2021—2022年郑州市流行性感冒监测结果

目的 分析郑州市流行性感冒(流感)流行特征,为流感防控提供依据。方法 采用流行病学分析方法,描述性分析2021—2022年郑州市流感监测哨点医院报告的流感样病例(influenza like illnell, ILI)特征。对流感病毒核酸检测阳性的ILI咽拭子标本进行病毒分离,选取25株进行流感病毒HA和NA基因序列测定与分析。结果 2021—2022年郑州市2 658例ILI病例中,流感病毒核酸检测阳性376例,阳性率为14.15%。5～<15岁年龄组阳性率最高,为23.62%,职员组阳性率最高,为20.19%,不同年龄组、不同职业间阳性率比较,差异均有统计学意义(χ²分别为113.241、188.639,P均<0.05);呈现明显的季节性,高峰分布于2021年10月—2022年3月,以及2022年8—10月。流感暴发疫情2021年报告12起,2022年4起,均为学校疫情。阳性标本中,乙型流感Victoria系(Bv系)322份,占85.64%;甲型H3型54份,占14.36%。与当年疫苗株比较,病毒株基因序列HA基因和NA基因核苷酸同源性,14株B...     

2015-2020年郑州市乙脑网络监测实验室确诊病例分析

目的 分析2015-2020年郑州市乙脑网络监测实验室确诊病例监测结果,为科学防控乙脑提供依据.方法 对乙脑疑似病例进行IgM抗体检测,分析确诊病例的流行特征.结果 2015-2020年郑州市乙脑网络监测实验室收集272例乙脑疑似病例,经实验室确诊139例.2016年确诊病例最多占42.45％(59/139).确诊病例...     

咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%）,其次是鼻拭子标本（34.3%）,咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%, N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义（P均＞0.05）,一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4）,因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。     

咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%）,其次是鼻拭子标本（34.3%）,咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%, N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义（P均＞0.05）,一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4）,因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。     

采样液与核酸提取试剂的匹配性对新型冠状病毒核酸检测结果的影响

目的 分析采样液对新型冠状病毒核酸提取效率的影响，为完善实验室质控措施提供依据。方法 对两批不同品牌采样管（A/B）采集的新型冠状病毒待测标本，分别用两种不同厂家生产的提取试剂（甲/乙）进行核酸提取，用同一品牌的扩增试剂和扩增仪器进行实时荧光RT-PCR检测，分析其检测结果。结果 两种提取试剂对于A采样管的提取效率差异有统计学意义（P<0.05），乙提取试剂阳性检出率高于甲试剂（66.67%vs 20.83%）,ORF1ab平均Ct值低于甲试剂（31.1 vs 38.2）,N基因平均Ct值低于甲试剂（29.9 vs 35.2）。两种提取试剂对于B采样管的提取效率差异不明显（P>0.05）。结论 不同采样管与不同提取试剂匹配效果不同，实验室质量控制中性能验证应加强采样管（液）与提取试剂的匹配性验证。     

河南省急性呼吸道感染病例人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶基因特征分析

目的了解河南省急性呼吸道感染(ARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV3)血凝素-神经氨酸酶(HN)的基因特征。方法对河南省漯河市采集的严重急性呼吸道感染(SARI)病例标本和郑州市采集的流感样病例(ILI)标本进行人副流感病毒(HPIVs)核酸检测, HPIV3检测阳性标本使用RT-PCR法进行HN基因扩增并测序, 使用CExpress以及MEGA7.0软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果漯河市和郑州市共采集ARI咽拭子标本374份, 其中HPIV3核酸检测阳性标本20份(5.3%), 对阳性标本进行靶基因扩增后获得18条序列, 经分析全部为C3亚群, 其中有16条序列为C3f基因型, 有2条序列为C3a基因型。18株HPIV3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%～100.0%和99.3%～100.0%, 与原株型Wash/47885/57相比差异较大, 发生了12处共同的氨基酸突变, 其中H295Y、I391V、D556N和I53T是功能相关突变位点。与流行株China/BCH4210A/2014相比同源性较高, 未发生共同的氨基酸突变, 未发现新的功能...