基于Oncomiine芯片数据库分析低密度脂蛋白受体相关蛋白4在甲状腺乳头癌中的表达及意义

目的 研究低密度脂蛋白受体相关蛋白4(LRP4)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达和意义.方法 挖掘Oncomine数据库中关于LRP4的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,探索其在PTC中的表达及意义.结果 Oncomine数据库中共收集了400项不同肿瘤中关于LRP4的研究,与正常组织相比,LRP4表达明显增高的有11项,表达明显降低的有7项.共3项研究中的5个数据集包含135例样本涉及LRP4在PTC组织与正常组织中的表达,对这5项研究结果进行Meta分析显示,LRP4在所有差异表达基因中的中位数值排名为11,P=3.06×10-8,提示LRP4在PTC中高表达.LRP4在PTC组织中的表达量均明显高于正常组织,差异均有统计学意义(P﹤0.01).LRP4高表达与低表达患者的生存情况比较,差异无统计学意义(P﹥0.05).结论 通过对Oncomine基因芯片数据库中肿瘤相关基因信息的深入挖掘显示,LRP4在PTC组织中高表达,提示LRP4可能是PTC的致癌基因,为PTC的靶向治疗提供了方向.研究未发现LRP4的高低表达与PTC患者的生存有关.     

肠粘连引起肠梗阻的基因水平研究

目的通过分析基因层面的差异表达,以探讨与肠梗阻相关的发病基因和治疗靶基因。方法在基因表达公共数据库（geneexpressionomnibus,GEO）中收集到10个样品的基因表达数据,其中小鼠粘连小肠组织术后1、3、7、和14d时间点的基因芯片数据共8个,小鼠正常小肠组织芯片数据2个,应用基因本体论（geneontology,GO）富集分析和微阵列显著性分析（significanceanalysisofmicroarray,SAM）方法,分析10个样品的基因表达情况,并对差异表达的基因进行功能注释和生物学分析。结果肠粘连的发生伴随着大量应答刺激的基因表达上调,且这些基因产物都分布在细胞膜上。分析术后不同时间点的基因表达情况发现,Hmgcs2基因的表达上调出现在术后3～14d,融助5基因的表达上调出现在术后14d。结论粘连的发生可能与应答刺激的基因及其分布于细胞膜上的基因产物有关,Hmgcs2和s抚幼5基因可能与因粘连而导致的其他并发疾病的发生有关。这为发现肠梗阻潜在的治疗靶点提供了依据。