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1.
人体内定植着数量庞大、结构复杂的微生物群,微生物群之间、微生物群及宿主细胞间存在着复杂的相互作用。互作转录组测序技术(dual RNA sequencing, Dual RNA-seq)可同时分析两个(或多个)互作物种间基因表达的动态变化,并通过互作模型图获得物种间基因的调控关系,得到物种间的相互作用机制。本文就近年来Dual RNA-seq技术在肠道、呼吸道、皮肤及口腔微生物研究中的应用现状及发展前景作一综述。自Dual RNA-seq的概念被引入以来,该技术已被应用于一系列感染模型。在分子水平上直接研究物种间动态相互作用,有助于更好地理解感染过程中病原体和宿主的生理变化,从而揭示潜在的新靶点或生物标志物。但是,Dual RNA-seq目前仍然处于起步阶段,在实验技术方面存在一定的局限性,比如由于物种间的相互作用是动态变化的,最佳实验条件以及采样点的选择以及如何实现实时观测是亟需解决的难题;此外,由于Dual RNA-seq的生物信息学数据量大,如何快速灵活地处理互作信息仍然需要进一步的探索。 相似文献
2.
利用生物信息学技术初步探索芫根调控肠道免疫功能的分子生物学机制。方法 选择雄性SPF级BALB/c小鼠18只,随机分为3组,每组6只。SC1组小鼠每只每次灌胃芫根提取液150 μL,SC2组小鼠每只每次灌胃绞碎芫根原浆悬液150 μL,NC组小鼠每只每次灌胃生理盐水150 μL,连续7 d每日灌胃一次。分别取每组小鼠小肠组织样品提取RNA,总RNA的质检合格后,进行转录组测序。按GO功能和KEGG信号通路对差异表达基因聚类分析揭示差异表达高度富集的免疫相关通路。从免疫角度分析芫根灌胃小鼠小肠组织的基因表达变化情况。结果 转录组测序共检测到27733条 mRNA的表达,SC1组与NC组比较,显著差异表达基因1635个,其中上调差异表达基因1236个,下调差异表达基因399个;SC2组与NC组比较,显著差异表达基因2872个,其中上调差异表达基因2233个,下调差异表达基因639个(P<0.05)。按GO功能和KEGG信号通路聚类分析显示差异表达基因在白介素分泌、干扰素反应、T细胞受体信号通路及维生素和脂肪消化吸收等途径的富集度在两个芫根组中均居于前20位(P<0.01),肠黏膜趋化因子CCL20和巨噬细胞极化标志物CD274等免疫蛋白编码基因差异表达显著且同属于上述多个免疫通路。结论 芫根灌胃小鼠小肠的差异表达基因在白介素分泌、干扰素反应、T细胞受体信号通路、营养物质消化吸收等途径高度富集,提示芫根对肠道免疫系统及肠黏膜功能的调节,其中CD274的表达上调和CCL20的表达下调提示诱导M1型巨噬细胞极化和T细胞活化可能是芫根调控免疫和维护肠道正常结构功能的重要途径。 相似文献
3.
《浙江中西医结合杂志》2022,(1)
浙江省中西医结合医院儿科创建于1950年,是杭州市乃至全省具有影响力、中西医结合特色明显的小儿专科。其中中医儿科学已列入"十三五"浙江省中医药(中西医结合)重点学科建设计划和"十三五"浙江省中医药(中西医结合)重点专科建设计划。目前是杭州市医学重点学科,杭州市中西医结合学会、杭州市中医药学会儿科专业委员会主任委员单位,中华中医药学会儿童肺炎联盟成员单位。2019年被确定为"浙江省儿童呼吸病中医药防治中心"。本中心以小儿呼吸系统疾病为重点研究方向,且不断优化名中医经验方,研制多种院内自制制剂,治疗儿童常见呼吸系统疾病,尤其对支气管哮喘、慢性咳嗽、变异性鼻炎等疾病效果显著。 相似文献
4.
肾脏是人体最重要的排泄器官。肾单元近端小管细胞具有多种药物转运体和代谢酶,在药物及其代谢物处置中发挥关键作用。近端小管细胞中主要转运体包括有机阴离子转运体、有机阳离子转运体、有机阳离子/肉毒碱转运体、多药及毒素外排转运蛋白、P-糖蛋白、乳腺癌耐药蛋白和多药耐药相关蛋白;主要代谢酶包括细胞色素P450酶,UDP-葡萄糖醛酸基转移酶、磺酸基转移酶、谷胱甘肽S-转移酶。肾脏转运体和/或代谢酶介导药物相互作用(DDIs)是临床关注的重要问题。肾脏转运体和代谢酶存在密切协作关系,在肾脏也存在多种相互作用现象(包括转运-转运相互作用,代谢-代谢相互作用和转运-代谢相互作用),其显著影响药物肾脏处置、临床疗效和肾毒性。本文系统阐述了这些相互作用对药物及其代谢物的肾脏排泄、药动学、DDIs和肾毒性的影响。今后需要进一步阐明肾脏转运-代谢相互作用机制,将有助于研究体内药物肾脏处置和DDIs,促进临床合理用药。 相似文献
5.
摘要 目的 研究疫情常态化防控下的医院环境卫生学监测信息化。方法 利用医院网络平台和相关法规标准,开发医院环境卫生学监测信息系统,探讨信息化系统对监测质量的影响。结果 环境卫生学监测信息系统上线后,实现了线上数据统计分析和管理。应用信息化系统后,医院环境卫生学监测合格率由使用前的95.63%升高至98.75%,复查及时率由使用前的48.04%升高至93.33%,报告差错率由使用前的7.50%下降到0.21%。结论 该医院结合疫情防控特点,充分利用信息化系统,提高医院环境卫生学监测质量。 相似文献
6.
“钉钉”线上教学是基于教育部门引领下的“互联网+教育”新模式,具有其他线上教学方式所没有的独特优势。全球新冠肺炎疫情背景下,安徽医科大学针对来华留学生开展了“钉钉”课堂线上教学实践。本文从“钉钉”课堂在留学生人体寄生虫学课程教学中的实践着手,总结“钉钉”课堂的优势及问题,提出线上教学建议,以期为来华留学生人体寄生虫学课程线上教学提供参考。 相似文献
7.
目的:探讨基于乳腺X线摄影的影像组学在乳腺肿块和钙化良恶性鉴别中的应用价值,并将结果与有经验的放射科医生相对比。方法:回顾性收集本院PACS系统中2014年5月1日-2020年3月1日诊断性乳腺X线图像,根据纳入和排除标准筛选出边界清晰的乳腺肿块性病变患者188例(316幅X线图像)和钙化性病变患者215例(364幅X线图像),训练集与测试集比例分别为222:94和256:108,良恶性病变比例约1:1。先采用深度学习的自动分割模型获取肿块和钙化区域ROI,再利用影像组学技术建立良恶性分类模型,计算模型预测病灶良恶性的曲线下面积(AUC),准确性(ACC),敏感度(SEN)和特异度(SPE),并且与有经验的放射科医师对比。结果:乳腺肿块影像组学良恶性分类模型的AUC、ACC、SPE、SEN分别为0.84、0.80、0.89、0.73,乳腺钙化影像组学良恶性分类模型的AUC、ACC、SPE、SEN分别为0.88、0.85、0.87、0.84,放射科医生鉴别乳腺肿块良恶性的ACC、SPE、SEN分别为0.80、0.88、0.76,放射科医生鉴别乳腺钙化良恶性ACC、SPE、SEN分别为0.... 相似文献
8.
【摘要】目的:探讨基于磁共振小肠造影对比增强序列的影像组学分析对小肠克罗恩病活动性炎症的诊断效能。方法:回顾性分析了82例末端回肠受累克罗恩病患者的磁共振小肠造影及临床资料,患者以磁共振活动指数(MaRIA)为参照标准分为无-轻度活动组和中-重度活动组,使用ITK-SNAP对磁共振小肠造影延迟增强图像上的感兴趣区进行勾画,运用PyRadiomics软件对感兴趣区进行特征提取,之后使用FeAture Explorer Pro将提取的特征按7:3比例随机分为训练集和测试集(训练集58例,31/27=阳性/阴性;测试集24例,13/11=阳性/阴性),并进行特征降维及建模。将建立的影像组学模型应用到测试集中进行验证。最后采用受试者操作特征曲线评估影像组学模型对克罗恩病活动性炎症的诊断效能。结果:从磁共振小肠造影延迟增强图像中共提取出374个特征,经过特征降维、筛选后,最终3个特征被纳入到影像组学模型中,克罗恩病活动性炎症影像组学模型为:1.248×wavelet -HLL _firstorder _Kurtosis + 0.717×wavelet-LLL_ first order_90Percentile + 1.116×wavelet-LLL_ glcm_JointAverage。训练集结果显示影像组学模型区分无-轻度活动性及中-重度活动性的曲线下面积(AUC)为0.953(95%CI:0.8949~0.9938),敏感度90.3%,特异度88.9%,测试集的影像组学模型的AUC为0.881(95%CI:0.7109~0.9926),敏感度84.6%,特异度81.2%。结论:基于磁共振小肠造影对比增强图像的影像组学模型对克罗恩病小肠活动性炎症具有较高的诊断效能。 相似文献
9.
目的:分析代谢正常型肥胖(MHO)和代谢异常型肥胖(MUO)儿童心血管危险因素的差异,观察有氧运动对不同肥胖亚型儿童心血管危险因素的影响。方法:选取全封闭减肥夏令营肥胖儿童75名,平均年龄12.79±1.74岁,平均体重73.32±17.94 kg。实验前测试受试者的身体形态学指标、安静血压、安静心率、空腹血糖、胰岛素及血脂四项的基础值,分为MHO组(n=43)和MUO组(n=32)。对两组受试者进行为期4周的有氧运动干预,以心率作为运动强度的监控指标,目标心率为安静心率加储备心率的20%~40%,运动方式选择游泳、慢跑、快走等。干预结束后再测试上述指标,比较干预前后组间的差异和组内指标的变化。结果:(1)干预前,MUO组儿童的身体质量指数(BMI)、腰围(WC)、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、甘油三酯(TG)、动脉粥样硬化指数(AI)、非高密度脂蛋白胆固醇(nonHDL-C)高于MHO组(P<0.01),腰围身高比(WHtR)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、空腹胰岛素(FINS)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)高于MHO组(P<0.05);胰... 相似文献
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