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产气荚膜梭菌是自然界常见的致病菌,广泛分布于人类和动物的胃肠道、食品和环境中,已被美国、欧盟部分国家及日本列为食源性疾病暴发的主要原因之一。 近年来产气荚膜梭菌感染在全球呈上升趋势。 目前该菌的分子流行病学方面研究较多,常用的分子分型方法包括脉冲场凝胶电泳、多位点序列分型、核心基因多位点序列分型、单核苷酸多态性分析、毒素分型等。 分子分型技术对研究产气荚膜梭菌的暴发溯源、流行情况、遗传演化规律与种群特征具有重要意义,同时分子分型方法的不断创新与改进能够提高产气荚膜梭菌感染检测与诊断的有效性、准确性。 相似文献
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目的建立并优化产气荚膜梭菌β2毒素编码基因(cpb2)和非典型cpb2(aty-cpb2)的PCR检测方法, 分析2016-2021年中国9个地区cpb2流行特征和遗传多态性。方法使用PCR方法对188株产气荚膜梭菌菌株的cpb2进行检测, 通过全基因组测序获取cpb2序列以分析其遗传多态性, 使用Mega 11、Makeblastdb软件对110株产气荚膜梭菌所携带的cpb2构建系统发育树并建库, 通过Blastn算法比对后得出cpb2两种不同基因型, 即共有cpb2(con-cpb2)和aty-cpb2之间的序列相似性。结果针对产气荚膜梭菌cpb2和aty-cpb2建立及改进的PCR检测方法的特异性好。cpb2的PCR检测结果与全基因组测序结果高度一致(Kappa=0.946, P<0.001)。来自中国9个地区的菌株中共有107株菌携带cpb2, 94株A型菌株携带aty-cpb2, 6株A型菌株携带con-cpb2, 7株F型菌株携带aty-cpb2。两种不同基因型的cpb2核苷酸序列相似性为68.97%~70.97%, 相同基因型的cpb2核苷酸序列相似性为98.00%... 相似文献
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目的 分析山东省某地区临床及动物中分离的产气荚膜梭菌的分子型别及耐药特征。方法 对山东省56株产气荚膜梭菌进行PFGE、MLST分子分型、药敏试验和耐药基因检测,比较分析同一来源菌株内部和不同来源菌株间的型别和耐药特征。结果 56株产气荚膜梭菌分为53个PFGE型,有50株菌表现出独特的型别。MLST分型将其分为46个ST型,其中40种ST型仅包含一株菌。本研究中菌株均对万古霉素,美罗培南和头孢西丁表现为敏感;对甲硝唑、青霉素、莫西沙星和氯霉素的耐药率相对比较低,分别为3.57%、7.14%、8.93%和1.79%;然而,对克林霉素的耐药率高达53.57%,人类来源菌株与动物来源菌株的耐药谱呈现出较为明显的差异。基于全基因组的耐药基因分析显示,所有56株产气荚膜梭菌均携带mprF基因,其次是tetA(P)(98.21%),tetB(P)(87.5%)以及ermQ (51.79%)。结论 我国山东某地区临床来源与动物来源产气荚膜梭菌耐药谱存在显著差异,同一地区的菌株分子型别具有很强的多样性。需要开展更全面的的系统监测为制定控制措施提供流行病学依据。 相似文献
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