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1.
背景与目的 结直肠癌(CRC)是全球第三大最常诊断的恶性肿瘤和第二大癌症死亡原因。最新指南推荐所有的CRC患者需要进行微卫星不稳定(MSI)的检测。MSI患者往往具有错配修复蛋白缺失(dMMR)。MSI/dMMR状态已被用作生物标志物预测对免疫治疗的有利反应和预后。然而MSI特征基因及其与肿瘤浸润的免疫细胞的关系未进行阐述。因此本研究通过使用机器学习的方式发掘CRC中新型的MSI特征基因,并且验证其的诊断价值及其与免疫细胞浸润的关系。方法 按照纳入排除标准,将GEO数据库中GSE39582数据集作为训练集,将TCGA数据库中COAD数据集作为外部验证集。使用机器学习的方法(LASSO回归、SVM-RFE算法),在GSE39582结直肠癌数据集中筛选MSI特征基因,并在TCGA结直肠癌数据中进行验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线和曲线下面积(AUC)评价基因对MSI的诊断效能。CIBERSORT算法评估肿瘤样本浸润的免疫细胞成分,Spearman相关性分析验证MSI特征基因和免疫细胞的关系。结果 训练集共纳入536例CRC患者,其中高频MSI(MSI-H)77例(14.37%)。在验证集中,共计389例CRC患者,其中MSI-H 67例(17.22%)。基线资料分析显示,MSI-H/dMMR CRC的TNM分期存活率优于低频MSI(MSI-L)或微卫星稳定(MSS)/错配蛋白完整(pMMR)CRC(P<0.05)。在GSE39582数据集中,LASSO回归筛选MSI特征基因21个,SVM-RFE算法筛选基因6个,结合两种算法确定MSI特征基因为EIF5A、CXCL13、HNRNPL、HOXC6、RPL22L1、Y16709。在TCGA数据库中进一步验证MSI特征基因的诊断效能,研究发现EIF5A的诊断效能最高。在训练集和验证集中,EIF5A的AUC值分别为0.922和0.805。同时,Spearman相关性分析发现,EIF5A主要与CD8+T细胞,活化的树突状细胞,辅助性T细胞,M1型巨噬细胞,γδT细胞,中性粒细胞成正相关;与CD4+记忆性T细胞,M2型巨噬细胞,静止树突状细胞,嗜酸性粒细胞,调节性T细胞呈负相关。结论 CRC的新型MSI特征基因分析结果表明,EIF5A对CRC MSI的诊断具有较好的诊断作用和临床价值,同时提示EIF5A与免疫细胞及免疫微环境相关。因此,EIF5A可能成为免疫检查点治疗的新型标志物。 相似文献
2.
目的建立同时测定产灵丸(防风、苍术、白术等19味药物)中升麻素苷、5-O-甲基维斯阿米醇苷、苍术素醇和苍术素4种成分的高效液相色谱法。方法色谱柱为依利特C18柱(250 mm×4.6 mm,5μm);以乙腈-水为流动相进行梯度洗脱;流速为1.3 mL/min;检测波长:254 nm(升麻素苷、5-O-甲基维斯阿米醇苷)、337 nm(苍术素醇、苍术素);柱温为30℃。结果升麻素苷、5-O-甲基维斯阿米醇苷、苍术素醇和苍术素质量浓度分别在5.22~104.40μg/mL(r=0.999 3)、4.95~99.00μg/mL(r=0.999 7)、4.89~97.80μg/mL(r=0.9995)、6.34~126.80μg/mL(r=0.999 2)时与其峰面积线性关系良好;平均加样回收率分别为98.79%、97.21%、100.07%、96.90%,RSD(n=6)分别为1.19%、1.13%、0.89%、0.85%。结论该定量测定方法简便、结果准确可靠并且重现性好,可作为产灵丸中升麻素苷、5-O-甲基维斯阿米醇苷、苍术素醇和苍术素的质量控制。 相似文献
3.
目的:优化新疆阿魏种子中总倍半萜香豆素的提取工艺。方法:以乙醇体积分数、料液比、提取时间为自变量,在单因素试验的基础上,应用Box-Behnken中心组合设计建立数学模型,以总倍半萜香豆素提取率为响应值,进行响应面分析。结果:最佳提取工艺条件为80%乙醇加热回流提取40 min,料液比为1∶40。总倍半萜香豆素提取率预测值为6.60%,实际值为6.62%,相对误差为0.3%。结论:该优选工艺稳定可靠,为新疆阿魏资源的合理利用提供参考。 相似文献
4.
目的 建立大鼠失血性休克复苏模型,观察肉苁蓉总苷(cistanche total glycosides, CTG)对缺血再灌注肾损伤的保护作用。方法 将SD大鼠随机分为3组: 假手术组、实验组(休克复苏组)、CTG处理组,每组各10只。实验组和CTG处理组建立肾缺血-再灌注模型,治疗组大鼠给予CTG 400mg/kg腹腔注射,实验组和假手术组注射生理盐水。分别检测各组血肌酐含量、尿素氮含量、胱抑素C以测定肾功能,流式细胞分析技术检测肾脏细胞凋亡率;酶联免疫法(ELISA)检测大鼠肾组织X-染色体连锁凋亡抑制蛋白(X-linked inhibitor of apoptosis protein, XIAP)表达。结果 CTG组与实验组比较,血Cr、BUN和胱抑素C均明显降低(P<0.01),肾脏细胞凋亡减少(P<0.05),CTG可显著提高XIAP的表达(P<0.05)。结论 肉苁蓉总苷对大鼠缺血再灌注肾损伤具有保护作用,可能与促进XIAP的表达有关。 相似文献
5.
目的:系统评价罗格列酮、吡格列酮等噻唑烷二酮类药物(TZD)治疗氯米芬(CC)抵抗型多囊卵巢综合征(PCOS)不孕患者的疗效。方法:计算机检索Pubmed、Embase、Cochrane Library、Web of Science、CNKI、维普、生物医学文献、万方等数据库,检索时间截止至2015年1月。由两名评价者按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的方法学质量后,采用Rev Man 5.3软件进行Meta分析。结果:最终纳入4个随机对照研究,222例CC抵抗型PCOS不孕患者。Meta分析结果表明,TZD组在排卵率、妊娠率、成熟卵泡数、改善卵泡刺激素(FSH)、黄体生成素(LH)、睾酮(T)方面均优于对照组,其中提高排卵率[MD=2.14;95%CI(1.16,3.95),P=0.02]、妊娠率[MD=2.02;95%CI(1.14,3.58),P=0.02]、增加成熟卵泡数[MD=0.82;95%CI(0.61,1.04),P<0.01]及降低LH值[MD=-1.18;95%CI(-1.76,-0.60),P<0.01]等4个结局指标的两组间差异具有统计学意义。结论:对于生育要求较强、经济条件好且胰岛素抵抗较严重的CC抵抗型PCOS患者,可首选TZD预治疗。 相似文献
6.
目的探讨低分子肝素钙预防腰椎退行性疾病术后深静脉血栓形成(DVT)的有效性和安全性。方法回顾性分析广安市广安区人民医院68例腰椎退行性疾病患者的临床资料,术后均采用抗凝预防血栓形成,按照术后预防DVT所采用方式的不同分为对照组和低分子肝素钙组。分析比较2组患者术后引流量、切口愈合情况、DVT发生率、皮下瘀斑情况、血小板数值、凝血功能、D-二聚体。结果术后2组患者引流量、切口愈合情况、皮下瘀斑情况、凝血功能相关指标比较,差异无统计学意义(P>0.05)。术前和术后1、10 d 2组患者血小板数量的变化差异无统计学意义(P>0.05)。DVT发生率2组患者比较差异有统计学意义(P<0.05)。术前及术后1 d 2组患者D-二聚体比较,差异无统计学意义(P>0.05);术后10 d,对照组患者D-二聚体显著增加,2组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论腰椎退行性疾病术后使用低分子肝素钙进行抗凝,可以显著降低DVT的发生率,具有良好的安全性。 相似文献
7.
目的 提高门诊处方的合理率,保证病人用药安全。方法 利用焦点循环管理法(FOCUS-PDCA)对湖北医药学院附属东风医院2015年1月(干预前)和6月(干预后)的门诊处方进行回顾性评价,采用FOCUS对存在的问题进行整理分析,制订解决方案,采用PDCA法进行实施。结果 门诊处方不合格率由17.34%(366/2 110)下降到6.68%(115/1 700),与干预前对比,处方合理率明显得到提升(P<0.05),通过FOCUS-PDCA管理模式,成员的责任心、沟通交流、解决问题的能力都得到了极大的提升。结论 FOCUS-PDCA可以有效的提高门诊处方的合理率,提升药学服务质量。 相似文献
8.
<正>小李是一个电器修理员,每天都为了生活而忙碌奔波,有时连水都喝不上一口,上厕所也不方便。尤其是最近工作比较辛苦,加上天气比较炎热,身体有些"小恙"。小李发现自己尿的颜色很黄,并且有一点腰部酸痛、尿频尿急的症状。因此,小李百忙之中去了一趟医院并做了一个尿常规检查,拿到检查结果的小李去向医生询问检查结果,医生给出的回答是小李患 相似文献
9.
目的探明鼠类肠道细菌群落组成和多样性。方法分离鼠类完整肠道并提取总DNA,利用Oxford Nanopore Technologies公司(MK1C)的纳米孔单分子测序技术对其肠道细菌16S rRNA的全区序列进行测序,统计肠道细菌的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析其物种组成、丰度及Alpha、Beta多样性。结果获得鼠类肠道细菌16S rRNA优质序列1161377条,根据序列相似性进行聚类分析获得1484个OTUs。共注释到24个门,48个纲,113个目,241个科和534个属;在门分类水平上,以厚壁菌门Firmicutes和变形菌门Proteobacteria为优势门类;在属分类水平上,优势属为肠球菌Enterococcus、乳酸杆菌Lactobacillus和葡萄球菌Staphylococcus,其丰度分别为38.7%,17.65%和7.48%。Alpha多样性分析结果显示,鼠类肠道细菌的观测物种数、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1484、1825.77、3.91和0.058。Beta多样性分析结果显示臭鼬和小家鼠肠道菌群组成最接近,而黄胸鼠和小家鼠肠道菌群组成相差最大。结论鼠类肠道细菌菌群整体多样性比较丰富,可为有效评估鼠传疾病传播风险提供依据。 相似文献
10.
20世纪90年代初兴起的循证医学(Evidence—based medi-eine,EBM)带来了临床医学的深刻变革,正强劲地推动着全球医学从经验医学模式向循证医学模式的转变。循证医学作为一种全新的医学思维方式已被越来越多的医学工作者接受和在实际工作中不断运用。随着医学临床实践模式的转变,如何适应、完善新的临床医学人材的培养教育模式,培养适应我国经济社会发展需要的高素质的神经外科医生和神经科研人才,是我们急待解决的问题。 相似文献