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1.
人体内定植着数量庞大、结构复杂的微生物群,微生物群之间、微生物群及宿主细胞间存在着复杂的相互作用。互作转录组测序技术(dual RNA sequencing, Dual RNA-seq)可同时分析两个(或多个)互作物种间基因表达的动态变化,并通过互作模型图获得物种间基因的调控关系,得到物种间的相互作用机制。本文就近年来Dual RNA-seq技术在肠道、呼吸道、皮肤及口腔微生物研究中的应用现状及发展前景作一综述。自Dual RNA-seq的概念被引入以来,该技术已被应用于一系列感染模型。在分子水平上直接研究物种间动态相互作用,有助于更好地理解感染过程中病原体和宿主的生理变化,从而揭示潜在的新靶点或生物标志物。但是,Dual RNA-seq目前仍然处于起步阶段,在实验技术方面存在一定的局限性,比如由于物种间的相互作用是动态变化的,最佳实验条件以及采样点的选择以及如何实现实时观测是亟需解决的难题;此外,由于Dual RNA-seq的生物信息学数据量大,如何快速灵活地处理互作信息仍然需要进一步的探索。 相似文献
2.
目的 研究改良透明质酸(HA)水凝胶控释脑源性神经营养因子(BDNF)对大鼠胚胎神经干细胞(rFNSCs)生长、分化及凋亡的影响。方法 实验以大鼠胚胎干细胞为研究对象,将实验分为3组,分别为空白对照组[rFNSCs与聚乳酸乙醇酸(PLGA)和HA共培养]、条件对照组(rFNSCs与BDNF-PLGA和HA共培养)、实验组(rFNSCs与BDNF-PLGA和改良HA水凝胶即Dex-HA共培养)。采用ELISA法检测控释支架中BDNF的释放曲线;Live/Dead实验检测各组中的rFNSCs凋亡情况;CCK-8法检测rFNSCs与水凝胶共培养后的细胞增殖活性;免疫细胞化学染色法检测不同组中rFNSCs的分化情况。结果 ELISA法结果显示水凝胶对BDNF的控释可以持续14 d。Live/Dead实验显示实验组中rFNSCs凋亡数低于空白对照组和条件对照组。CCK-8实验表明,三组中实验组rFNSCs细胞增殖活性最强,差异有统计学意义(P<0.05)。免疫细胞化学染色结果表明,与空白对照组和条件对照组相比,实验组水凝胶在体外能促进rFNSCs向神经元分化,减少向星形胶质细胞的分化,差异... 相似文献
3.
所谓便秘,指在多种致病因素的作用下,结直肠和肛门的结构功能发生改变,临床上出现排便困难、排便量少、排便次数减少或排便不适感等的一类疾病。 相似文献
4.
5.
目的通过体内和体外研究探讨羟基红花黄色素(hydroxy safflower yellow A,HSYA)在大鼠应激性结肠高动力中的作用及其可能的作用机制。方法将15只雄性Wistar大鼠分为3组,分别为:SWAS(假性避水应激)组、WAS(避水应激)组、WAS+HSYA组,每组5只。WAS组和SWAS组大鼠连续10 d每天分别暴露于避水应激和假性避水应激中1 h,建立大鼠模型;WAS+HSYA组大鼠于每天进行避水应激前半小时,以60 mg/kg的HSYA灌胃,而WAS组以相同的生理盐水灌胃,SWAS组则不做处理。整个实验期间,分别记录各组大鼠的每天粪球排出量。于实验第11天,大鼠处死后取近端结肠制备肌条,以张力换能器测定结肠平滑肌肌张力变化。另取正常大鼠离体近端结肠制备肌条,以张力换能器测定结肠平滑肌肌张力变化,当出现一段规律收缩信号后,分别进行其他的相关处理:(1)加入浓度梯度的HSYA溶液(终浓度分别为0.6、1.2、1.8 mol/L),观察并记录其自发性收缩活性变化;(2)用1μmol/L TTX孵育肌条10 min,再以浓度梯度的HSYA溶液处理肌条,观察并记录其自发性收缩活性变化;(3)用30μmol/L Tak-242孵育肌条15 min,再以浓度梯度的HSYA溶液处理肌条,观察并记录其自发性收缩活性的变化。采用SPSS 26.0统计软件、Graphpad 8.0软件对实验所得数据进行分析。结果避水应激诱发大鼠结肠动力亢进。HSYA明显抑制结肠肌条收缩活性,这种作用未被TTX阻断,而TLR4受体拮抗剂Tak-242能显著阻断HSYA对结肠肌条收缩活性的抑制作用。结论 HSYA能逆转应激性结肠动力亢进,这种效应可能与TLR4受体通路有关。 相似文献
6.
目的探究结直肠癌组织中层粘连蛋白β1(LAMβ1)、肌动蛋白相关蛋白2/3复合体4(ARPC4)及间隙连接蛋白26(Cx26)的表达及与肿瘤侵袭、转移的关系。方法选取2018年6月至2019年12月如皋市人民医院病理科收集的100例结直肠癌手术切除的肿瘤组织及相应的癌旁正常组织,应用实时荧光定量PCR检测肿瘤组织及癌旁正常组织LAMβ1、ARPC4、Cx26的mRNA表达;Western blot检测肿瘤组织及癌旁正常组织LAMβ1、ARPC4、Cx26蛋白表达,免疫组织化学法检测LAMβ1、ARPC4、Cx26蛋白在结直肠癌组织及癌旁组织中的表达阳性率,并分析LAMβ1、ARPC4、Cx26蛋白表达与患者临床病理特征的关系。结果RT PCR结果显示,结直肠癌组织中LAMβ1、ARPC4、Cx2的mRNA表达相较于癌旁组织上调。Western blot检测结果显示,结直肠癌组织中LAMβ1、ARPC4、Cx26蛋白表达高于癌旁组织(P<005)。免疫组化结果显示,LAMβ1、ARPC4、Cx26着色主要分布于肿瘤细胞的细胞膜和细胞质中。不同性别、年龄、肿瘤大小结直肠癌患者LAMβ1、ARPC4、Cx26表达比较,差异无统计学意义(P>005);不同分化程度、临床分期、浸润深度、淋巴结转移、远处转移结直肠癌患者LAMβ1、ARPC4、Cx2表达比较,差异具有统计学意义(P<005)。Pearson相关性分析结果显示,结直肠癌肿瘤组织中LAMβ1、ARPC4、Cx26的mRNA表达量存在正相关性(P<005),其蛋白表达之间同样存在正相关性(P<005)。结论LAMβ1、ARPC4、Cx26表达升高与结直肠癌的侵袭、转移有关。 相似文献
7.
结直肠癌是常见肿瘤之一,结直肠癌患者经常出现营养不良和体重丢失,受摄入减少、肠梗阻和吸收不良的影响,
营养不良在结直肠癌患者中比在非胃肠道肿瘤中更常见。 结直肠癌患者应通过营养风险筛查 2002(NRS 2002)与患者主观整
体评估(PG-SGA)进行营养评估。 欧洲肠外肠内营养学会(ESPEN)强烈推荐对于所有接受根治性或姑息性手术的肿瘤患者
采取加速康复外科(ERAS)方案。 ERAS 可降低结直肠手术后的并发症发生率、促进康复和缩短住院时间。 在 ERAS 方案中,
ESPEN 推荐每例患者都应进行营养风险筛查,如果存在营养风险,则给予额外的营养治疗;严重营养不良的患者,术前应进行
10~ 14 d 的营养干预,甚至以延迟手术为代价。 不同手术方式的选择会对结直肠癌患者的术后并发症发生率、病死率与 3 年
长期存活率等方面产生不同的影响。 临床医师应关注患者出院后的营养状态,合理进行营养干预,有计划地对出院时存在营
养风险的患者进行随诊。 相似文献
8.
目的 探讨长链非编码 RNA 小核仁 RNA 宿主基因 11 ( small nucleolar RNA host gene 11,
SNHG11) 对结直肠癌增殖的影响及分子机制。 方法 人结肠癌细胞 LOVO、 SW480 构建 SNHG11 过表达或
者 SNHG11 干扰细胞株, 检测在结直肠癌细胞株中过表达及干扰 SNHG11 后, 结直肠癌细胞增殖能力、 P50
和 P65 蛋白和 NF-κB 信号通路下游基因的表达情况。 结果 过表达 SNHG11 能促进结直肠癌细胞的增殖,
而抑制 SNHG11 的表达则能明显抑制结直肠癌细胞的增殖。 过表达 SNHG11 后 P65、 P50 的表达及 NF-κB 信号
通路下游与细胞增殖相关基因 c-Myc、 COX2、 CCND1、 VEGFA 水平明显上调; 而敲除 SNHG11 后则显著降低。
SNHG11 通过与 NF-κB 复合体中的 P50 结合, 进而上调 NF-κB 复合体, 激活 NF-κB 信号通路。 结论 长链非
编码 RNA SNHG11 通过激活 NF-κB 信号通路促进结直肠癌细胞的增殖。 相似文献
9.
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC| ≥1 并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。 相似文献
10.
目的:探讨lncRNA NKILA对结直肠腺癌细胞增殖和侵袭的影响。方法:对结直肠腺癌病人的肿瘤组织和癌旁组织进行lncRNA测序分析,以肿瘤组织表达明显增高的lncRNA NKILA作为研究对象。将结直肠腺癌细胞DLD-1分为3组,即未转染慢病毒的空白对照组,转染无序序列慢病毒的阴性对照组,以及转染沉默lncRNA NKILA序列的试验组。流式细胞术检测转染效率,qRT-PCR检测lncRNA表达。CCK-8实验和Transwell实验分别检测DLD-1细胞的增殖和侵袭。将三组细胞分别皮下注射到小鼠体内构建荷瘤小鼠模型,观察移植瘤体积以及生存时间。Western blot检测lncRNA NKILA对DLD-1细胞中NF-κB信号通路的影响。结果:相比癌旁组织,结直肠癌组织中的lncRNA NKILA表达显著增高。通过转染慢病毒,试验组DLD-1细胞中lncRNA NKILA表达明显降低(P<0.01)。CCK-8检测结果显示,相比阴性对照组,试验组增殖率降低(P<0.05)。Transwell实验结果显示,相比阴性对照组,试验组DLD-1细胞侵袭能力明显降低(P<0.01)。试验组小鼠肿瘤体积较阴性对照组减小(P<0.05或P<0.001),生存时间明显延长(中位生存期75 vs 58 d,P<0.05)。lncRNA NKILA可以抑制IκBα的磷酸化和p65的核转位。结论:lncRNA NKILA可以促进结直肠腺癌细胞DLD-1的增殖和侵袭,这种作用与lncRNA NKILA抑制NF-κB信号通路相关。 相似文献