胰岛素样生长因子结合蛋白3增强子元件(IEE)的生物学特征

背景:在细胞水平,胰岛素样生长因子结合蛋白3竞争性地与胰岛素样生长因子结合阻止了胰岛素样生长因子与其受体结合,从而抑制了胰岛素样生长因子的活性.目的:观察衰老细胞中调节性蛋白质胰岛素样生长因子结合蛋白3的生物学特征.设计、时间及地点:单一样本观察,于2006-09/2007-09在西安交通大学生物医学信息工程教育部重点实验室完成.材料:人胚肿二倍体成纤维细胞(2BS)购于中国生物制品研究所.方法:用Northern的方法显示胰岛素样生长因子结合蛋白3基因的表达在年轻和衰老的2BS细胞中存在差异:聚合酶链反应扩增出人类胰岛素样生长因子结合蛋白3上游包括5'-UTR区的2kb的序列,并用酶切得到4组不同长短的胰岛素样生长因子结合蛋白3启动子片段并确定可调控转录活性的区域;通过重叠寡核苷酸凝胶阻滞实验确定在该活性区域中的增强子元件-IEE(IGFBP-3 enhancerelement)及其与蛋白结合的碱基序列等;用DNase I Footprinting法确定了IEE中与蛋白结合的核心序列.主要观察指标:①胰岛素样生长因子结合蛋白3基因在年轻和衰老细胞中的表达差异.②通过重叠寡核苷酸确定增强子元件.③通过凝胶阻滞试验证实该复合物结合活性与衰老相关的.④通过凝胶阻滞试验确定IEE与蛋白结合的碱基序列.⑤用DNase I Footprinting法确定IEE中与蛋白结合的核心序列.⑥判断与IEE结合蛋白的相对分子质量.结果:与年轻的2BS细胞相比,衰老的2BS细胞中胰岛素样生长因子结合蛋白3基因的表达升高:5'-ccagcctgccaa gca gcg tgcCCCggttgc-3'是胰岛素样生长因子结合蛋白3的增强子元件;该元件与蛋白结合的核心序列是CTG CCA和GCGTGC CCC G,而且这种结合是与衰老相关的:结合蛋白的相对分子质量大约在27 000.结论:在2BS细胞中发现了一个新的转录增强子,它与蛋白结合的核心序列是CTGCCA和GCG TGC CCC G,可与一个大约27 000的蛋白结合:在衰老细胞中可选择性地促进胰岛素样生长因子结合蛋白3的表达.     

胰岛素样生长因子结合蛋白3增强子元件(IEE)的生物学特征**☆◆

背景：在细胞水平，胰岛素样生长因子结合蛋白3竞争性地与胰岛素样生长因子结合阻止了胰岛素样生长因子与其受体结合，从而抑制了胰岛素样生长因子的活性。 目的：观察衰老细胞中调节性蛋白质胰岛素样生长因子结合蛋白3的生物学特征。 设计、时间及地点：单一样本观察，于2006-09/2007-09在西安交通大学生物医学信息工程教育部重点实验室完成。 材料：人胚肺二倍体成纤维细胞(2BS)购于中国生物制品研究所。 方法：用Northern的方法显示胰岛素样生长因子结合蛋白3基因的表达在年轻和衰老的2BS细胞中存在差异；聚合酶链反应扩增出人类胰岛素样生长因子结合蛋白3上游包括5’-UTR区的2kb的序列，并用酶切得到4组不同长短的胰岛素样生长因子结合蛋白3启动子片段并确定可调控转录活性的区域；通过重叠寡核苷酸凝胶阻滞实验确定在该活性区域中的增强子元件-IEE(IGFBP-3 enhancer element)及其与蛋白结合的碱基序列等；用DNase I Footprinting法确定了IEE中与蛋白结合的核心序列。 主要观察指标：①胰岛素样生长因子结合蛋白3基因在年轻和衰老细胞中的表达差异。②通过重叠寡核苷酸确定增强子元件。③通过凝胶阻滞试验证实该复合物结合活性与衰老相关的。④通过凝胶阻滞试验确定IEE与蛋白结合的碱基序列。⑤用DNase I Footprinting法确定IEE中与蛋白结合的核心序列。⑥判断与IEE结合蛋白的相对分子质量。 结果：与年轻的2BS细胞相比，衰老的2BS细胞中胰岛素样生长因子结合蛋白3基因的表达升高； 5’-cca gcc tgc caa gca gcg tgc ccc ggt tgc-3’是胰岛素样生长因子结合蛋白3的增强子元件；该元件与蛋白结合的核心序列是CTG CCA和GCG TGC CCC G，而且这种结合是与衰老相关的；结合蛋白的相对分子质量大约在27 000。 结论：在2BS细胞中发现了一个新的转录增强子，它与蛋白结合的核心序列是CTG CCA和GCG TGC CCC G，可与一个大约27 000的蛋白结合；在衰老细胞中可选择性地促进胰岛素样生长因子结合蛋白3的表达。     

衰老细胞中调控胰岛素样生长因子结合蛋白-3的表达

目的:研究在衰老细胞中调控胰岛素样生长因子结合蛋白-3(IGFBP-3)表达增加的影响因素.方法:用Northern blot的方法显示IGFBP-3基因的表达在年轻和衰老的2BS细胞中存在差异;PCR扩增出人类IGFBP-3上游包括5′-UTR区的2 kb的序列并用酶切得到4组不同长短的IGFBP-3启动子片段;将各片段用Effectene Transfection Reagent试剂盒转染到年轻和衰老细胞中,测出几组构建基因片段的启动活性,确定可调控转录活性的区域;通过重叠寡核苷酸凝胶阻滞实验确定在该活性区域中的增强子元件.结果:与年轻的2BS细胞相比,衰老的2BS细胞中IGFBP-3基因的表达升高;在IGFBP-3启动子+59到-58序列之间存在着蛋白结合位点;5′-ccagcctgccaagcagcgtgccccggttgc-3′是IGFBP-3的增强子元件.结论:在衰老的2BS细胞中IGFBP-3基因上游-37到-8的30 bp序列存在一个新的增强子元件IEE (IGFBP-3 enhancer element),对IGFBP-3的表达起到调控作用.