自建MALDI-TOF MS霉菌数据库的研究

目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)霉菌数据库,提高引起临床相关感染的各种霉菌的鉴定能力。方法收集临床标本来源的霉菌266株,纯培养后进行霉菌18S rDNA扩增测序,获得菌种鉴定结果。选取210株霉菌用于数据库的构建,通过甲酸萃取法提取蛋白,应用MALDI-TOF MS配套的FlexControl软件收集蛋白谱图,采用Biotyper软件构建评价数据库。其余56株霉菌用于数据库鉴定能力的验证,分别用商品化数据库、自建的MALDI-TOF MS数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,应用χ2检验比较数据库的鉴定率差异。结果自建本地化MALDI-TOF MS霉菌鉴定数据库包含19个菌属,67个菌种,共计204株霉菌的质谱图。用于数据库验证的56株霉菌中,用商品化数据库鉴定正确18株,鉴定正确率为32.1%,用扩展数据库鉴定正确51株,鉴定正确率为91.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论自建霉菌数据库提高了霉菌的鉴定能力,从而有助于临床霉菌感染的病原诊断和治疗。     

流感嗜血杆菌多位点序列分型及同源性分析

目的?了解流感嗜血杆菌耐药率变化及多位点序列分型，进行同源性分析，减少医院感染和多重耐药菌株的发生。方法?收集解放军总医院第六医学中心2015—2022年临床分离的108株流感嗜血杆菌，使用K-B法进行药物敏感性试验；采用多位点序列分析进行序列分型（sequence typing, ST）；采用MEGA 7.0软件的Neighbor-Joining法和Phyloviz 8.0软件的goeBURST算法构建系统发育树和最小生成树分析菌株同源性。结果?近几年流感嗜血杆菌对氨苄西林、复方新诺明耐药率＞60%；108株菌中，5株未能与数据库匹配，103株菌有20种ST型别，主要为ST-487（58株，占53.70%）和ST-147（19株，占17.59%）；系统发育树分为2组，除ST-834和ST-1242 2种型别分布在Ⅱ组外，其余型别在Ⅰ组；最小发育树提示2大分支ST-487和ST-147都与ST-103有相关性。结论?院内分离的流感嗜血杆菌多数菌株存在亲缘进化关系；多重耐药的流感嗜血杆菌在我院不同科室相继检出，提示编码耐药基因的质粒在病区间传播。