乙肝病毒核心蛋白序列特征的生物信息学分析北大核心CSCD

目的乙型肝炎病毒C基因编码的核心(HBc)蛋白抗原性强,也与持续性病毒感染有关。采用生物信息学方法分析HBc蛋白的结构和序列特征,有助于HBc蛋白的优化表达和纯化,并为乙肝患者的治疗以及疫苗的研制提供参考。方法乙肝病毒HBc序列的获取来源于NCBI网站GenBank数据库。运用Prot-Param和ProtScale工具在线预测乙肝病毒HBc的理化性质及其亲疏水性;通过在线软件SignalP 4.0Server和TMHMM分别分析该序列的信号肽特征,跨膜区域及磷酸化位点;利用SOPMA和SWISS-MODEL全自动在线软件预测其二级结构和三级结构模型;利用IEDB Analysis Resource,ABCpred和SYFPEITHI HLA-A;02:01预测该蛋白抗原表位,利用Venny2.1.0工具筛选该蛋白最佳表位形成位置等。结果HBc蛋白由212个氨基酸组成,分子式为C_(1086)H_(1710)N_(314)O_(300)S_(12),分子质量单位为24.35017ku,理论等电点为9.49。为不稳定亲水性蛋白质。该蛋白质具有信号肽,没有跨膜区域,具有40个潜在的磷酸化位点。预测其主要二级结构为α螺旋和无规卷曲,含量分别36.32%和41.04%。结合HBc蛋白序列的T、B细胞表面抗原、表面可及性、β转角、线性表位的预测结果,发现HBc蛋白具有T、B细胞抗原表位,并且存在4个潜在的优势抗原决定簇区域,分别为37-38、110、158-164、180-208位氨基酸。结论生物信息学方法预测HBc蛋白存在潜在的抗原表位区域,具有多个磷酸化位点。这有利于疫苗的研发与制备。     

病原生物学教学在成人教育的改革尝试

教师在教学过程中通过调整教学内容,改变教学方式,正确处理好能力培养与传授知识之间的关系,使学生的学习兴趣和效率以及知识综合应用能力明显提高.改革后的病原生物学教学更符合培养高素质实用性医学人才的需要.     

RNA编辑酶ADAR1在Huh7.5.1细胞中抑制HCV复制的研究

目的：探究干扰素在Huh7.5.1细胞中对RNA编辑酶（adenosine deaminases acting on RNA 1,ADAR1）表达的影响,以及ADAR1对丙型肝炎病毒（hepatitis C virus,HCV）复制的调控作用。方法：干扰素（IFN-α,30 IU/mL）刺激Huh7.5.1细胞后,利用real-time PCR和Western blot检测ADAR1表达水平的变化,同时HCV以一定滴度（0.2 MOI）感染Huh7.5.1细胞,观察IFN-α对HCV复制的影响;利用siRNA降低ADAR1表达,过表达质粒（ADAR1 p110和p150）增加ADAR1表达,并进一步利用基因编辑技术建立ADAR1稳定敲除细胞株,明确ADAR1与HCV的复制关系。结果：IFN-α诱导Huh7.5.1细胞ADAR1 p150表达（48 h：t=10.400,P=0.007;72 h：t=19.390,P=0.002）,而不影响ADAR1 p110表达（48 h：t=0.806,P=0.472;72 h：t=1.929,P=0.133）,同时IFN-α可显著抑制HCV复制（48 h：t=10.170,P=0.001;72 h：t=35.810,P=0.000）。ADAR1 p110和p150过表达48 h后,HCV病毒核酸和蛋白水平均明显低于空白对照（P=0.004,P=0.015）;ADAR1 siRNA干扰后,HCV复制增加了2倍以上,差异显著（t=13.530,P=0.000）;利用Crispr-cas9技术敲除掉Huh7.5.1中的ADAR1后,HCV复制也明显增加（t=5.259,P=0.023）;ADAR1干扰后IFN-α仍然存在对HCV明显的抑制作用（t=9.146,P=0.001）。结论：IFN诱导蛋白ADAR1可以抑制HCV复制,且ADAR1部分介导了IFN-α对HCV复制的抑制。     

登革病毒中国株E基因重组的生物信息学分析

罗替戈汀为选择性多巴胺D1/D2/D3受体激动剂,其透皮贴剂是第一个非麦角类多巴胺受体激动剂贴剂。罗替戈汀贴剂24 h有效,能对帕金森病人持续提供多巴胺能刺激,目前获得FDA和EMA批准上市。对罗替戈汀贴剂研究情况进行简要综述。