蛋白质芯片技术及其在全基因组翻译后修饰分析中的应用

蛋白质芯片技术可用于研究蛋白质-DNA、蛋白质-配基和蛋白质与蛋白质之间的相互作用,是当前生物科学研究中的重要内容。近年来,运用蛋白质芯片技术对全基因组进行生物化学分析的应用取得令人瞩目的成就。现着重总结蛋白质芯片技术及其在全基因组翻译后修饰分析中的应用。     

尿毒症患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平的分析

目的 尿毒症是由于肾衰竭致使代谢产物和其他有毒物质在体内蓄积而引起的一种自身中毒综合征,超保守区域转录子(transcribed ultra-conserved regions,T-UCRs)是lncRNA重要组成部分,转录自人类基因组中481个极度保守区域,希望分析尿毒症外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平,从而发现尿毒症潜在的诊断和预后的生物标志物.方法 本研究采用T-UCRs芯片技术分析了15例尿毒症患者和15例健康对照组的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平,并且用实时荧光定量PCR技术验证了尿毒症患者与健康对照组表达差异最显著的基因的表达水平.结果 对比尿毒症患者与健康对照组,通过芯片筛选出T UCRs发现21个T-UCRs表达水平上调,49个T-UCRs表达水平下调,在表达上调和下调的T-UCRs中,对应的超保守区域uc.458-表达水平最显著(P-2.47524E-24;FC=3118.5361),其相关基因为RBFOX2.结论 通过GO分析以及验证后发现uc.458-可能是尿毒症潜在的生物标志物,RBFOX2可能是尿毒症潜在的关键基因.