过程,尤其是生命早期和青少年期的营养充足对预防中老年期肥胖、高血压和冠心病具有重要意义。 相似文献
8.
医学大数据、转化医学、精准医学时代为慢性复杂疾病及其病因的研究带来新的契机。如何实现循证医学、科学转化、合理精准是我们目前面临的任务和挑战。系统流行病学是一种进行疾病危险因素风险识别的流行病学方法,是流行病学的新领域,其利用系统生物学、流行病学、计算数学等技术将健康大数据与系统生物学结合起来,在分子、细胞、组织、人群社会行为和生态环境等多水平、多组学上深入研究疾病发生风险的统计学模型,并对未来风险状况进行计算模拟和预警预测。由于数据来源的多样性、复杂性以及大数据的特征,为系统流行病学的设计方法和分析方法提出了新的挑战。本文详细介绍了系统流行病学的理论基础、概念、研究目的、研究内容、研究意义、研究设计、分析方法及其在公共卫生领域的应用。 相似文献
9.
电视胸腔镜手术治疗巨大肺大疱并发症的防治 总被引:3,自引:2,他引:3
目的:总结电视胸腔镜手术治疗巨大肺大疱的并发症防治经验。方法:对11例巨大肺大疤行电视胸腔镜手术,8例辅助小切口手术。结果:术后漏气5例,肺复张不全2例,复张性肺水肿1例,复发气胸1例。结论:主要并发症是术后漏气,术中细致处理、配合使用生物蛋白胶厦使用Endo—GIA是预防漏气的主要措施,对于漏气,延长留置胸管时间多可治愈。 相似文献
10.
目的通过体外循环下心脏不停跳组和停跳组心肌细胞的存活情况,心肌酶变化,讨论体外循环下心脏不停跳和停跳手术的心肌保护效果。方法将66例心脏手术患者分为不停跳组(n=30)和停跳组(n=36),分别在体外循环转机前和停机时取右心耳心肌组织,用原位DNA标记技术,在光学显微镜下观察心肌细胞存活情况。结果不停跳组和停跳组心肌细胞存活情况在转机前差异无统计学意义(P〉0.05),但在停机时不停跳组比停跳组增高。结论心肌细胞存活情况在不停跳组比在停跳组高,不停跳手术要比停跳手术显示更好的心肌保护效果。 相似文献