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目的:基于生物信息学探究NOP2核仁蛋白(NOP2 nucleolar protein, NOP2)在肝癌预后中的价值。方法:采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,计算497例(其中54例有癌旁组织)肝癌病人的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的两个主要评分。通过Cox回归分析寻找出差异表达基因(DEGs)。同时进一步收集蚌埠医学院第一附属医院行肝切除术的原发性肝癌病人10对癌组织及相邻癌旁组织进行qRT-PCR分析。结果:NOP2的表达水平与肝癌的病理特征(较晚的M分期)呈正相关,与病人的生存时间呈负相关。通过基因集富集分析(GSEA)发现NOP2高表达的基因主要富集于与免疫相关通路。进一步研究证实6种免疫细胞与NOP2表达呈正相关,包括M0巨噬细胞、静止期自然杀伤细胞、激活期CD4+记忆T细胞、CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞。5种免疫细胞与NOP2的表达水平呈负相关,包括记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、休止期CD4+记忆T细胞。且qRT-PCR显示NOP2在肝癌中呈高表达,在癌... 相似文献
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目的 探讨蛋白激酶Cδ(protein kinase Cδ,PRKCD)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达水平、临床意义及其潜在的作用机制。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中下载HCC的表达数据和临床数据,分析PRKCD在HCC中的表达水平及其临床意义。收集25例HCC患者的肿瘤组织及癌旁组织,采用免疫组化染色检测患者样本中的PRKCD蛋白表达水平。采用Western Blot及qRT-PCR法检测PRKCD在正常肝上皮细胞和肝癌细胞系中的表达水平。通过构建si-PRKCD慢病毒转染到Huh-7肝癌细胞中,采用CCK-8实验评估沉默PRKCD对肝癌细胞增殖活性的影响。采用划痕实验、Transwell侵袭实验明确PRKCD对细胞迁移和侵袭的影响。最后,通过Western Blot法检测PRKCD对上皮-间质转化(epithelial to mesenchymal transition, EMT)关键蛋白(Vimentin、N-cadherin、E-cadherin、Slug)的内在调控... 相似文献
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