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1.
We propose a Deep learning-based weak label learning method for analyzing whole slide images (WSIs) of Hematoxylin and Eosin (H&E) stained tumor tissue not requiring pixel-level or tile-level annotations using Self-supervised pre-training and heterogeneity-aware deep Multiple Instance LEarning (DeepSMILE). We apply DeepSMILE to the task of Homologous recombination deficiency (HRD) and microsatellite instability (MSI) prediction. We utilize contrastive self-supervised learning to pre-train a feature extractor on histopathology tiles of cancer tissue. Additionally, we use variability-aware deep multiple instance learning to learn the tile feature aggregation function while modeling tumor heterogeneity. For MSI prediction in a tumor-annotated and color normalized subset of TCGA-CRC (n=360 patients), contrastive self-supervised learning improves the tile supervision baseline from 0.77 to 0.87 AUROC, on par with our proposed DeepSMILE method. On TCGA-BC (n=1041 patients) without any manual annotations, DeepSMILE improves HRD classification performance from 0.77 to 0.81 AUROC compared to tile supervision with either a self-supervised or ImageNet pre-trained feature extractor. Our proposed methods reach the baseline performance using only 40% of the labeled data on both datasets. These improvements suggest we can use standard self-supervised learning techniques combined with multiple instance learning in the histopathology domain to improve genomic label classification performance with fewer labeled data.  相似文献   
2.
Whether the underlying mutations are homozygous, heterozygous, or co-inherited with other hemoglobinopathies, sickle cell disease is known to afflict the kidneys, leading to the clinical entity known as sickle cell nephropathy (SCN). Although common, SCN remains diagnostically elusive. Conventional studies performed in the context of renal disorders often fail to detect early stage SCN. This makes the quest for early diagnosis and treatment more challenging, and it increases the burden of chronic kidney disease-related morbidity among patients. Novel diagnostic tools have been employed to overcome this limitation. In this study, we discuss various biomarkers of SCN, including those employed in clinical practice and others recently identified in experimental settings, such as markers of vascular injury, endothelial dysfunction, tubulo-glomerular damage, and oxidative stress. These include kidney injury molecule-1, monocyte chemoattractant protein-1, N-acetyl-B-D-glucosaminidase, ceruloplasmin, orosomucoid, nephrin, and cation channels, among others. Furthermore, we explore the potential of novel biomarkers for refining diagnostic and therapeutic approaches and describe some obstacles that still need to be overcome. We highlight the importance of a collaborative approach to standardize the use of promising new biomarkers. Finally, we outline the limitations of conventional markers of renal damage as extensions of the pathogenic process occurring at the level of the organ and its functional subunits, with a discussion of the expected pattern of clinical and biochemical progression among patients with SCN.  相似文献   
3.
背景缓解期溃疡性结肠炎(UC)患者病程长,需长期维持治疗,中医药治疗缓解期UC具有一定的疗效。健脾清热化湿方治疗缓解期UC的疗效还不确切。目的采用单病例随机对照试验,评价健脾清热化湿方联合美沙拉秦对比美沙拉秦治疗脾虚湿热型缓解期UC患者的疗效和安全性。方法于2020年6月至2021年3月,在广州中医药大学第一附属医院门诊纳入1例缓解期UC患者。采取自身对照的方式,共进行4轮次无洗脱期的随机对照试验,每一轮次包括试验期和对照期两个治疗期,每个治疗期干预1个月,共8个治疗期。受试者在试验期服用健脾清热化湿方颗粒与美沙拉秦,在对照期服用美沙拉秦。比较两个治疗期的中医证候评分(TCMSS)、Bristol粪便性状量表(BSFS)、腹痛和腹泻视觉模拟评分(VAS)、炎症性肠病简明健康量表(SHS)评分及安全性。结果4轮次试验后,试验期腹泻、腹胀、肢体倦怠评分及TCMSS总分的改善程度优于对照期(P<0.05)。4轮次试验后,试验期BSFS评分和腹泻VAS评分的改善程度优于对照期,腹痛VAS评分的改善程度劣于对照期(P<0.05)。4轮次试验后,试验期SHS评分的改善程度优于对照期(P<0.05)。患者在4个周期均无不良反应发生。结论健脾清热化湿方联合美沙拉秦可改善脾虚湿热型缓解期UC患者的临床症状,且安全性较高。  相似文献   
4.
目的评价益气通脉汤治疗孤立性冠状动脉肌桥心绞痛气虚血瘀证患者的临床疗效。方法将符合入选标准的2016年4月-2020年1月首都医科大学附属北京中医医院64例孤立性冠状动脉肌桥心绞痛气虚血瘀证患者,采用随机数字表法分为2组,每组32人。对照组口服盐酸地尔硫卓片,治疗组在对照组基础上服用自拟益气通脉汤。2组均连续治疗8周。分别于治疗前后进行中医证候评分,采用西雅图心绞痛量表评估患者生活质量及机体功能状态,观察治疗前后平板运动心电图试验情况,记录运动诱发心绞痛需要的时间及平板运动后引起心电图中ST段动态演变的时间;评价心绞痛疗效及中医证候疗效。结果治疗组心绞痛疗效总有效率为84.4%(27/32)、对照组为53.1%(17/32),2组比较差异有统计学意义(χ2=8.09,P<0.05)。治疗后,治疗组西雅图心绞痛量表中躯体活动受限程度[(69.24±14.21)分比(59.42±11.71)分,Z=-2.61]、心绞痛稳定状态[(82.25±21.24)分比(69.11±19.52)分,Z=-2.64]、心绞痛发作情况[(80.24±18.31)分比(69.11±15.54)分,Z=-2.63]、治疗满意程度[(86.16±19.23)分比(61.19±17.35)分,Z=-2.22]、疾病认知程度[(74.41±21.13)分比(60.43±19.42)分,Z=-2.40]评分高于对照组(P<0.05);治疗组运动诱发心绞痛时间[(476.15±62.15)s比(399.38±78.42)s,Z=-2.08]、运动后ST段下移1 mm时间[(394.54±75.61)s比(309.64±81.62)s,Z=-2.40]较对照组延迟(P<0.05)。治疗组中医证候疗效总有效率为93.8%(30/32)、对照组为65.6%(21/32),2组比较差异有统计学意义(χ2=7.96,P<0.05)。治疗组治疗后中医证候积分[(25.15±6.15)分比(36.38±10.42)分,Z=-2.56]低于对照组(P<0.05)。治疗期间,2组均未见明显不良反应。结论益气通脉汤可有效改善孤立性冠状动脉肌桥心绞痛气虚血瘀证患者的临床症状,减少心绞痛发作,延迟运动诱发心绞痛时间,提高临床疗效。  相似文献   
5.
6.
绝经后骨质疏松症是一种由于体内雌激素缺乏引起的全身性骨退行性疾病,是生理与病理综合作用的结果,临床表现以骨痛、脊柱畸形、骨折为主。天癸是促进人体生长、发育和维持生殖所必需的物质。围绝经期女性天癸将竭,太冲脉虚,阴血生化乏源,营阴不足,阴虚则不能制阳,阳气亢盛为害,导致机体处于阴血不足,阳亢不制的状态。针对女性的生理特点及本病的发病特点,采用酸枣仁汤合并百合地黄汤以养血敛阴清热,可使肝木有制,肾水充盈,阴血内藏,精血得以滋养骨骼而筋强骨壮。本文将根据阴血不足理论对酸枣仁汤合并百合地黄汤治疗绝经后骨质疏松症的机理进行探讨,以期为绝经后骨质疏松症病机的研究及临床治疗提供思路。  相似文献   
7.
不孕症是指一年以上未采取任何避孕措施、性生活正常,但是未能成功妊娠者。临床上,将不孕症分为原发性不孕与继发性不孕两种,常见病因有排卵障碍、精液异常、输卵管异常及子宫内膜异位症等,影响患者健康生活[1]。排卵障碍属于生殖内分泌系统常见病,亦是引起女性不孕的重要原因。数据调查结果表明:不孕症患者中排卵障碍引起的不孕占25.0%~30.0%[2]。克罗米芬、促性腺激素及人绒毛膜促性腺激素等均为排卵障碍性不孕症患者常用的治疗药物,虽然能改善患者症状,但是远期预后较差,排卵率及妊娠率较低[3]。  相似文献   
8.
9.
【目的】探讨胃复康加味方治疗隆起糜烂性胃炎(脾虚气滞型)患者的临床疗效及对血清胃泌素17(G-17)和胃蛋白酶原Ⅰ(PGⅠ)、胃蛋白酶原Ⅱ(PGⅡ)及其比值(PGR)的影响。【方法】将62例隆起糜烂性胃炎(脾虚气滞型)患者随机分为治疗组32例和对照组30例。2组患者均给予幽门螺杆菌(Hp)阳性者标准抗Hp四联治疗,在此基础上,对照组给予抑制胃酸分泌、促进胃动力等常规对症治疗,治疗组给予中药胃复康加味方治疗,1个月为1个疗程,连续治疗2个疗程。观察2组患者治疗前后Hp阳性率和病理组织改善情况以及血清PGⅠ、PGⅡ、PGR、G-17水平的变化情况,并评价2组患者的临床疗效。【结果】(1)治疗2个疗程后,治疗组的总有效率为90.63%(29/32),对照组为73.33%(22/30),组间比较,治疗组的疗效明显优于对照组(P<0.05)。(2)治疗后,2组患者的Hp阳性率均较治疗前降低(P<0.05),且治疗组的Hp阳性率明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。(3)治疗后,治疗组的腺体萎缩、肠上皮化生和异型增生等均较治疗前改善(P<0.05),而对照组均无明显改善(P>0.05);组间比较,治疗组的腺体萎缩、肠上皮化生改善明显优于对照组(P<0.05),而异型增生方面无显著性差异(P>0.05)。(4)治疗后,2组患者的血清PGⅠ、PGR、G-17水平均较治疗前明显提高(P<0.05),且治疗组的血清PGⅠ、PGR、G-17水平均明显高于对照组(P<0.05或P<0.01),而血清PGⅡ水平2组治疗前后及组间比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。【结论】胃复康加味方治疗隆起糜烂性胃炎(脾虚气滞型)患者疗效显著,有明显的抗幽门螺杆菌、改善病理组织、促进胃窦黏膜修复和胃酸、胃泌素分泌的作用。  相似文献   
10.
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