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1.
为了挖掘参与巴戟天生长发育及次生代谢产物合成的MYB转录因子,本研究基于巴戟天根茎叶的转录组数据,筛选并鉴定巴戟天的R2R3-MYB转录因子,为以后通过遗传改良的手段调控巴戟天的代谢机制提供理论基础。根据巴戟天根茎叶的转录组数据,利用PFAM和plantTFDB等5个数据库,对预测的巴戟天R2R3-MYB转录因子进行鉴定, GO功能注释和分类、保守结构域分析、进化树比对分析和组织特异性表达差异分析。基于巴戟天的转录组数据共鉴定109个MYB转录因子,其中R2R3-MYB的数量为51个。亚细胞定位结果显示多数序列定位于细胞核,少部分位于细胞外基质。与分子功能、生物过程和细胞组分相关的GO terms的数量分别为112、76和239个。51个巴戟天R2R3-MYB转录因子中的R2-MYB和R3-MYB的保守基序分别为:-W-(X19)-W-(X19)-W-,-F-(X18)-W-(X18)-W-。通过与拟南芥R2R3-MYB转录因子的序列比对分析可知,除了S10、S19和S21亚家族没有分布,其他亚家族中都存在同源序列。RT-qPCR的结果验证了部分R2R3-MYB基因在3个组织差异性表达。获得的51个R2R3-MYB转录因子为进一步研究巴戟天MYB转录因子家族提供了一定的理论基础。 相似文献
2.
《中国妇幼保健》2019,(2)
目的通过研究人子宫内膜细胞基因表达谱,分析人子宫内膜特异表达基因的水平及相关信号通路。方法通过新一代测序数字基因表达谱(DGE)方法对人子宫内膜细胞进行转录组测序,与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比获得子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果人子宫内膜细胞表达基因17 485个。其中与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比,子宫内膜细胞特异表达基因3 651个。选取转录本定量FPKM值大于10个拷贝的627个子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与细胞外区域的结构和细胞外基质、胶原蛋白代谢、细胞迁移的调控等功能相关; KEGG信号通路富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与黏着斑、吞噬泡、脂肪酸代谢、细胞凋亡等信号通路相关。结论获取人原代子宫内膜细胞的基因表达谱,并对其差异基因进行GO注释和KEGG信号通路富集分析,可为进一步研究提高子宫内膜容受性的方法提供可靠依据。 相似文献
3.
目的针对检验结果解释性注释进行全国性的现况调查,旨在了解该项检验后活动的开展情况,并提供改进检验报告质量的建议。方法调查对象是2018年参加国家卫生健康委员会临床检验中心开展的室间质量评价的医院检验科,采用问卷调查形式在线收集填报信息,问卷分为两个部分,第一部分为医院及检验科基本情况调查,第二部分为检验结果解释性注释相关信息的调查,并进行统计分析。结果调查共发出1 868份问卷,784家医院检验科反馈结果,其中90.56%的实验室检验医师人数不超过5人,且大多集中在三级甲等综合性医院。在提供检验结果解释性注释的660家检验科中,负责解释结果的人员职称为中级及以上检验技师的占99.70%。大部分医院检验科认为无法获取充足的患者临床信息是阻碍开展解释性注释的重要因素。结论全国临床实验室检验结果解释性注释的开展存在许多问题,实验室应加强与临床的沟通交流,确立检验医师的岗位职责,定期比对结果解释人员的能力,从而提升检验报告的价值,改进检验后阶段的质量。 相似文献
4.
《医部全录》为《古今图书集成》的一部分,是我国历代以来最大的一部医学类书.全书内容包括医经注释、诊法、脏腑身形、各科疾病的理论经验,以及有关医学的艺文、记事和名医传等,内容丰富,眉目清楚,是一部常用的中医工具书,对医学工作者学习和研究中医具有很高的参考价值. 相似文献
5.
目的:利用网络药理学分析小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索小青龙汤药物活性成分和靶点,绘制中药-化合物-靶基因网络,筛选关键化合物;利用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)搜索COPD疾病基因;绘制韦恩图并获取药物-疾病共同基因;利用小青龙汤-慢阻肺药物疾病共同基因绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,根据网络关系选择核心基因;对核心基因分别进行基因本体(GO)功能注释和富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:挖掘得到小青龙汤中药活性成分137个,潜在作用靶点188个,慢性阻塞性肺疾病相关靶点6 949个,小青龙汤-COPD共同靶点160个,主要富集于92个生物过程和49条信号通路上。结论:小青龙汤中多个药物含有山柰酚、槲皮素、(+)-儿茶素、豆甾醇、β-谷固醇等成分,可作用于AKT1、IL6、MAPK1、PTGS2、TP53等核心基因,调控氧化应激反应、血小板α-颗粒等生物过程,参与HIF-1、PI3K-AKT信号通路的调节,干预氧化应激反应和炎症反应等过程,产生抑制炎症反应、抗氧化应激的作用,进而通过上述过程参与COPD的炎症反应与氧化应激过程。 相似文献
6.
目的鉴定老鸦瓣Amana edulis MYB转录因子家族成员并分析其表达模式,以期发现老鸦瓣芽茎发育相关MYB基因。方法利用老鸦瓣转录组数据经Pfam和PlnTFDB数据库鉴定含有MYB保守结构域的MYB转录因子,通过构建系统进化树并根据拟南芥MYB分组信息为老鸦瓣R2R3-MYB基因划分亚组,进行2R-MYB结构域可视化分析和GO富集分析,挑选在芽茎中特异表达的MYB基因并用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表达。结果共鉴定出93个含有MYB保守结构域的MYB转录因子,其中53个R2R3-MYB分为15个亚组,GO注释为生物过程的子类别最多,在芽茎中特异表达的12个MYB基因中有11个基因在芽茎发育前期至中期的表达量显著下降,有4个基因在芽茎发育中期至后期的表达量显著上升。结论获得的53个R2R3-MYB转录因子为进一步研究老鸦瓣MYB转录因子家族影响芽茎发育过程的分子机制奠定了基础。 相似文献
7.
中华精神科杂志编辑部 《中华精神科杂志》2020,(2):110-110
在本刊发表的论文中,应尽量不使用或少使用缩写词,而精神医学专业领域公知公认的缩写词(表1)可以不加注释直接使用,本刊论文中将不再注释。不超过4个汉字的名词不宜用缩写词。 相似文献
8.
《护理与康复》编辑部 《护理与康复》2021,20(1):7-7
表格是期刊内容中的一种重要表现形式。论文中表的设置应有助于简洁、明了、直观地表达结果。若表的内容简单、用简洁文字即可表达清楚的,应选用文字;若文字叙述冗长繁琐、用表格表达便于理解,则可选用表格。表的内容不要与正文文字及插图内容重复,每张表都要在文中注明。表格的格式一般先排表序、表题,然后排表头、表线、注释等。表序一律使用阿拉伯数字依序编排,如“表1”“表2”等。表题要说明表的内容,表中不设“备注”栏,需要说明的事项(例如P值)在表内有关内容的右上角标出注释符号,以1)2)3)等顺序标出,在表格底线的下方以相同的注释符号引出简练的文字注释。 相似文献
9.
10.
稿件中若有图表,分别按其在正文中出现的先后次序连续编码:每幅图应冠有图题。说明性的文字应置于图下方注释中,并在注释中标明图表中使用的全部非公知公用的缩写。 相似文献