小鼠穿孔素在杆状病毒表达系统中的克隆与表达

穿孔素是机体发挥细胞毒作用的重要效应物质,在抗肿瘤、抗病毒及寄生虫治疗中有着重要的意义,但它在动物体内的含量极少,不便于进一步研究及新药开发,用基因工程方法来表达生产穿孔素是将小鼠的穿孔素是将小鼠的穿孔素基因在杆状病毒表达系统中进行克隆与表达。表达产物经ＳＤＳ－ＰＡＧＥ检测,薄层扫描确定表达量为细胞总蛋白的２５％,表达量在第４ｄ达到最高,其发挥溶血红细胞活性的最佳Ｃａ＾２＋浓度为２ｍｍｏｌ／Ｌ。穿     

胆管癌中异柠檬酸脱氢酶基因突变潜在靶基因的鉴定

目的鉴定胆管癌中异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变的潜在靶基因。方法下载TCGA胆管癌项目的DNA甲基化、转录组数据。将IDH突变型肿瘤与IDH野生型肿瘤进行比较,分别通过limma和DESeq2进行差异甲基化位点和差异表达分析。对差异表达基因的表达量进行标准化处理并与相应差异甲基化位点的甲基化水平进行Spearman相关性分析。筛选出高甲基化、低表达且两者呈负相关的基因进行富集分析以探究其功能。构建蛋白质互作网络并通过MCODE筛选出核心模块。结果分析得到11605个差异甲基化位点,其中10427个位点高甲基化;而735个差异表达基因中有651个基因下调,其中的143个基因与328个高甲基化位点形成330对强负相关组合。上述143个基因富集于表皮生长因子受体信号通路、细胞外渗及细胞分裂的调控,通过构建蛋白质相互作用(PPI)网络筛选出核心模块的10个基因,分别参与了上皮细胞的分化发育、细胞蛋白质定位等生物学过程。结论本研究通过整合TCGA胆管癌DNA甲基化和转录组数据,得到了IDH突变所影响的潜在靶基因并确定其PPI网络核心模块,为阐明IDH突变在胆管癌发生发展中的作用提供了新的线索。     

长链非编码 RNA Gm15577参与小鼠小脑神经元增殖与分化

目的鉴定新的参与奈美亨综合征（ NBS ）小鼠模型中与小脑发育缺陷相关的长链非编码RNA（ lncRNA）,并探讨其与小脑增殖分化相关的功能。方法利用芯片技术分析野生型（野生组,Nbs1CNS-ctr）小鼠及Nbs1神经元特异性敲除（突变组,Nbs1CNS-del）小鼠小脑中RNA的表达差异;利用即时荧光定量PCR技术对芯片结果加以验证;针对目的RNA,检测其全身表达及小脑中表达模式、细胞内定位以及对母基因的表达调控模式。结果 lncRNA Gm15577是由神经生长调节因子-1（ Negr1）基因内部的内含子区反向转录而成,特异性表达于小脑,且在其发育过程中呈动态变化趋势,而Nbs1缺失之后整体表达水平显著降低;同时,与未分化期比较,分化后的小鼠小脑原代神经前体细胞中Gm15577及其母基因Negr1均有显著升高;Gm15577敲低之后导致Negr1以及小脑增殖分化相关因子Shh与β-catenin 在RNA水平的表达显著下调;人髓母细胞瘤临床样本数据分析表明Negr1基因在正常人群与肿瘤患者之间有显著的表达差异。结论从神经特异性敲除Nbs1小鼠模型出发报道了一个新的与小鼠小脑发育相关的lncRNA Gm15577,初步结果表明Gm15577通过调控Negr1进而影响小脑神经元增殖与分化进程中的Shh与β-catenin信号通路,其基因行为异常有可能与髓母细胞瘤发病有一定的相关性。     

YTHDC1基因在小鼠小脑发育及人髓母细胞瘤组织中的动态表达

目的探讨RNA m~6A甲基化结合蛋白(YTH结构域包含蛋白1,YTHDC1)在小脑发育和髓母细胞瘤中的表达模式及其可能发挥的作用。方法分别以小鼠小脑、人髓母细胞瘤和细胞系为研究对象,在转录组测序结果的基础上,分析RNA水平表达模式;用免疫印迹和免疫组化检测YTHDC1蛋白的表达;在Daoy细胞中敲低甲基转移酶METTL3并通过m~6A-IP-qPCR方法检测YTHDC1 RNA甲基化水平及对YTHDC1蛋白丰度的影响。结果小鼠小脑发育过程中YTHDC1 RNA水平未见明显改变,蛋白表达显著下降(P0.05)。YTHDC1在P7的小脑内颗粒神经元高表达,而在P60小脑中表达降低。与正常或癌旁组织相比,YTHDC1在肿瘤组织中RNA水平未见明显改变,蛋白水平总体偏低(P0.05)。YTHDC1在髓母细胞瘤中RNA m~6A甲基化水平显著升高(P0.05),而METTL3敲低引起YTHDC1 m~6A甲基化水平下降以及蛋白表达上调。结论小鼠小脑发育及人髓母细胞瘤中YTHDC1蛋白表达变化显著,这一过程受到m~6A甲基化介导的转录后调控作用,进而影响小脑发育及髓母细胞瘤的发生。     

人白细胞介素—10的克隆和表达

构建了含有人白细胞介素－１０基因的重组质粒并在大肠杆菌中进行非分泌表达。表达蛋白经还原性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定Ｍｒ１８０００，经酶联免疫测定具有免疫活性，薄层扫描测知表达效率约２１．６％。本实验为进一步研制人白介素－１０的基因工程药物奠定了基础。     

与小鼠小脑发育相关的一种长非编码RNA Gm2694的鉴定

目的鉴定与小鼠小脑发育相关的长非编码RNA,并验证其各剪接变异体的存在。方法用芯片技术分析小鼠小脑发育不同阶段RNA的表达差异;用实时定量PCR技术对芯片结果加以验证;针对目的 RNA,验证其各剪接变异体的存在及在小鼠小脑中的表达量。结果 1)长非编码RNA Gm2694在小鼠小脑发育过程中呈动态变化趋势;2)其在小鼠小脑中特异性表达;3)在小鼠小脑中检测到Gm2694有8种表达水平各不相同的剪接变异体,其中除Ensembl数据库预测的7个之外,发现了1个新的表达于小脑的剪接变异体。结论 Gm2694是一种在小鼠小脑特异性表达的长非编码RNA,存在8种表达量各不相同的剪接变异体。     

RNA m6A去甲基化酶ALKBH5基因敲除对老年小鼠小脑形态和功能的影响

目的观察RNA m6A去甲基化酶ALKBH5基因敲除之后对老年小鼠小脑形态和功能的影响, 探究ALKBH5在小脑退行性病变中的作用。方法免疫印迹实验检测不同年龄C57BL/6野生型小鼠(包括2月龄、6月龄、12月龄、18月龄)小脑中ALKBH5的蛋白水平。通过免疫组织化学实验检测中年(12月龄)及老年(18月龄)野生型小鼠和ALKBH5基因敲除(ALKBH5-/-)小鼠中NeuN、Calbindin-D28K、MAP2、胶质纤维酸性蛋白等蛋白的表达情况。平衡木实验和步态实验检测小鼠平衡能力以及运动协调能力。结果 ALKBH5蛋白在小脑中的表达水平随着小鼠生理性衰老的进行而逐渐升高。在中年小鼠中, 野生型和ALKBH5-/-小鼠的体重、脑重以及小脑的形态大小没有明显差别, 同时颗粒神经元、浦肯野细胞及神经元树突的形态和数量均未见明显改变。在老年小鼠中, 相较于野生型小鼠, ALKBH5-/-小鼠的体重、全脑重和小脑重分别下降15%、10%和21%(P<0.05)。ALKBH5在浦肯野细胞中的表达高于其他类型的神经细胞, 与之对应在老年ALKBH5-/-小鼠中浦肯野神经元的数量下降4...